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1普洱茶渥堆发酵中嗜热真菌的分离和鉴定显示文摘应用传统的普洱熟茶渥堆方法进行发酵,研究分析普洱茶渥堆发酵过程中嗜热微生物的种类,应用测序技术对分离的微生物进行了鉴定。每天取样,进行微生物的分离、纯化及鉴定,并对分离出来的几种嗜热霉菌在不同温度、不同pH条件下培养,观察其生长情况。对普洱茶发酵过程中的微生物进行全面分析,运用分子生物学方法对分离的微生物进行鉴定。发现了普洱茶渥堆发酵过程中起重要作用的嗜热微生物,为揭示普洱茶高温发酵的机理奠定了基础。杨瑞娟 吕杰 严亮 杨柳霞 李晨晨 姜姝 盛军 2011茶叶科学2011,31,4:35
2rDNA ITS区序列分子标记技术在植物学研究中的应用显示文摘在植物学研究中,人们越来越多地采用核糖体DNA内转录间隔区(ITS)作为分子标记。本文对近10年来rDNA ITS序列在植物系统发育、分类与鉴定、种质资源以及病虫害的鉴定与防治中的应用等方面的研究进展进行了综述,并对ITS序列的应用前景进行了初步探讨。牛宪立 姬可平 吴群 吕国庆 2009生物信息学2009,7,4:23
3rDNA-ITS序列分析法与传统分类法相结合在真菌鉴定中的应用显示文摘采集了四川马尔康地区3种真菌,根据其形态学特征结合卯晓岚的《中国大型真菌》图谱,初步确定其疑似为黄菇、松乳菇、红菇3个种。为提高鉴定的准确性,通过构建基因池;用特异性引物进行PCR扩增,并对扩增产物进行测序;将测得的实验样品的序列在Gene Bank中进行BLAST比对;并与相似性较高的已知的种,利用DNAMAN、Clustalx1.83和MEGA5.0软件采用N-J法构建进化树,探寻他们与已知物种的相关关系。结果表明,三种疑似菌株扩增出的目的条带为500—750bp,J1、J2、J3号菌株分别与臭黄菇、松乳菇、红菇的序列相似度最高。并利用序列的相似性做出了它们各自的进化树。最终得出结论:J1号菌株为臭黄菇(Russula foetens),J2号菌株为松乳菇(Lactarius deliciosus),J3号菌株为红菇(Russula.)。利用r DNA-ITS序列分析法和形态学分类法相结合的方法鉴定菌种,不仅丰富了三种真菌的基因库,而且也克服了单纯的r DNA-ITS序列分析法因受基因库的完善程度、高度相似性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等限制而不能鉴定出所有真菌的缺点,提高了真菌分类鉴定中一些模糊性状的区分度。朱洪庆 王盼盼 张萌 陈嘉慧 丁祥 2016西华师范大学学报(自然科学版)2016,37,3:18
4果胶酶高产菌株EIM-6的筛选鉴定及其液体发酵产酶条件优化显示文摘通过筛选得到一株适合液体深层发酵培养的高产果胶酶菌株EIM-6,基于形态学与ITS序列分子系统进化分析,鉴定为Aspergillus niger.运用单因子实验确定EIM-6产果胶酶最适碳源和氮源.在此基础上,通过Plackett-Burrman设计对影响其产酶的相关因素进行评估并筛选出具有显著效应的3个因素.然后通过最陡爬坡实验在上升最高点处由中心组合实验和响应面分析确定其最适产酶条件.实验优化的最优产酶条件为:w(橘皮粉)4.09%,w(麸皮)3.16%,w((NH4)2SO4)0.35%,w(K2HPO4)0.3%,w(CaCO3)0.24%,初始pH 6,接种量107/mL,转速250 r/min,28℃培养80 h酶活达30 231 U/mL,与初始相比,酶活提高2.07倍.杨欣伟 林伟铃 田宝玉 柯崇榕 黄薇 黄建忠 2009福建师范大学学报(自然科学版)2009,25,2:16
5基于ITS基因文库法研究清香型大曲真菌群落结构显示文摘通过构建真菌ITS基因文库、测序和系统发育树分析,分别对汾酒清茬曲、后火曲和红心曲的真菌群落结构进行了比较。研究结果表明,汾酒大曲内的真菌全部分属于酵母目和毛霉菌目,且3种大曲的真菌群落结构存在明显差异,其中清茬曲的优势真菌为毕赤酵母属和根霉属(占全部克隆子的比例分别是66.7%和30%);后火曲的优势真菌为毕赤酵母属(占全部克隆子的比例是80.24%);红心曲的优势真菌为根霉属和横梗霉属(占全部克隆子的比例分别是38.89%和33.33%)。罗惠波 王彩虹 甄攀 王毅 叶光斌 2014酿酒科技2014,,5:15
6基于ITS序列分析对杏鲍菇菌种的鉴定显示文摘采用拮抗实验和ITS序列分析结合的方法,对供试的20株菌株进行了分析。ITS序列分析结果表明,供试菌种的ITS序列长度为624 bp,与GenBank数据库中杏鲍菇菌种的ITS序列相似度为99%以上,在种的水平上证明供试菌种为杏鲍菇,同时构建的系统发育树将供试菌种聚在了4个类群。李莹 李莉 刘艳玲 李剑梅 王艳华 2014微生物学杂志2014,34,1:13
7rDNA-ITS序列分析法和传统分类法对真菌进行分类鉴定显示文摘通过对四川马尔康地区采集到的三株菌株的子实体进行测定,分别以三株菌种的DNA为模板,利用特异性引物做PCR扩增并测序,测序结果在Gene Bank中进行BLAST比对,找到与之同源性较高的已知菌种,通过运用DNAMAN、MEGA7.0和Clustal X2软件选择N-J法和ML法构建进化树,确定三株菌株种属。再辅以传统的形态学方法结合《中国大型真菌》图谱对菌株进行鉴定。结果表明:F1为皮革黄丝膜菌(Cortinariusmalachius(Fr.:Fr.)Fr.),F2为大丝膜菌(Cortinariuslargus Fr.),F3为黄斑蘑菇(Agaricusxanthodermus Quèl.)。rDNA-ITS序列分析法的应用虽然受核酸序列数据库完善程度的影响,但同时也丰富了数据库信息,提高了真菌分类鉴定模糊性状的区分度。相较于传统的分类法,形态学分类法和rDNA-ITS序列分析法共同对菌株进行鉴定的结果更精准,操作也更省时、快捷。苟凡铖 侯怡铃 宋波 黄曦文 宋志强 丁祥 2017西华师范大学学报(自然科学版)2017,38,4:13
8人参内生真菌的分离及其抗肿瘤活性研究显示文摘目的:从人参中分离获得人参内生真菌,并初步探讨其代谢产物粗提物的抗肿瘤活性。方法:研究利用筛选培养基从6年生人参中分离内生真菌,并利用小琼脂块培养法和分子生物学方法对获得的人参内生真菌进行鉴定,利用MTT法检测其体外抗肿瘤活性。结果:从人参中共计分离得到内生真菌28株,其中2株活性较好。结论:从药用植物人参中分离得到的人参内生真菌具有潜在的抗肿瘤活性,为进一步开发抗肿瘤药物提供新的研究对象。王卓 于慧美 刘鼎 高微 田义新 2013中国现代中药2013,15,9:11
9人参内生生防真菌的筛选与鉴定显示文摘为寻找人参病原真菌的生防菌株,采用传统的分离纯化方法,从人参新鲜根中分离内生真菌,并通过平板对峙法筛选高效广谱的菌株;利用形态学与18SrDNA序列分析相结合的手段对菌株进行鉴定.结果表明:从3年生人参新鲜根中分离得到86株内生真菌,其中,Ns-3、Ns-16及Ns-38菌株对人参7种病原菌均有高效广谱抑菌作用,Ns-3对人参根腐病菌的抑菌率达到63.33%,Ns-16对人参灰霉病菌的抑菌率达到69.63%,Ns-38对人参锈腐病菌的抑菌率达到62.34%.通过形态学与18SrDNA序列分析,Ns-3、Ns-38为半知菌亚门青霉属真菌(EpicoccumSP.),Ns-16为半知菌亚门附球菌属黑附球菌(Epicoccum nigrum).为人参内生生防制剂的开发和利用提供了依据,也为开发经济环保的生物农药提供了菌种资源.杨骁 李长田 2013东北师大学报(自然科学版)2013,45,4:11
10人参主要病原菌生防真菌的筛选及鉴定显示文摘【目的】筛选对人参主要病原菌具高效、广谱抑菌作用的生防真菌,丰富人参生防菌菌种资源。【方法】采用稀释平板法,从吉林省2处采样地的人参健株根际土壤中分离真菌;采用平板对峙培养法,通过初筛和复筛,筛选对人参链格孢菌(Alternaria panax)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)、腐皮镰孢菌(Fusarium solani)、毁灭柱孢菌(Cylindrocarpon destructans)、恶疫霉菌(Phytophthora cactorum)、人参核盘菌(Sclerotinia schinseng)和灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)具有高效广谱抑菌活性的生防真菌;利用传统形态学和rDNA-ITS分子分析技术对分离到的生防真菌进行鉴定。【结果】从人参健株根际土壤中共分离得到400株真菌,其中有15株生防真菌对人参7种主要病原菌具有广谱抑菌作用,特别是对立枯丝核菌有强烈的抑制作用(抑菌率均大于50%),且FSR-106的抑菌作用最强(抑菌率87.41%,下同);FSR-121对人参链格孢菌的抑菌作用最强(60.00%);FSR-74对腐皮镰孢菌的抑菌率高达67.48%;FSR-46对毁灭柱孢菌和灰葡萄孢菌的抑菌率最大(66.67%和68.97%);FSR-97对恶疫霉菌及人参核盘菌的抑制作用最强(73.33%和66.67%)。通过形态学和rDNA-ITS序列分析鉴定发现,15株生防真菌中有8株木霉属(Trichoderma)、3株青霉属(Penicillium)、1株曲霉属(Aspergillus)、1株附球菌属(Epicoccum)、1株毛壳菌属(Chaetomium)和1株轮层炭壳属(Daldinia),其中FSR-38为黑附球菌(Epicoccum nigrum),FSR-10、FSR-43和FSR-106为深绿木霉(T.atroviride),FSR-46为长枝木霉(T.longibrachiatum),FSR-55为钩状木霉(T.hamatum),FSR-72为桔绿木霉(T.citrinoviride),FSR-74为球毛壳菌(Chaetomium globosum),FSR-97为多孢木霉(Trichoderma polysporum),FSR-91为蔡氏轮层炭壳菌(Daldinia childiae),FSR-25、FSR-67和FSR-121为青霉属(Penicilliumsp.)。【结论】从人参健株根际土壤中可快速有效地筛选获得大量广谱性生防真菌;本研究所得的15株生防真菌对7种人参主要病害防治具有较高的潜在应用价值。肖春萍 杨利民 韩梅 程林 马锋敏 郭双双 2016西北农林科技大学学报(自然科学版)2016,44,7:11
11基于ITS序列分析18个茶树菇菌株的亲缘关系显示文摘采用ITS序列分析方法,对供试18株(4株野生菌株、7株工厂化栽培菌株、5株经钴60辐照诱变菌株和2株搭载神十的航天诱变菌株)茶树菇菌株进行研究。结果表明,供试菌种的ITS序列长度为703~721 bp,与Gen Bank数据库中茶树菇菌种的ITS序列相似度为99%以上,在种的水平上证明供试菌种为茶树菇。运用构建的系统发育树将供试菌种聚为6个类群,其中Cha3与Cha3shen,AS-2与AS-2-600,AS-1与AS-1shen、AS-1-700,分别聚在了不同的类群,说明这7株茶树菇菌株可能由于辐照或航天诱变后使得ITS序列存在着种内的变异。ITS序列分析结果从系统发育角度反映出了研究菌株的遗传关系,是进行茶树菇菌株遗传分析及科学鉴定的重要工具。王洪秀 魏云辉 靳亮 胡中娥 李菁 陈庆隆 李胜杰 钟国祥 2016西南农业学报2016,29,9:11
12基于LSU和ITS的青藏高原黄绿卷毛菇种群遗传多样性分析显示文摘为研究黄绿卷毛菇群体遗传结构,以青海、西藏、四川3个省份的10个地理群共91个样本黄绿卷毛菇为实验材料,采用分子生物学方法测定和分析所有样本的LSU和ITS序列。结果显示:1 995bp的LSU和ITS基因序列共有8个变异位点,得到20个基因型。单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(pi)分别为0.538±0.026和0.00029±0.00002;青海玉树和青海兴海的遗传多样性指数最高。分子变异分析结果表明黄绿卷毛菇群体遗传变异主要来自种群内(75.70%),种群间遗传分化较大。系统进化树结果也表明,10个地理群分成2个支系,黄绿卷毛菇群体存在明显的地理结构。中性检测结果进一步证实,黄绿卷毛菇群体有着复杂的群体历史,曾发生过种群数量扩张,近期种群数量正在衰减。谢占玲 田飞 余静 聂守一 赵联正 张佳伟 雷亚男 郭璟 2015菌物学报2015,34,1:11
13苦瓜炭疽病病原鉴定及生物学特性初步研究显示文摘为了鉴定海南岛苦瓜种植区的苦瓜炭疽病病原,通过形态学观察和ITS序列分析,对采自海南岛的炭疽病菌进行了鉴定,并初步对其生物学特性进行了研究。将来自海南苦瓜炭疽病菌鉴定为胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides),序列同源性分析表明该病原菌与来自台湾、陕西和墨西哥的炭疽病菌同源性最高。生物学特性测定表明该病菌菌丝生长的适宜pH9~12,最适pH10;光暗交替有利于菌丝的生长;孢子萌发的适宜pH5~8,最适pH6;黑暗有利于孢子的萌发。胶孢炭疽菌(C.gloeosporioides)也是苦瓜炭疽病菌病原菌,光照和pH是影响其菌丝生长和孢子萌发的重要因子。王会芳 曾向萍 芮凯 陈绵才 2012中国农学通报2012,28,7:9
14茶树链格孢叶斑病的病原鉴定显示文摘茶树是我国重要的经济作物,茶园叶病的流行会造成严重的经济损失。2017年10月到2018年1月从安徽、福建和湖北省茶区的9个茶树品种上采集代表性茶叶斑病叶,该病害的发病症状与由Colletotrichum spp.引起的茶炭疽病相似。采用组织分离法从发病叶片组织分离获得26株菌落形态一致的真菌分离物,显微镜观察结果显示,各菌株分生孢子的产生方式和形态特征相似。为进一步明确菌株的分类地位,选取2株来自安徽庐江和宣城地区的代表性菌株(EC-6和XBC1-3)进行多基因片段的PCR扩增和序列分析。结果表明,代表性菌株EC-6和XBC1-3的ITS、gpd、tef-1a基因序列分别与交链格孢Alternaria alternata参考菌株CBS 107.27的序列(KP124300, KP124157, KP125075)相似性为100%、99%和100%,结合菌株形态学观察以及柯赫氏法则验证,证实交链格孢是引起该茶树叶斑病的致病菌。这是在安徽茶区首次发现由致病性链格孢引起茶树叶斑病。周园园 吴治然 贡长怡 韦朝领 张立新 2019植物保护2019,45,6:9
15基于ITS序列分析对秦岭冷水沟羊肚菌的鉴定显示文摘在秦岭中段宁陕县冷水沟采集10株野生羊肚菌,获得菌丝体,扩增其rDNA的ITS区,并进行分析比对,构建分子系统树,鉴定这10株羊肚菌都为粗腿羊肚菌(Morchella crassipes)。戴璐 李峻志 李安利 祁鹏 丁仕刚 2010中国食用菌2010,29,6:9
16产果胶酶菌株的筛选鉴定及其产酶条件的研究显示文摘为筛选果胶高效降解菌株,结合HC比值(透明圈H与菌落直径C的比值)和果胶酶活力测定,从桔子园土壤和腐烂的水果等处筛选得到1株产果胶酶活力较强的菌株M3,结合菌株形态特征观察和ITS rDNA基因序列分析,确定该菌株为聚多曲霉(Aspergillus sydowii).经发酵产酶试验可知,该菌株的最适发酵产酶条件为培养温度30℃,初始pH4.5,接种量(体积分数)7%,培养时间4 d.在该条件下发酵,果胶酶活力可达42.01 U.mL-1.华宝玉 林娟 严芬 李仁宽 杨捷 叶秀云 2012福州大学学报(自然科学版)2012,40,3:9
17DGGE技术在森林土壤微生物多样性研究中的应用显示文摘微生物在森林土壤物质转化中扮演着重要角色,与森林的林型、土壤理化性质存在着密切关系。森林土壤微生物多样性及其变化在一定程度上反映了土壤环境的生产力和稳定性,对表征森林演替,土壤生态修复等有重要意义。变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术测定微生物多样性具有快捷、高效和可重复性高等优点。简要介绍DGGE技术的原理,分析这一技术的局限性和优化方法。重点以实例说明该技术在森林土壤微生物多样性研究中的应用现状,展望该技术的发展前景,以期能为今后这一领域的研究提供科学依据。王洋清 杨红军 李勇 2011生物技术通报2011,27,5:9
18人参内生真菌多样性的初步研究显示文摘对人参两个栽培品种园参和移山参的内生真菌多样性进行初步研究。新鲜园参和移山参根经酒精和次氯酸钠消毒后,接种于PDA平板培养基上进行内生真菌的分离、纯化;根据菌落形态和孢子等形态特征,结合真菌的5.8S和ITS序列进行菌株鉴定。从人参中共计分离到内生真菌48株,园参中分离得到27株,移山参中分离到21株。通过形态鉴定及分子生物学方法鉴定了15株,分为14个分类单元,归属到8科9属12种。不同栽培品种的人参内生真菌形态各异,表现出了较丰富的多样性。明乾良 徐丽莉 韩婷 秦路平 2010人参研究2010,22,2:8
19应用PCR-RFLP和巢式PCR检测黄瓜尖镰孢菌显示文摘以3株黄瓜尖镰孢菌(Fusarium oxysporum f. sp. cucumarinum)、23株镰孢菌属(Fusarium spp.)真菌和分离自土壤的20株真菌、6株细菌和7株放线菌为材料,采用化学裂解法提取总DNA,进行PCR-RFLP和巢式PCR检测,试验证明PCR-RFLP程序不能完全区分Fusarium属内不同种,而巢式PCR对黄瓜尖镰孢菌具有特异性。运用优化的PCR-RFLP和巢式PCR检测程序对染病黄瓜组织进行了检测,结果表明,两种方法均可在接种发病早期(未显症时)检测出黄瓜枯萎病菌,PCR-RFLP在感病品种接种后3d即可检测到病原菌,而巢式PCR在接种后5d才能检测到病原菌。陈微 李永刚 文景芝 2008微生物学通报2008,35,2:7
20一株野生蘑菇的鉴定显示文摘对实验室分离获得的一株野生蘑菇G1菌株进行了初步鉴定.传统形态学观察结果表明,G1菌株子实体菌盖白色,直径2.1 ~ 5.6 cm;菌柄粗0.6~1.0 cm,旱中央着生,菌柄和菌褶基端分离;在菌柄上部有单层菌环;有隔菌丝,菌丝体上无锁状联合;一个担子上普遍着生2个担孢子,孢子椭圆形、棕色,孢子的大小为(5.52 ~ 6.12)μm×(5.02~5.47) μm.根据形态学特征初步鉴定,G1菌株为蘑菇属双孢蘑菇(Agaricus bisporus).由GenBank数据库进行同源性检索比对可知,G1菌株的ITS(Internal transcribed space)序列与双孢蘑菇的ITS序列同源性最高,为95%.综合形态学观察结果和ITS序列分析结果,最终鉴定G1菌株为双孢蘑菇.张倢 康曼 韩建荣 2015山西农业科学2015,43,11:7
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