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| 1 | 基于COⅠ基因的厦门海域鱼类DNA条形码鉴定显示文摘为研究DNA条形码技术在厦门海域鱼类分类鉴定中的可行性,随机选取了厦门海域23种鱼类样品进行COⅠ基因扩增,结果共获取23条序列,平均长度为656 bp,序列中T、C、G、A碱基的平均含量分别为:29.40%、28.10%、18.40%、24.10%.样品种内、种间、科内和目内的遗传距离(K2P)分别为:0.21%,20.50%、24.47%和25.62%,遗传距离随着分类阶元的提高而增大,种间遗传距离明显大于种内遗传距离.所选厦门海域鱼类样品仅蓝圆鯵鉴定到圆鯵属,未能鉴定到种,其余22种全部鉴定到种,表明COⅠ基因序列可以作为鱼类分类鉴定的有效DNA条形码. | 邢炳鹏 林汝榕 王彦国 张稚兰 | 2016 | 应用海洋学学报2016,35,1: | 12 |
| 2 | DNA条形码技术在贵州茂兰鼠类鉴定中的应用显示文摘目的探讨基于线粒体COI基因的DNA条形码技术对鼠类进行准确的鉴定。方法以贵州茂兰地区的3个常见鼠种21个鼠类标本为研究对象,提取基因组DNA,扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因片段并测序,将测序结果进行BLAST比对,基于双参数模型计算鼠种种间和种内遗传距离,构建分子发育系统。结果 DNA条形码检测技术可用于该地区鼠种的鉴定,并能纠正现场形态学鉴定的失误。结论研究结果表明DNA条形码技术是一种有效可靠、易于操作的鼠类鉴定方法,能纠正形态学鉴定中的错误。 | 刘润吉 张荣波 郭天宇 覃龙江 张晓龙 | 2014 | 中华卫生杀虫药械2014,20,1: | 12 |
| 3 | 基于ITS序列位点特异性PCR鉴别桃仁与苦杏仁显示文摘目的:对桃仁和苦杏仁进行分子鉴定研究,建立基于ITS序列位点特异性的PCR鉴定方法。方法:收集桃仁、苦杏仁样品,提取基因组总DNA,用ITS通用引物进行测序,通过Bio Edit软件进行序列比对,根据特异位点设计鉴别引物进行特异性PCR反应,并对PCR反应条件进行了优化。结果:基于ITS序列设计的特异性鉴别引物G4-7可以用于桃仁和苦杏仁的鉴别研究,在位点特异性PCR反应条件考察中,25μL反应体系DNA模板用量适宜范围为0.05~1 ng,退火温度在59℃时特异性最佳,实验建立的方法对不同DNA聚合酶和PCR仪均具有普适性。结论:该研究设计的位点特异性引物在一定条件下的PCR反应中,桃仁能够扩增出333 bp清晰条带,而苦杏仁没有该条带,从而实现了桃仁与苦杏仁的快速、准确鉴别。 | 高琳惠 尹艳 李佳 马玥萌 李文斌 李博文 张夏楠 | 2017 | 世界中医药2017,12,9: | 9 |
| 4 | 玉米象Sitophilus zeamais DNA条形码研究显示文摘【目的】玉米象Sitophilus zeamais(Motschulsky)为世界性分布仓储物害虫,食性极广,在我国多数省(区)均有分布。由于该虫与米象Sitophilus oryzae(Linnaeus)形态极似,很难区别;目前唯一可靠的鉴别特征是雌、雄外生殖器,且要实现准确鉴定必须要有成虫标本,还要经过一系列的繁琐操作,鉴定难度较大,因此需要探索更加便捷高效的鉴定技术。【方法】利用分子生物学手段,通过提取玉米象的基因组DNA,使用通用引物PCR扩增ITS1、ITS2、Cytb、COⅠ、COⅡ基因并测序,通过基因序列相似性来实现快速鉴定,进而获得用于快速鉴定的DNA条形码。【结果】通过形态特征,初步确定玉米象所属大致类群;通过分子生物学手段,获得了多个基因的碱基序列作为玉米象的DNA条形码。【结论】获得多条序列用来鉴定玉米象的DNA条形码,实现玉米象快速准确鉴定,为玉米象的识别鉴定提供基础数据。 | 陈光辉 李焱 刘东 李凤姐 阿依努尔·阿卜杜艾尼 胡红英 | 2018 | 应用昆虫学报2018,55,3: | 9 |
| 5 | 基于16S rDNA和COⅠ基因的3种血蜱分子生物学鉴定显示文摘目的 利用16S rDNA基因及线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidase subunit I gene,COⅠ)基因建立3种形态学特征相近的血蜱属蜱类-长角血蜱、褐黄血蜱及铃头血蜱的分子生物学鉴定方法,探讨它们的系统发生关系。 方法 在上海市动物体表采集寄生蜱,在解剖显微镜下进行形态学鉴定后,提取蜱样本基因组DNA,采用PCR方法从蜱基因组中扩增16S rDNA及COⅠ基因,测序后进行同源性分析,用Mega 6.0软件分别构建系统发生树并进行系统进化分析。 结果 3种血蜱中长角血蜱的16S rDNA序列和COⅠ序列与GenBank中的长角血蜱的16S rDNA序列和COⅠ序列同源性分别为96.0%-97.2%,96.9%-98.8%;褐黄血蜱的16S rDNA序列和COⅠ序列与GenBank中的褐黄血蜱的16S rDNA序列和COⅠ序列同源性分别为95.9%-98.3%、87.1%-91.9%;铃头血蜱的16S rDNA序列与GenBank中来自日本的铃头血蜱(AB819170)的16S rDNA序列同源性为97.5%;3种血蜱16S rDNA基因之间的同源性分别为88.0%、87.0%、86.9%,COⅠ基因之间的同源性分别为80.4%、80.8%、82.8%。用16S rDNA及COⅠ基因构建系统发生树中,长角血蜱、褐黄血蜱分别与已知的长角血蜱和褐黄血蜱聚在一起,长角血蜱、褐黄血蜱均形成独立的分支。 结论 在传统形态学分类的基础上结合分子生物学鉴定方法能更准确地鉴定蜱的种类,并能更好地了解其系统发育进化关系。 | 刘琴 张仪 方圆 朱丹 兰勤娴 施文琦 | 2015 | 国际医学寄生虫病杂志2015,42,3: | 9 |
| 6 | DNA条形码在媒介蚊类鉴定中的应用显示文摘蚊类种类繁多、形态多样,与人类关系密切,可传播多种疾病。由于媒介蚊类的医学重要性,对其准确鉴定是一项重要和有难度的工作。本文在与蚊类形态鉴定方法对比的基础上,尝试从分子生物学方法上,对DNA条形码技术的概念、在蚊类鉴定上的应用以及发展趋势进行综述,以期对蚊传疾病的预防和控制、检验检疫有所帮助。 | 方义亮 高博 王宇平 肖武 张建庆 王光辉 凌飞跃 | 2013 | 中国人兽共患病学报2013,29,10: | 8 |
| 7 | 4种DNA条形码在黄毛鼠种类鉴定中的比较显示文摘目的比较COⅠ、Cytb、16S rRNA、D-loop四个DNA条形码对黄毛鼠鼠种的鉴定效果。方法将大榭港区捕获的1只黄毛鼠样本HX41,提取基因组DNA,使用特异性引物对线粒体COⅠ、Cytb、16S rRNA、D-loop基因进行扩增并对扩增产物进行测序。将测序结果与GenBank中的相似鼠种DNA构建分子进化树进行同源性分析。结果以COⅠ、Cytb、D-loop基因所构建分子进化树中,黄毛鼠均能独立形成分支,且HX41均处于黄毛鼠分支上。HX41的COⅠ基因序列与黄毛鼠HN158株遗传距离最为接近,值为0.0034;Cytb基因序列与黄胸鼠HN99株遗传距离最为接近,值为0.0355,但HN99鼠种数据存在错误;D-loop基因序列与黄毛鼠HN105株遗传距离最为接近,值为0.0439。由于现有GenBank中缺少黄毛鼠16SrRNA基因序列,无法构建进化树。结论对鼠种进行分子鉴定时,有必要根据GenBank数据库的完整性和准确性选择合适的DNA条形码。 | 胡群 马思杰 裘炯良 | 2015 | 中国媒介生物学及控制杂志2015,26,3: | 6 |
| 8 | 基于ITS基因、Actin基因和EF-1α基因序列的新疆向日葵黑茎病菌亲缘关系分析显示文摘对不同地理来源的向日葵黑茎病菌的ITS基因、Actin基因和EF基因进行测序,结合GenBank中的同源序列,对这3种基因的序列进行比对分析和系统进化分析,探讨ITS、Actin以及EF基因用于向日葵黑茎病菌的种内鉴定以及其系统进化的可行性。结果表明:ITS序列和Actin序列比较保守,无法作为种内鉴定的依据。EF基因序列其变异几率比较高,不同地理来源的菌株在EF-1α基因序列上表现出了比较大的差异,可以用于种内亲缘关系的研究。 | 刘启鹏 赵思峰 吴品珊 杜洪忠 张海燕 王志霞 | 2013 | 植物检疫2013,27,5: | 5 |
| 9 | 条形码技术在动物药鉴别中的应用研究进展显示文摘条形码技术在动物药中的运用主要体现在对该动药物DNA的鉴别,目前是通过使用DNA序列线粒体细胞色素C氧化酶亚基(mt coⅠ)对物种进行识别。随着科学技术的发展,条形码技术已普遍为物种的进化遗传、基因变异以及生物的多方面发育提供了技术和理论支持。本文将结合实际案例,深入了解和分析DNA条形码技术的发展概况、共同探讨条形码技术在动物药鉴别中的有效应用。 | 徐丰清 徐婧 刘宗顺 | 2017 | 世界最新医学信息文摘2017,17,61: | 2 |
| 10 | DNA条码技术在大型海藻系统学中的研究现状显示文摘大型海藻(Macroalgae)依据光合色素的不同而分为红藻(Rhodophyta),褐藻(Phaeophyta)和绿藻(Chlorophyta),它们是海洋环境中重要的初级生产者。大型海藻可以直接为人类提供食物,也可以作为饲料转化为动物性蛋白。同时,大型海藻还是重要的药源生物。近年,我国科学家仅利用海带就成功得开发出了PSS、肾海康和甘糖酯等多种药物。此外,由于大型海藻是自养生物,对改善近岸富营养化水域有重要作用。 | 赵小波 刘峰 单体锋 逄少军 | 2012 | 海洋科学2012,36,12: | 2 |
| 11 | 玉米叶蝉缨翅缨小蜂Anagrus dmitrievi(膜翅目,缨小蜂科)DNA条形码研究显示文摘【目的】玉米叶蝉缨翅缨小蜂Anagrus dmitrievi Triapitsyn&Hu是玉米三点斑叶蝉Zyginidia eremita Zachvatkin卵期的重要寄生性天敌,在玉米三点斑叶蝉生物防治中具有广阔的应用前景。由于该寄生蜂个体微小,通过传统昆虫分类方法难以将其与同类卵寄生蜂准确分类。因此,本研究旨在为玉米叶蝉缨翅缨小蜂的快速准确鉴定提供技术支持。【方法】在室内,采集玉米三点斑叶蝉卵饲养玉米叶蝉缨翅缨小蜂至成虫。根据玉米叶蝉缨翅缨小蜂成虫的体色、触角、翅等形态特征对标本进行鉴定,并利用无损伤法提取样本基因组DNA,通过PCR扩增和测序对COⅠ和ITS2基因进行DNA条形码分子标记试验。【结果】形态学鉴定结果表明饲养获得的寄生蜂标本为玉米叶蝉缨翅缨小蜂。获得了该寄生蜂COⅠ和ITS2的部分序列,相似比对、遗传距离和分子进化树结果表明,玉米叶蝉缨翅缨小蜂COⅠ和ITS2序列分别与NCBI数据库中的同属其他种的相关基因有较高相似性,但存在一定遗传差异,可明显区分。【结论】获得的玉米缨翅缨小蜂的COⅠ和ITS2基因序列可作为玉米叶蝉缨翅缨小蜂的DNA条形码,为后续该寄生蜂的快速准确鉴定提供了分子数据。 | 努日耶·木合太尔 陈光辉 彭杰 高滨 张晓东 席欧彦 朱丽得孜·艾山 胡红英 | 2021 | 应用昆虫学报2021,58,2: | 2 |
| 12 | DNA条形码技术在常见水生动物分类中的应用显示文摘DNA条形码(DNA barcoding)技术是逐渐发展起来的新兴分子技术,它通过利用生物体内一段特异的DNA序列快速而精确进行物种识别。DNA条形码技术不仅可以用于物种的鉴定和分类,同时也帮助生物学家深入了解物种之间的亲缘关系以及生态系统内的相互作用,提供了一种迅速而有效的分类学方法来细化分类学上现存的标准,因而成为分类学领域的前沿技术。本文概述了DNA条形码技术在部分水生物种中的广泛应用以及对未来的展望。 | 吴清楠 | 2013 | 生物技术世界2013,10,1: | 2 |
| 13 | 六种蚊虫DNA条形码序列分析显示文摘传统分类学鉴定需要有完整无残缺的成虫标本,对于非昆虫分类学研究人员应用传统分类学方法鉴定蚊虫较为困难;本研究旨在发掘更多适用于蚊类鉴定的DNA条形码,实现口岸一线蚊类的快速准确鉴定。本文通过提取14个蚊虫样品的基因组DNA,使用通用引物PCR扩增ITS1、ITS2、Cytb、COI基因及序列,PCR产物双脱氧法测序,结合NCBI中相关数据分析部分ITS2、Cytb、COI序列的相似性和遗传关系。结果显示:获得了14个蚊虫样品的部分ITS1、ITS2、Cytb、COI序列的非全长碱基序列共计39条;依据种内遗传距离和相似度将14个未知蚊虫分子分类鉴定为6种蚊虫:凶小库蚊、致倦库蚊、尖音库蚊、赫坎按蚊、白纹伊蚊、里海伊蚊;碱基使用率统计表明所测样品的Cytb、COI基因符合昆虫线粒体DNA碱基组成;构建基因ITS2、Cytb、COI系统进化树,符合蚊虫系统发育遗传进化理论。本研究对14个未知蚊虫样品的进行了分子鉴定,为蚊类的快速准确识别鉴定提供基础数据。 | 陈光辉 王孟文 李焱 刘东 廖凌 | 2020 | 寄生虫与医学昆虫学报2020,27,1: | 2 |
| 14 | 应用DNA条形码技术鉴定舟山群岛地区蝙蝠种类显示文摘目的探索DNA条形码技术在蝙蝠种类鉴定中的应用。方法本研究以舟山群岛地区3种常见蝙蝠标本为研究对象,提取基因组DNA,扩增CytB基因片段并测序,将测序结果进行BLAST比对分析;基于Kimura双参数模型计算22只蝙蝠CytB序列的种内种间遗传距离。结果遗传进化分析显示种间遗传距离显著大于种内遗传距离,通过NJ法构建系统发育树聚类分析,不同种类的蝙蝠位于不同的分支,同属的蝙蝠分支较不同属的蝙蝠分支较短,种内分支则更短,上述结果都与形态学鉴定结果一致。结论该研究建立的DNA条形码技术对于本研究中所涉及的蝙蝠种类具有较好的区分效果,可以作为一种有效的工具在蝙蝠鉴定中进行应用。 | 朱长强 胡丹 王依 艾乐乐 杨露 谭伟龙 王长军 | 2017 | 解放军预防医学杂志2017,35,9: | 1 |
| 15 | 应用DNA条形码技术鉴定东南沿海蝙蝠种类显示文摘目的探索DNA条形码技术在蝙蝠种类鉴定中的应用。方法基于kimura双参数模型计算23只蝙蝠Cyt B序列的种内种间遗传距离。结果种间遗传距离显著大于种内遗传距离,通过NJ法构建系统发育树聚类分析,不同种类的蝙蝠位于不同的分支,同属的蝙蝠分支较不同属的蝙蝠分支较短,种内分支则更短。种间遗传距离均在1.3以上,种内遗传距离均在0.21以下,与NCBI序列比对结果一致,与形态学鉴定结果一致(20只菲菊头蝠,1只马铁菊头蝠,1只大卫鼠耳蝠,1只小黄蝠)。结论 DNA条形码技术对于本研究中所涉及的蝙蝠种类具有较好的区分效果,可以作为一种有效的工具在蝙蝠鉴定中进行应用。 | 谭伟龙 吕恒 朱长强 胡丹 艾乐乐 杨露 王长军 邓小昭 | 2017 | 中华卫生杀虫药械2017,23,1: | 0 |
| 16 | 基于COⅠ基因对南海鱼类鉴定的可行性分析显示文摘为研究DNA条形码技术在南海海域鱼类分类鉴定中的可行性,采集了南海6目28科43属65种鱼类进行COⅠ基因序列扩增,获得序列与NCBI数据库进行比对,结合形态学信息,对鱼类分类鉴定进行分析.利用MEGA5.0软件计算各物种序列信息、遗传距离以及构建分子系统进化树,结果显示所得65种鱼类COⅠ基因同源序列633 bp,与NCBI数据库比对,可搜索出相似率99%以上的样品,可以鉴定到种的水平.序列中A、T、G、C碱基平均组成为A23.8%、T28.6%、G18.8%、C28.8%.样品种间、属间、科间和目间的遗传距离分别为14.88%、19.09%、23.14%和24.68%,随着分类阶元的升高,物种的平均遗传距离差异越大.构建的系统进化树,科级以下阶元的分类关系与形态分类基本一致,而科级以上阶元的分类关系与形态学分类差别较大,说明COⅠ基因在鱼类分子鉴定上是有效的条形码基因,但在系统进化关系上不一定适用于高级阶元的系统进化分析. | 张卓为 何浩斌 李子博 张凯 李江涛 梁日深 陈轶之 林蠡 | 2020 | 仲恺农业工程学院学报2020,33,2: | 0 |