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| 1 | 中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析显示文摘【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种的遗传基础窄于杂交陆地棉。【结论】核心引物组合法相比特征谱带法更适用于构建中国棉花主栽品种DNA指纹图谱,品种间的亲缘关系与地理来源有一定的相关性。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 | 2011 | 中国农业科学2011，44，1： | 126 |
| 2 | 玉米通用SSR核心引物筛选及高通量多重PCR复合扩增体系建立显示文摘利用国内15个代表性自交系及15个来自国家区域试验的玉米杂交种进行实验室复筛,并对玉米数据库MaizeGDB上已公布的1900个玉米SSR(simple sequence repeats)引物进行文献初筛,确定了500个高多态性引物,建立了玉米高多态性引物遗传图谱;并按照在玉米全基因组均匀分布的原则,从每条染色体上选取10个引物,累计100个,作为一套通用的SSR核心引物,推荐供今后一般研究优先选用.对这套核心引物按照统一的标准进行重新设计并构建基于毛细管五色荧光检测系统的高通量多重PCR复合扩增体系,已经建立了两套10重PCR组合,每套组合均由每条染色体上选取1个引物,累计10个构成. | 王凤格 赵久然 戴景瑞 易红梅 匡猛 孙艳美 于新艳 郭景伦 王璐 | 2006 | 科学通报2006，51，23： | 57 |
| 3 | 水分胁迫对棉花种子萌发的影响显示文摘采用不同浓度的PEG(聚乙二醇6000)溶液模拟土壤自然水势,对棉花种子萌发进行人工水分胁迫试验。结果表明,随着水势的下降,发芽率、发芽速度、发芽指数、苗高、根长、根茎比、幼苗干、鲜重等都出现不同程度的降低。发芽率和根茎比的降低在轻度水分胁迫(10%)下不明显,随PEG浓度上升到15%以上时,上述指标均受到强烈抑制。 | 王延琴 杨伟华 许红霞 周大云 冯新爱 匡猛 | 2009 | 棉花学报2009，21，1： | 32 |
| 4 | 分子标记技术在棉花品种鉴定上的研究进展显示文摘DNA指纹技术的发展大体分为三个阶段:第一代的分子标记是以Southern杂交为基础的RFLP,第二代分子标记是以PCR为基础的各种DNA指纹标记,第三代分子标记是以单核苷酸多态性为基础的SNP。本文概述了品种鉴定技术的研究与应用进展,重点介绍了用于棉花品种鉴定的四种主要的分子标记技术:RFLP、RAPD、AFLP和SSR,对每一种分子标记的技术原理、在棉花品种鉴定上的应用研究状况及存在的优缺点进行了具体阐述。通过比较分析,提出了SSR标记适用于棉花品种鉴定的独特优越性。并对基于SSR分子标记技术构建我国棉花品种DNA指纹库的重要意义与必要性进行了分析。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 王俊芳 | 2009 | 棉花学报2009，21，4： | 33 |
| 5 | 单粒棉花种子DNA快速提取方法显示文摘本研究以棉花干种子为材料,探索一种适用棉花品种SSR分析的DNA快速提取方法。先采用SDS提取液进行一步裂解,并将RNA的去除操作融入抽提过程,从而简单快速的获得高质量棉种基因组DNA。紫外检测与琼脂糖凝胶电泳检测结果均表明,所得DNA纯度高,完整性好。另外,SSR分析结果也显示,扩增带型清晰易辨,重复性与稳定性好。相比常规的以棉花幼苗叶片为材料的DNA提取法,本方法在降低实验成本的同时大大提高了工作效率。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 | 2010 | 分子植物育种2010，8，4： | 33 |
| 6 | 棉花杂交种纯度的SSR标记检测及其与田间表型鉴定的相关性显示文摘以分布于棉花26条染色体的36对SSR核心引物,在6份成套中棉所系列杂交种间筛选双亲互补型杂合位点作为纯度检测标记,采用单位点平均法与双位点差异法统计SSR标记检测结果;在棉铃期考察棉花株型、铃形、叶形、花及茎等性状,比对田间表型与分子检测结果,分析相关性。结果表明,34对核心引物在6个杂交种上获得101个杂合位点,平均每个杂交种具有16.8个。田间表型鉴定结果高于分子标记检测结果,单位点平均法的相关性高于双位点差异法,校正后的相关性进一步提高,相关系数r=0.7841,呈高度相关。EST-SSR标记的检测结果与田间表型鉴定结果的相关性显著高于Genomic-SSR标记。相同染色体上的不同引物检测结果差异较小。不同的统计方法与标记类型获得的分子标记检测结果差异较大。高度纯合的亲本将会有效提高分子标记鉴定结果与表型鉴定结果的相关性。 | 匡猛 杨伟华 张玉翠 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅 周红 | 2011 | 作物学报2011，37，12： | 26 |
| 7 | 32个棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析显示文摘以我国2010年32个主栽品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从95对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的40对引物,共扩增出161种多态性基因型,平均每对引物扩增出4.025种。引物多态信息量(PIC)0.2989~0.7585,平均为0.5407。11对引物在13个品种上有特征带型,最少利用5对引物就可以将32份材料完全区分开。利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明:长江流域棉区品种间遗传差异最大,黄河流域棉区次之,新疆棉区最小;常规种遗传基础较杂交种窄。 | 张玉翠 杨伟华 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅 | 2012 | 棉花学报2012，24，2： | 26 |
| 8 | 蒽酮比色法测定棉花成熟纤维中水溶性总糖含量显示文摘采用正交实验,对棉花成熟纤维中水溶性总糖的最佳提取条件进行了选择,得到最佳提取条件为:料液比1∶30,盐酸浓度5mol.L-1,水解时间30min,提取时间60min。并对蒽酮比色法测定总糖含量w的条件进行了研究,最佳条件为:测定波长625nm,显色剂用量9mL,沸水浴中加热9min。对棉花成熟纤维样品进行测定,实验表明:葡萄糖标准溶液在0~10mg.mL-1浓度范围内,吸光度(A)与葡萄糖浓度(C)的线性关系较好,线性回归方程为A=0.0401C+0.0036(r=0.9994),变异系数为1.8%,平均回收率为99.15%。该方法准确度、精密度较好,可用于成熟棉花纤维中低含量水溶性总糖含量的测定。 | 郭玉华 杨伟华 郁有祝 许红霞 王延琴 周大云 匡猛 | 2011 | 中国棉花2011，38，12： | 24 |
| 9 | 棉花DUS测试标准品种的SSR指纹数据库构建显示文摘基于SSR核心引物,采用荧光毛细管电泳检测系统与多重PCR技术相结合,构建我国棉花DUS(Dis-tincmess,Uniformity and Stability)测试标准品种的DNA指纹数据库并进行遗传多样性分析。依据多重PCR组合的基本原则与五色荧光检测系统的特点,采用40对核心引物构建了10个4重PCR组合.利用DNA遗传分析仪进行指纹检测与数据采集。40对荧光引物在30份DUS测试标准品种中共扩增产生146个等位变异.每对引物的等位变异数为2~7个不等,平均每对引物产生3.65个等位变异。海7124与陆地棉品种明显划分为2类,来源于新疆的新陆早1号区别于其他陆地棉品种,单独聚为1类。多色荧光检测系统相比常规聚丙烯酰胺凝胶电泳具有高精度、高通量、自动化程度高的优点,尤其适用于大规模指纹数据库的构建.提出了通过构建已知品种DNA指纹数据库,将分子标记技术应用于棉花DUS测试的初步设想。 | 匡猛 王延琴 周大云 方丹 马磊 杨伟华 | 2015 | 棉花学报2015，27，1： | 23 |
| 10 | 基于单拷贝SNP标记的棉花杂交种纯度高通量检测技术显示文摘利用有代表性的材料进行SNP位点的全基因组扫描分析与综合评估,基于KASP技术开发1套适用于我国棉花杂交种纯度高通量检测的核心SNP组合。从63K的棉花全基因组芯片中筛选获得具有单拷贝特性的SNP标记分别为5474个(中棉所TM-1基因组版本)和1850个(南京农大TM-1基因组版本)。根据芯片扫描分析结果,权衡考虑位点多态性、分型效果、纯合率与杂合率等因素,最终从每条染色体上优选1个杂交种杂合率高且分型效果理想的核心SNP位点,合计26个。采用KrakenTM软件将SNP位点转化成KASP标记,利用SNPline平台进行SNP分型检测,实现了对大量样品的高通量基因分型,尤其适用于品种纯度快速检测,为SNP标记技术在棉花品种鉴定及指纹数据库构建等方面的应用奠定基础。 | 匡猛 王延琴 周大云 马磊 方丹 徐双娇 杨伟华 魏守军 马峙英 | 2016 | 棉花学报2016，28，3： | 22 |
| 11 | 中国棉花生产中存在的主要问题及建议显示文摘2003—2007年完成了农业部连续5年的全国棉花质量安全普查工作,在三大主产棉区选取546个基点进行了棉花生产状况调查,同时抽取2201份棉花样品进行纤维质量检测,结果表明:中国的棉花质量与美国大体相当,在中国的棉花生产中存在着生产规模小、品种多乱杂、种植方式和管理水平各不相同、有毒有害物质使用量偏高、收购与经营市场混乱和年度生产波动性大等六大问题,并提出了加强育种研究、完善宏观调控、实行区划种植、规范栽培技术、加强收购管理等几点改进建议,以确保棉花生产的优质高效,农民能增产增收。 | 王延琴 杨伟华 许红霞 周大云 冯新爱 匡猛 | 2009 | 中国农学通报2009，25，14： | 21 |
| 12 | 中国棉花主栽品种DNA指纹数据库初步构建研究显示文摘基于多重PCR(Polymerase chain reaction)与毛细管五色荧光检测系统,利用36对核心引物构建了138份棉花主栽品种DNA指纹数据库,采用棉花DNA指纹数据库软件管理系统进行数据统计与分析。36对引物在138份材料中共扩增出143个多态性等位位点,每对引物的等位位点数为2~8个,平均每对引物扩增出3.97个多态性等位位点。抽查的101个主栽品种仅45.6%的位点完全纯合,中棉所系列品种61.6%的位点完全纯合。存在5种非纯合位点表现形式,以2种基因型混杂所占比例最大,其中以5∶1的混杂类型最多。4种类型的同名品种指纹比对分析表明,品种内的遗传变异度均在0~2个差异位点。初步建立了高通量的棉花DNA指纹检测与数据分析平台,提出了不同品种间的差异判别标准。 | 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 张玉翠 王飞 苏畅 | 2012 | 棉花学报2012，24，3： | 19 |
| 13 | “十一五”期间我国审定棉花品种纤维品质分析显示文摘'十一五'期间我国通过国家和省级审定的棉花品种(杂交种)达600多个,其中白色陆地棉品种(杂交种)的纤维长度主要分布在29~30 mm,长度整齐度指数主要集中在84%~85%,断裂比强度主要在28~30cN.tex-1,麦克隆值则多在4.3以上。90%以上的品种(杂交种)符合优质棉品质的要求。前3项指标优于美国现行推广品种,但麦克隆值却明显偏高。对纤维品质的主要分布特点、转基因与杂交种情况、品种多乱杂、品质区划等问题进行了讨论并提出一些对策建议。 | 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 匡猛 冯新爱 | 2012 | 棉花学报2012，24，5： | 17 |
| 14 | 我国棉花生产成本与收益调查及分析显示文摘通过2006-2008年对棉花主产区的调查,明确了我国棉花生产成本与收益的状况,分析了各项成本占总成本的比例及其影响因素,分析了植棉效益较低的原因,提出了我国棉花生产健康发展的对策。 | 王延琴 杨伟华 许红霞 周大云 匡猛 冯新爱 | 2010 | 中国棉花2010，37，11： | 16 |
| 15 | 7个棉花品种SSR位点纯合度研究与分析显示文摘采用52对核心引物对7个棉花常规种进行了SSR分析。结果显示:每个品种的24个受检单粒棉种中,杂粒数最多为9个,最少1个,平均为3.9个;DNA位点纯合率最高为100%,最低92.3%,平均为97.0%。研究表明,品种纯度与DNA位点纯合率呈高度正相关。采用SSR标记进行分子检测,能准确区分因遗传因素与生产加工对品种纯度造成的影响。 | 王飞 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 方丹 邢要非 杨伟华 | 2013 | 棉花学报2013，25，3： | 15 |
| 16 | 冬小麦春化研究进展显示文摘春化作用是某些高等植物成花转变的重要环节,被认为是植物在低温诱导下促使其相关基因的表达,从而导致生理状态转变的一种遗传控制的生理过程。综述了近60多年来有关冬小麦春化的生态、生理生化及分子生物学的研究及最新进展。重点介绍了冬小麦春化生理生化研究历史及现状,并对春化本质进行了探讨。 | 匡猛 邢国风 | 2005 | 西南科技大学学报2005，20，3： | 13 |
| 17 | 利用CottonSNP63K芯片构建棉花品种的指纹图谱显示文摘【目的】利用SNP位点的单拷贝特性,结合陆地棉TM-1参考基因组序列信息,筛选基因组特异的SNP。【方法】以719份遗传背景来源广泛的陆地棉种质资源为材料,采用Illumina公司开发的Cotton SNP63K芯片,利用Genome Studio软件对芯片扫描所获得原始数据进行基因型数据质量控制,获得待测样品SNP位点的基因型数据。根据已公布的陆地棉TM-1基因组的两个版本——中国农业科学院棉花研究所版本Gossypium hirsutum(AD1)genome BGI v1.0与南京农业大学版本G.hirsutum(AD1)genome NBI v1.1为参考序列,对Cotton SNP63K芯片(63 058个SNP)各位点的侧翼序列分别进行全基因组Blast比对分析,以筛选具有单拷贝特性的特异SNP位点并用于样品指纹图谱的构建。【结果】利用Cotton SNP63K芯片对719份材料进行SNP位点基因分型,主要表现为无检出信号的SNP位点、无多态性的SNP位点、具有多态性的SNP位点,而具有多态性的SNP位点的分型结果又可分为单位点SNP(基因组特异SNP)、双位点SNP和多位点SNP。通过对两个已公布的陆地棉TM-1参考基因组序列Blast比对结果表明,中国农业科学院棉花研究所TM-1基因组版本比对获得基因组特异SNP标记为5 474个,而南京农业大学TM-1基因组版本比对获得基因组特异SNP标记仅为1 850个,两者共有的特异SNP为1 594个,进一步通过分型效果、检出率及多态性3个评价指标,筛选score值≥0.7,call frequency值≥0.95,且MAF值≥0.2的SNP位点,获得471个分型效果理想,检出率高且多态性较高的特异SNP位点。在471个SNP位点中,430个位于染色体上,41个位于scaffold片段上。考虑到标记间的连锁程度,剔除连锁标记37个,最终获得393个核心SNP位点。利用393个核心SNP构建了719份品种资源的特征DNA指纹图谱,除个别材料之间遗传背景高度相似、基因型完全一致外,97%的材料均能实现准确有效的鉴别。【结论】筛选出393个基因组特异的SNP,并利用这些核心SNP构建了719份资源材料的特征DNA指纹图谱,为SNP分子标记应用于棉花重要性状遗传改良提供了参考。 | 孙正文 匡猛 马峙英 王省芬 | 2017 | 中国农业科学2017，50，24： | 12 |
| 18 | SSR标记及其在玉米研究中的应用显示文摘概述了SSR反应的原理、特点,总结了其在玉米亲缘关系和遗传多样性研究、DNA指纹库建立、遗传图谱构建和基因定位及分子标记辅助育种等方面的应用,并对SSR在植物遗传领域的应用前景进行了探讨。 | 于新艳 王凤格 赵久然 王玺 匡猛 | 2007 | 安徽农业科学2007，35，7： | 12 |
| 19 | 新育种方法在中棉所49选育中的应用显示文摘为提高杂交组合配制的准确性,加快棉花优异种质的创育,建立了选用优良异缘亲本并结合优势组合的大群体在多生态交叉环境下进行筛选的育种方法。事实证明,应用该方法克服了选配组合的随机性和盲目性,使育种目标更明确,选配组合更精确,加快棉花品种的选育进程,提高育种效率,为棉花育种提供了较丰富的遗传变异基础材料,同时对棉花育种的理论和实践有重要意义。本文以中棉所49的选育过程为例对该育种方法进行介绍。 | 王宁 黄群 匡猛 杨杰 苏桂兰 许庆华 周红 严根土 | 2015 | 中国棉花2015，42，4： | 11 |
| 20 | 棉花秸秆超声波碱预处理研究显示文摘为了缓解能源危机,充分利用棉花秸秆制备燃料乙醇,采用超声波辅助碱处理方法对棉花秸秆进行预处理。通过单因素试验和Box-Behnken试验,分析超声波辅助碱预处理因素对处理效果的影响规律,建立预处理时间、氢氧化钠浓度、液固比与纤维素、木质素含量之间的回归关系,据以优化工艺条件。结果表明,所建回归模型显著,具有预测意义。各因素对棉花秸秆预处理效果影响主次顺序为处理时间>氢氧化钠浓度>液固比,超声波辅助碱预处理棉花秸秆的优化条件为超声波功率420W、氢氧化钠浓度3.5%、处理时间90min、液固比21:1,处理后秸秆中纤维素含量达58.02%,比原秸秆提高了45.60%。处理前后棉花秸秆结构SEM观察,显示超声波辅助碱预处理可以溶出大量半纤维素和部分木质素,并且有效打破木质纤维素的结晶结构,具有显著效果。 | 王华 许红霞 周大云 王延琴 匡猛 杜双奎 杨伟华 | 2013 | 农业环境科学学报2013，32，2： | 10 |
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