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1糖尿病的代谢组学研究进展显示文摘糖尿病是一种发病率极高的代谢紊乱性疾病。随着糖尿病发病人数的逐年增加,其发病人群也呈现出年轻化趋势。因此,深入开展糖尿病研究工作迫在眉睫。近年来,代谢组学在糖尿病的生物标记物发现、发病机制探索、早期诊断及预后、药物疗效评价等方面的研究中取得了可喜的进展。但限于代谢组学技术的发展局限及糖尿病研究的复杂性,糖尿病的代谢组学研究仍然面临诸多的挑战。本文主要针对代谢组学在糖尿病中的研究进展及其发展方向进行合理的总结和展望。李信 马海燕 李鲁盼 孙珊珊 朱丽君 刘玉峰 2019药学学报2019,54,5:19
2非靶向尿液代谢组学方法研究五味子治疗糖尿病并发症作用机制显示文摘采用超高效液相色谱-串联四级杆飞行时间质谱联用技术(Ultra-performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry,UPLC/Q-TOF-MS),结合主成分分析技术(Principal component analysis,PCA),进行了五味子治疗糖尿病并发症大鼠尿液代谢组学研究,对五味子治疗糖尿病并发症大鼠后尿液生物标志物变化进行了考察。采用UPLC/Q-TOF-MS方法分析了健康组、糖尿病并发症模型组和五味子给药组的大鼠尿液,采用偏最小二乘法-判别分析(Partial least squares discriminant analysis,PLSDA)和正交偏最小二乘法-判别分析(Orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)载荷图筛选,通过分析对各组分离贡献较大(VIP>1,p<0.05)化合物的串联质谱数据,再经Human Metabolome Database(HMDB)等数据库检索,进行质谱信息匹配,尿液中共鉴定出28种潜在生物标记物,其中正谱13种,负谱15种。这些生物标记物主要影响戊糖和葡糖醛酸相互转化通路、核黄素代谢、泛酸和Co A合成、精氨酸和脯氨酸代谢、肠内菌代谢、嘌呤代谢、Vc代谢胆酸合成、色氨酸代谢等通路,五味子从能量代谢、氨基酸代谢、肠内菌代谢、脂类代谢等各个角度发挥治疗糖尿病并发症的作用。从各个通路的相关生物功能分析,五味子治疗糖尿病肾病的作用较强,此外还具有降脂、抗氧化的功效。韩红祥 宋凤瑞 舒振波 刘志强 任跃英 皮子凤 2017分析化学2017,45,3:17
3代谢组学技术发展及其在农业动植物研究中的应用显示文摘代谢组学是依赖灵敏、稳定的分析流程和数据库,利用色谱–质谱联用、核磁共振技术对生物体内以及生物样品所有的小分子代谢物进行鉴定和定量分析的学科,在医学、食品科学、畜牧学、植物学等领域得到广泛应用。代谢组学方法可将代谢物种类和含量的变化与生物表型变化建立更直接的联系,因此代谢组学逐渐成为继基因组学、转录组学、蛋白组学后对复杂性状系统解析的新的研究手段。本文介绍了代谢组学常用分析策略、检测平台和常用数据库。在此基础上,综述了代谢组学在农业动物重要经济性状代谢分子鉴定、疾病诊断、肉品质及动物制品安全检测等领域取得的进展,并总结了利用代谢组学、转录组学和基因组学等多组学研究在动植物重要性状的发育、形成和解析等领域取得的最新成果。代谢组学与其他多组学方法整合分析,可以更全面地阐述各类复杂性状的遗传机制,有助于完善“突变–基因–表达–代谢–表型”的完整生物学过程,为复杂性状的机理解析提供新方法,为新型农业育种提供新思路。田菁 王宇哲 闫世雄 孙帅 贾俊静 胡晓湘 2020遗传2020,42,5:13
4赣北工夫红茶滋味特征及关键化合物分析显示文摘为探究赣北工夫红茶的滋味特征及其分子感官基础,该研究采用定量描述分析(quantitative description analysis,QDA)和液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)对11份赣北工夫红茶的滋味分属性和非挥发性化合物进行评价和检测,之后运用偏最小二乘-重要变量投影(partial least square-variable import project,PLS-VIP)筛选对滋味感官分属性具有重要影响的关键化合物。结果表明,获得了赣北工夫红茶的9个滋味描绘词及定义,其滋味特征以甜味、醇味和回甘为主,其中苦味与涩味呈显著正相关,与甜味呈显著负相关;甜味与异味之间呈极显著负相关;鲜味与回甘之间呈极显著正相关。通过LC-MS检测共得到74种共有非挥发性化合物,包括25种酚类、23种氨基酸类、9种色素类、9种有机酸类、5种糖类、2种生物碱和茶皂素;PLS-VIP结果显示33种化合物的VIP值>1,包括10种氨基酸类、12种酚类、3种色素类、1种生物碱、4种酸类和3种糖类,说明这些化合物为赣北工夫红茶滋味的关键贡献成分,并进一步获得了对每一种滋味分属性具有重要贡献的化合物。该文明确了赣北工夫红茶的滋味特征及其具有重要贡献的化合物,为进一步研究赣北工夫红茶滋味品质的定向调控提供理论依据。岳翠男 秦丹丹 蔡海兰 王治会 李琛 李延升 杨普香 2021食品与发酵工业2021,47,2:10
5非靶向代谢组学用于藜芦妨害人参治疗脾气虚的机制研究显示文摘采用超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱(UPLC/Q-TOF-MS)联用技术,通过非靶向代谢组学方法分析大鼠尿液内源性代谢物的变化,研究藜芦妨害人参发挥药效作用的机制。建立脾气虚大鼠模型,连续给药15天,测定力竭游泳时间及血液中白细胞、红细胞、血红蛋白的含量。结果表明,人参可显著提高脾气虚模型大鼠的力竭游泳时间(p<0.01),升高白细胞、红细胞及血红蛋白含量(p<0.05,p<0.01),藜芦对脾气虚模型大鼠各项指标无明显影响(p>0.05),人参与藜芦配伍后对脾气虚模型大鼠各项指标均无显著影响(p>0.05),表明藜芦妨害了人参发挥药效作用。采用UPLC/Q-TOF-MS技术及非靶向代谢组学的方法分析了空白组、模型组、人参组、藜芦组、参藜组对脾气虚模型大鼠的尿液代谢组差异,其中主成分分析(PCA)得分图显示各组代谢轮廓有显著差别,并通过正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)及数据库检索,鉴定出15种人参干预调节脾气虚模型大鼠的潜在生物标志物,从中找出了7种人参藜芦配伍后减弱人参上述干预作用的潜在生物标志物,并对其涉及的代谢通路进行了系统分析。上述研究结果表明,人参藜芦配伍后妨害了人参对脾气虚模型大鼠的治疗作用,其机理可能是影响人参对体内能量代谢、免疫平衡及氧化还原反应等相关代谢的调节。林贺 皮子凤 门丽慧 陈维佳 刘志强 刘忠英 2016分析化学2016,44,11:8
6基于液质联用技术的代谢组学生物样本——血液及尿液的收集和处理显示文摘代谢组学是定性及定量描述内源性代谢物变化的科学,正广泛应用于疾病诊断和预后过程中。血液和尿液是代谢组学研究中常用的生物样本,但因其代谢物繁多、成分复杂,亟须使用灵敏度高、特异性强的分离分析技术。液相色谱-质谱联用(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)技术分析速度快、分离效率高,非常适用于代谢组学等方面的研究。生物样本的采集、处理过程是实验中最关键的一步,直接决定着实验结果的准确性,因此生物样本预处理过程的标准化显得尤为重要。本文综述了常用的生物流体—血液和尿液的收集、处理及储存方法,以期为有关代谢组学研究提供参考。程瑶 邵云云 刘俊瑾 常壮鹏 樊磊 侯锐钢 2019中国医院药学杂志2019,0,4:7
7基于液质平台代谢组学生物样本的采集和制备显示文摘代谢组学是利用高通量检测技术对内源性代谢物进行定性和定量分析,从而挖掘代谢物与相应生物学变化的相对关系。目前,代谢组学在药物研发、疾病研究、药物毒理学等领域发挥着越来越大的作用。液相-质谱联用平台,检测的相对分子质量范围大、分辨能力强、扫描速度快,拥有很高的灵敏度和较宽的动态范围,其在代谢组学中的应用得到越来越多研究者的认可。生物样品的采集和制备是代谢组学试验中至关重要的步骤,直接决定着试验结果的可靠性。由于样本自身的复杂性以及对样本采集和制备过程中细节的忽视,往往导致试验结果出现偏差,甚至导致错误的结论。因此充分验证样本的采集和处理方法在试验中尤为重要。本文主要综述了基于质谱平台的代谢组学常用生物样本的采集和制备方法,为代谢组学试验提供相关参考。马宁 杨亚军 刘希望 李剑勇 2017中国兽医学报2017,37,6:3
8提高《化学分析与仪器分析》教学质量的探讨显示文摘近年来,生物安全问题层出不穷,蜂蜜掺假事件、“染色馒头”事件、镉超标大米、毒面膜、甲醛超标等问题层出不穷,让消费者忐忑不安。此时,对卫生检验与检疫的要求日益严苛,对有害物质进行早期标准化检测对人类健康、社会和谐具有重要意义。本校自设立卫生检验与检疫专业以来,本着严谨教学、注重实践的理念,用心培养一批又一批高素质的卫检人才。颜玉蓉 丁敏 张晓清 2017重庆医学2017,46,3:2
9先天性小耳畸形差异性代谢物质及代谢通路的非靶向筛查显示文摘目的筛查先天性小耳畸形患者残耳软骨组织中相关差异性代谢物和关键的代谢通路。方法根据纳入标准,选取2017年6月至2018年1月中国医学科学院北京协和医学院整形外科医院收治的单纯性小耳畸形患者18例为病例组,行耳再造术时采集患者的残耳软骨组织。另选取18例非小耳畸形、但治疗过程需采取耳软骨的患者为对照组,采取正常耳廓软骨组织。将样本预处理后,采用气相色谱飞行时间质谱联用技术(GC-TOFMS)的非靶向代谢组学的研究手段,XploreMET软件行代谢组学数据分析,利用正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)及其变量重要性投影(VIP)法和U检验的统计方法,分析小耳畸形残耳软骨组织中的差异性代谢物,并将其比照代谢网络数据库,利用代谢通路富集分析(MPEA)筛选得出与差异性代谢物最为相关的代谢通路。结果小耳畸形患者的残耳软骨组织和正常耳廓软骨组织中的代谢产物具有差异,其中14个代谢物差异具有统计学意义(P<0.05);3条代谢通路可能发生显著改变(P<0.05),为精氨酸合成途径、牛磺酸和亚牛磺酸代谢途径、维生素B5和辅酶A合成途径。结论精氨酸、牛磺酸、L-半胱氨酸与小耳畸形的发生可能存在关联,代谢组学为小耳畸形的研究提供了新的手段。杨锦秀 何乐人 林琳 王永振 张晔 杨峥 董文芳 杨晨 顾勤浩 2020中华整形外科杂志2020,36,5:2
10代谢组学在恶性食管肿瘤中的诊断及应用显示文摘代谢组学是效仿基因组学、蛋白质组学研究思想,对生物体内所有代谢物质进行定量分析,并寻找其代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。其研究对象大都是相对分子质量为1000以内的小分子物质。恶性食管肿瘤是常见的消化道肿瘤,全世界每年约有30万人死于其疾病,且其发病率和死亡率各国差异很大。由于恶性食管肿瘤的早期症状常不明显,且其诊断在临床上难以实现,目前仍未有可靠技术手段对其进行早期诊断。而代谢组学出现又在其研究中越发深入,有望成为其诊断及疗效评价的可靠手段之一。因此,本文就代谢组学在恶性食管肿瘤的诊断及应用展开讨论,对其当前所存在的问题加以阐述,并提出一系列新的观点。丁可 王家林 2021中华实验外科杂志2021,38,8:1
11不同防腐措施收集大鼠尿液对其内源性代谢物的影响显示文摘目的:在大鼠尿液代谢组学研究中需要对尿液样本的采集过程采取必要的防腐措施,针对尿液收集过程中常用的几种防腐措施,研究其对尿液内源性代谢物的影响。方法:在大鼠尿液样本采集时采用冰上收集、加入叠氮化钠以及两者合用进行防腐,利用核磁共振代谢组学技术分析不同防腐措施的差异。结果:核磁共振代谢组学结果显示,冰组和叠氮化钠+冰合用组的主成分分析结果重合较多,且二者与空白组、叠氮化钠组均有较高的分离度;叠氮化钠组和空白组有小部分重叠,但是有分离的趋势。提示冰组与叠氮化钠+冰合用组的防腐效果相近,与空白组相比尿液中的缬氨酸、甜菜碱、马尿酸上升,丙氨酸和2-酮戊二酸下降。结论:在大鼠尿液代谢组学研究中,尿液样本采集时一定要有低温防腐措施,在有防护条件时加入一定量叠氮化钠有助于提高防腐效果。刘欢 高洁 尹晶晶 黄立群 许文黎 袁慧 岳娟 秦秀军 李建国 田俊生 2019中国实验方剂学杂志2019,25,6:1
12代谢组学在食管癌方面的应用研究进展显示文摘随着自然科学技术的快速发展,基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等各种基于整体的研究不断出现并相互交叉。其中,代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,是对生物样本中的小分子代谢物进行全面定性和定量分析的一门新兴学科,通过核磁共振、质谱、色谱或其联用技术,表征疾病所特有的代谢模式,以期更好地了解代谢物质的变化及规律。食管癌是一种和代谢密切相关的疾病,而目前的诊断方法不够灵敏或对身体造成损伤,故使用代谢组学方法寻找与食管癌相关的生物标志物具有很大的优势。刘燕芳 胡志坚 彭仙娥 2017医学综述2017,23,5:0
13响应面法优化藜麦非靶向代谢组样品的衍生化条件显示文摘为优化藜麦非靶向代谢组样品的衍生化条件,获得更多的代谢物信息.以N-甲基-N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺(MSTFA)为衍生化试剂,在单因素实验的基础上,用响应面法优化衍生化试剂的体积、衍生化温度、衍生化时间,并用GC-MS法检测衍生化后的代谢物质,通过出峰个数和总峰面积表征衍生化的效果.结果表明,响应面法优化后的最佳衍生化条件为衍生化试剂的体积为100μL,衍生化温度为40℃,衍生化时间为27 min.在最佳条件下得到的代谢物总峰个数和峰面积分别为69个和2.34×1010,与模型预测值(70个,2.38×1010)相近.该方法操作简单,衍生化效果好,结果具有重复性与可操作性,可用于藜麦非靶向代谢组样品的衍生化处理.时羽杰 唐媛 田计均 李兴龙 邬晓勇 孙雁霞 2020宁夏大学学报(自然科学版)2020,41,2:0
14盐酸氯丙嗪急性中毒致死小鼠血浆中差异代谢物的筛选显示文摘目的通过对盐酸氯丙嗪急性中毒小鼠血浆内代谢物进行非靶向代谢组学分析,筛选出与盐酸氯丙嗪急性中毒致死相关的差异代谢物。方法随机选取24只ICR小鼠并将其随机分为盐水对照组、盐酸氯丙嗪试验组,每组12只。应用超高效液相色谱-高分辨质谱(ultra-high performance liquid chromatography-high resolution mass spectrometry,UPLC-HRMS)检测两组小鼠血浆样本,通过正交偏最小二乘辨别分析、t检验及差异倍数统计方法筛选出与盐酸氯丙嗪中毒致死相关的差异代谢物,并与数据库进行对比,从而找出有差别意义的代谢产物。结果血浆样本的OPLS-DA分析结果显示,两组有较大差异;共鉴定出脂肪酰基和羧酸及其衍生物等11类共29个差异代谢产物。结论基于UPLC-HRMS的代谢组学技术能够发现与盐酸氯丙嗪中毒致死相关的差异代谢物,为今后法医学盐酸氯丙嗪中毒死因判定提供参考。刘鑫鑫 白锐 刘文乔 谢冰 文迪 马春玲 2022河北医科大学学报2022,43,2:0
15代谢组学技术在果实采后生理研究中应用的研究进展显示文摘代谢组学是对生物体内代谢物组的含量或变化进行测定,进而研究生物体的整体功能状态的技术。在介绍代谢组学相关概念的基础上,重点介绍了代谢组学研究过程中的样品提取、分析技术和数据分析的常用方法,并对该技术在果实采后生理和病理方面的研究进展进行了综述,最后对该技术目前存在的问题和发展趋势进行了分析和展望,以期促进代谢组学技术在果实采后生理研究中的应用。邵淑君 王东阳 季娜娜 张新华 李富军 2016北方园艺2016,,21:0
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