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1改良CTAB法提取高质量香蕉叶片总RNA显示文摘以巴西香蕉叶片为试验材料,采用改良CTAB法提纯香蕉叶片总RNA。结果表明,改良CTAB法提取的香蕉叶片总RNA的28S、18SrDNA条带清晰、整齐,A260/A280值大于2.0,无需任何纯化处理即可用作香蕉MuACTIN基因的扩增模板,经RT-PCR扩增获得了带型清晰的目的条带,说明利用此法分离的RNA纯度和浓度符合RT-PCR的要求;而CTAB法提取的总RNA产量较低,且纯度不高。说明改良CTAB法能有效从富含多酚和多糖的香蕉叶片中提取高质量的总RNA。淦国英 漆艳香 蒲金基 张欣 谢艺贤 2009广东农业科学2009,36,7:23
2香蕉果实软化相关β-半乳糖苷酶基因的克隆及其表达分析(英文)显示文摘β-半乳糖苷酶(β-galactosidase)通过分解细胞壁半纤维素切除半乳糖键而参与果实软化。为了阐明香蕉(Musasp.)果实成熟过程中的软化与细胞壁代谢酶β-半乳糖苷酶基因表达之间的关系,采用RT-PCR方法,从成熟香蕉果实果肉中分离了编码β-半乳糖苷酶基因的部分cDNA(MA-Gal),序列分析表明,MA-Gal包含927bp,编码309个氨基酸,包含5 个β-半乳糖苷酶结构域(典型真核生物中β-半乳糖苷酶包含7 个结构域),推导的MA-Gal 蛋白质中有β-半乳糖苷酶蛋白的催化活性部位GGPIILSQIENEY(F);系统进化树分析结果表明MA-Gal属于第一类β-半乳糖苷酶基因(该类主要在果实中表达);β-半乳糖苷酶活性和硬度的变化表明其与香蕉果实硬度变化密切相关;Northern 分析显示,跃变前期的果肉中,MA-Gal 基因的表达量很低,后随着果实的软化表达量不断增加,并在呼吸跃变后达到最高。所有结果表明,MA-Gal 参与香蕉果实成熟过程中的软化。庄军平 苏菁 李雪萍 陈维信 2006植物生理与分子生物学学报2006,32,4:17
3一种适用于木本植物RNA提取的方法显示文摘木本植物富含酚类、多糖等代谢物质,用普通方法提取RNA时很难将其除去。选取杜仲叶片做材料,通过比较研究Trizol、改良CTAB法和热硼酸盐法三种RNA提取方法,发现改良CTAB法提取效果好且简单易行,单位鲜重材料获得的RNA产量高,电泳条带清晰完整,OD260/OD280=1.84,是一种适于木本植物RNA提取的方法。李晓毓 赵德刚 李丰伯 2007安徽农学通报2007,13,23:16
4大戟甲羟戊酸途径关键酶基因hmgr的克隆与分析显示文摘通过比较6种植物8条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因同源区域,设计简并引物,利用RT-PCR技术成功地从大戟(Euphorbia pekinensis)叶中扩增出458bp的基因片段。通过BlastP比较,所推断的大戟HMGR蛋白序列与杜仲Eucommia ulmoides(AAV54051)、穿心莲Andrographis paniculata(AAP14352)、胡黄连Picrorhiza kurrooa(ABC74565)、橡胶树Hevea brasiliensis(AAU08214)、海岛棉Gossypium barba-dense(ABC71314)、龙胆草Gentiana lutea(BAE92730)的一致性分别达到90%、86%、86%、92%、87%和88%。蛋白质保守区、特征区以及进化树分析,初步证实该基因为hmgr基因,这是首次报道从药用植物大戟中克隆到甲羟戊酸途径关键酶HMGR的基因片段。曹小迎 蒋继宏 刘群 戴传超 陈凤美 2007武汉植物学研究2007,25,2:11
5一种改进的多浆旱生植物霸王叶和根总RNA提取方法显示文摘针对多浆旱生植物霸王富含多酚和多糖类物质的特点,在常规异硫氰酸胍方法的基础上进行改进,摸索出一种霸王叶和根总RNA提取的方法。本方法主要通过在提取缓冲液中加入4%β-巯基乙醇以去除多酚物质的干扰;用2mol/L醋酸钠(pH4.0)、水饱和酚和氯仿:异戊醇(24:1)抽提以去除多糖和蛋白物质。采用该方法提取的霸王总RNA纯度高、完整性好,电泳条带清晰,OD260/OD280值在1.8 ̄2.0之间,其质量完全可以满足进一步分子生物学研究的要求。伍国强 席杰军 周向睿 马清 王锁民 2008分子植物育种2008,6,1:11
6高质量提取银杏种仁总RNA的改良方法显示文摘提取高质量的RNA是获取银杏(Ginkgo bilobaL.)种仁药用蛋白基因以及从基因表达水平研究林木良种银杏种子发育和后熟的必要条件。现有提取方法难以获得高纯度的银杏种仁总RNA。旨在改良现有提取方法,以满足抽提富含蛋白质、多糖、多酚等特殊材料高质量RNA的需要。文中将改进的CTAB法和Trizol一步法相结合,优化了试剂组合并改进实验细节,从银杏种仁中获得了高质量的总RNA。通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计检测,提取的总RNA具有清晰的28SrRNA、18SrRNA条带,亮度满足2:1比例关系。OD260/OD280比值在1.85~2.00之间。将提取的总RNA用于Northern杂交分析可检测到清晰的信号,而用于RT-PCR和5'-RACE也可获得清晰的目的条带。说明这种方法获得的总RNA完整度和纯度很高,完全可以满足下游分子生物学实验要求。王亚红 刘缙 王玉国 2010中国农学通报2010,26,15:11
7红麻叶片高质量RNA提取方法比较分析显示文摘红麻叶片中富含多糖、多酚和其他次生代谢物质,影响其RNA的产量和质量.本研究应用CTAB法、热硼酸法、SDS法、Trizol法和商品化试剂盒5种方法提取福红992幼嫩叶片总RNA,并对各方法提取效果进行比较.结果表明,热硼酸法效果最佳,其次是CTAB法和SDS法,而Trizol法、试剂盒提取效果不理想.采用热硼酸法提取的红麻叶片总RNA能够成功进行反转录和制备cDNA.陈美霞 陈富成 颜克伟 刘晓倩 徐建堂 陶爱芬 祁建民 2011福建农林大学学报(自然科学版)2011,40,6:10
8Trizol法提取厚皮甜瓜果实RNA条件的筛选显示文摘采用改良的Trizol法提取厚皮甜瓜‘银帝’果实中的RNA.利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和RT-PCR法进行纯度、浓度和RNA完整性检测.结果表明:1 mL Trizol用于提取200 mg甜瓜果实量时,得到的RNA产量最大,氯仿抽提2次时提取到的RNA的A260/A280在1.9-2.0之间,所提取的RNA无蛋白质和DNA污染,室温沉淀和低温沉淀对RNA的产量无明显影响.将提取的RNA反转录后扩增β-actin基因片段,扩增的条带与设计大小一致,验证了该方法提取的RNA可用于RT-PCR.赵继荣 毕阳 刘红霞 高雄杰 2009甘肃农业大学学报2009,44,2:10
9高质量的小麦种子总RNA的快速提取方法显示文摘提取高质量的RNA是从基因表达水平上研究小麦种子发育的必要条件。现有提取方法难以快速得到高纯度的小麦种子总RNA。本试验将冷酚法和Trizol一步法相结合,在5h左右就可得到高质量的总RNA。通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计检测,提取的总RNA具有清晰的28SrRNA、18SrRNA条带,OD260/DO280比值在1.90~2.00之间。将提取的总RNA用于反转录,可获得高质量的cDNA,在cDNA-AFLP分析上可得到清晰的条带。说明这种方法获得的总RNA纯度和完整度非常高,完全满足分子生物学研究的要求。李浩 张平平 查向东 何中虎 夏先春 2006分子植物育种2006,4,6:10
10果树果实总RNA提取方法的改良研究显示文摘植物总RNA的提取尽管已成为一种常规的技术,但由于果树果实材料的特殊性,其RNA的提取至今没有一种比较理想的技术和方法。本研究在以往CTAB方法的基础上,对其进行改良以探讨一种适于果实总RNA提取的通用方法,从而为果实分子生物学研究奠定基础。研究结果表明,在提取缓冲液中加入PVP和β-巯基乙醇,使其终浓度分别为16%和3%,在匀浆上清液中加入1/3体积5 mol/L KAC(pH4.8),可有效地提高RNA提取的质量。利用改良后的CTAB法成功地从苹果、桃、草莓和葡萄果实中提取出总RNA。经过紫外、电泳、反转录分析结果表明,该改良的CTAB法是一种适合果实总RNA提取的首选方法。朱晓琴 金晓磊 冯永庆 沈元月 2008北京农学院学报2008,23,2:9
11野生香蕉叶片总RNA提取方法研究显示文摘采用TRIZOL试剂盒法、RNAsio试剂法和改良CTAB法提取香蕉叶片总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取的RNA样品的质量。研究结果表明:改良CTAB法提取的RNA具有28SrRNA和18SrRNA两条清晰的条带,OD260/OD280在1.80~1.95之间,OD260/OD230在1.75~2.10之间,具有较高的纯度;其他两种方法获得的RNA纯度不够,降解严重。将提取的RNA分别逆转录成cDNA,经RT-PCR扩增,只有改良CTAB法出现清晰的条带,进一步证明改良CTAB法提取的RNA具有很高的纯度,可以满足进一步分子生物学研究的要求。张妙霞 赖钟雄 赵巧阳 2009中国农学通报2009,25,14:9
12罗汉果果实RNA的提取及SgDHAR基因的克隆与表达显示文摘针对罗汉果果实富含酚类、多糖、油脂和蛋白质等特点,从3种常用的RNA提取方法中优选出改良Trizol法,应用该法得到的RNA纯度高(OD260/280=2.01;OD260/230=2.02)、完整性好(RIN=9.50)、得率高(260μg·g-1)。以该法提取的RNA为模板,通过RACE和RT-PCR技术克隆罗汉果脱氢抗坏血酸还原酶基因全长,其长度为1 252 bp,开放阅读框(ORF)为819 bp,命名为SgDHAR,GenBank登录号为KC907731,编码一条272个氨基酸的肽链,理论分子量为30.217 7 kD,等电点为8.76。该蛋白与GenBank中已登录的DHAR序列比对显示与黄瓜同源性最高(87%)。应用实时荧光定量PCR对SgDHAR在罗汉果不同组织及不同倍性中的表达模式分析发现,该基因主要在果实和茎中表达,其次是花,根中的表达量最低;在三倍体中的表达量为二倍体的6.83倍,推测该基因可能参与了三倍体无籽罗汉果的败育过程。韦荣昌 赵欢 马小军 密克 莫长明 潘丽梅 白隆华 唐其 2014药学学报2014,49,1:9
13几种果实总RNA提取方法的评价显示文摘RNA的提取是分子生物学的基本内容之一,高质量的RNA是进行基因克隆、基因表达等研究的必要前提。针对果实中多酚、多糖和次生代谢产物等含量较高的特点,综述了试剂盒法、热硼酸法、异硫氰酸胍法、十二烷基硫磺酸钠法、十六烷基三甲基溴化铵法及其改进方法的原理、特点和在果实RNA提取上的应用,并对不同的提取方法进行了比较。陈弟 符贤英 殷晓敏 张荣意 2007广东农业科学2007,34,11:8
14桑椹总RNA抽提方法的比较显示文摘为对比CTAB改良法、E.Z.N.A.TM总RNA抽提试剂盒Ⅱ、EZ-10柱式总RNA抽提试剂盒和异硫氰酸胍法4种方法抽提桑椹总RNA的效果,对该4种方法抽提后的总RNA进行纯度、得率和完整性检测以及进一步的RT-PCR检测。结果显示:CTAB改良法和E.Z.N.A.TM总RNA抽提试剂盒Ⅱ均适用于桑椹总RNA抽提,获得的总RNA纯度高、得率高、完整性好,完全可用于后续的分子生物学实验;但两者相比,CTAB改良法成本更低,操作更简单。周向红 易乐飞 王萍 2011食品科学2011,32,12:8
15甘蔗种质总RNA提取方法的研究显示文摘甘蔗是重要的糖料及能源作物之一。甘蔗种质RNA的提取是甘蔗分子生物学研究的前提。以成熟甘蔗的叶片为材料,通过对前人的植物RNA提取方法进行改良,寻求最佳的甘蔗总RNA提取方法。通过改良最后得到的异硫氰酸胍法Ⅲ具有成本低、操作简单、省时等特点。用该法提取得到的甘蔗总RNA经琼脂糖凝胶电泳可获得28S、18S和5SrRNA3条带,并且28SrRNA的亮度大于18SrRNA的亮度。表明该方法提取的RNA完整性好,纯度高。另外对所得部分甘蔗种质的总RNA进行RT-PCR检测,可特异扩增出目标片段,说明用异硫氰酸胍法Ⅲ提取的甘蔗种质总RNA,可以直接用于后续的分子生物学试验。王英 羊玉花 邱海燕 尚珂 文稀 庄南生 2009中国农学通报2009,25,24:7
16桑叶片总RNA提取方法的比较研究显示文摘目的研究桑叶片总RNA的提取方法。方法采用Trizol法、CTAB法及RNA prep prue Plant Kit提取试剂盒提取法,分别提取桑叶片中的总RNA,并通过紫外光谱、琼脂糖凝胶电泳及RT-PCR对提取效果进行分析比较。结果3种方法均能从桑叶片中提取分离到总RNA,其中Trizol法能提取纯度较高、完整性较好的RNA,18S及28S带型清晰无弥散,A260/A280值为1.99,RNA产率为594.24μg/g,提取的总RNA适用于RT-PCR实验。结论用Trizol法提取的桑叶片中总RNA可用于cDNA基因文库的构建及基因表达的差异分析。王阿娜 裴瑾 刘薇 万德光 张祎楠 2012中成药2012,34,7:7
17角倍总RNA提取方法建立及ACTIN基因片段克隆显示文摘角倍总RNA的提取是研究角倍蚜虫瘿形成分子机制的基础。本研究针对其多酚、多糖含量高的特点,从各类试剂盒及常规方法改良中优选出CTAB(异丙醇)沉淀方法,较为简单、经济、有效地提取角倍总RNA,其得率可达60.16μg·(100 mg)-1。利用该方法提取的RNA,通过RT-PCR克隆肌动蛋白基因ACTIN片段,碱基序列长度为934 bp,编码311个氨基酸,该序列与GenBank中已登录的ACTIN基因序列比对显示与芒果同源性最高,相似性达到95%,与其它肌动蛋白的氨基酸序列同源性达到86%以上。角倍总RNA的提取及看家基因ACTIN的克隆可为盐肤木和其他蚜虫虫瘿的分子克隆及基因表达分析奠定基础。阮桢媛 陈晓鸣 杨子祥 2012林业科学研究2012,25,5:6
18一种快速提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法显示文摘在SDS法的基础上,以富含多糖、多酚等次生代谢物质的香蕉叶片为材料,通过选择性添加适量5 mol/L KAc(pH4.8)或不同体积无水乙醇分别提取香蕉叶片总核酸、总RNA(不含DNA)和总DNA(不含RNA)。结果表明:不添加KAc的可提取到总核酸;添加1/3体积和2/3体积的KAc得到总RNA,添加1/3体积无水乙醇处理得到总DNA。该结果获得一种简单、快速,能在1次实验中添加不同试剂提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法。柴娟 冯仁军 史后蕊 任梦云 王静毅 张银东 2014热带作物学报2014,35,1:6
19茅苍术HMGR基因保守区片段的克隆与分析显示文摘目的对茅苍术3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase,HMGR)进行基因克隆及序列分析。方法采用cDNA末端快速扩增技术,以茅苍术嫩叶总RNA的cDNA为模板扩增茅苍术HMGR基因的保守区片断。结果序列分析表明,所克隆的cDNA保守区序列长度为458bp,而且同时得到了两个核苷酸序列的同源性为84.28%的片段,相应的氨基酸序列的同源性为92.11%。分别命名为HMGRcr1,HMGR-cr2。推断这可能是该基因家族中的两个成员。而且同源序列比对发现,推断的HMGRcr1氨基酸序列和HMGRcr2氨基酸序列与其他植物都有较高的同源性。结论首次分离并报道了茅苍术HMGRcDNA克隆,为进一步研究萜类生物合成机制及其在提高植物药用价值方面提供理论依据。刘群 曹小迎 蒋继宏 戴传超 2007中草药2007,38,10:5
20富含多糖的甜瓜果肉中提取总RNA方法的比较研究显示文摘以甜瓜品种河套蜜瓜果肉为试验材料,比较了异硫氰酸胍法、CTAB法和SDS法3种RNA提取方法,结合KAc沉淀多糖和低浓度乙醇沉淀多糖2种去糖方法。结果表明:异硫氰酸胍法结合KAc沉淀多糖的去糖效果最佳,提取的RNA中28S亮度约为18S的2倍,且OD260/OD280值在1.8以上,RNA产率为64.48μg/g。经RT-PCR获得了乙烯受体基因etr1长达2.3 kb的cDNA特异性条带,说明异硫氰酸胍结合KAc沉淀多糖法从甜瓜果肉中提取的RNA质量好、产率较高、完整性好,适合于甜瓜进一步的分子生物学研究。郝金凤 哈斯阿古拉 2010北方园艺2010,,5:5
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