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| 1 | 广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株GP120序列变异分析显示文摘目的 了解广州市男男性行为HIV-1主要流行株Gp120基因的序列特征.方法 收集广州市男男性行为HIV-1感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录巢式PCR扩增获得HIV-1膜基因Gp120全长,对获得的序列进行系统进化树、长度多态性、V3环氨基酸、辅助受体预测及特征性氨基酸分析.结果 61例样本分为4个亚型,主要流行株为CRF07 BC(34/61,55.74%)和CRF01 AE亚型(24/61,39.34%).主要流行株Gp120序列长度为496~515个氨基酸,V1和V3高变区分别表现出最高和最低的长度多态性.主要流行株V3环顶端四肽的主要形式为GPGQ(56/58,96.55%),4种方法综合预测主要流行株的辅助受体主要为CCR5(50/58,86.21%).广州市男男性行为HIV-1感染者中流行的CRF01 AE亚型毒株存在4个特征性氨基酸,出现频率为0.75~0.83,CRF07 BC亚型毒株存在8个特征性氨基酸,出现频率为0.74~0.94.结论 广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列长度有着较高的多态性,V3环顶端四肽、辅助受体和特征性氨基酸有其自身特点. | 兰芸 胡凤玉 李凌华 蔡晓莉 蔡卫平 唐小平 陈伟烈 | 2019 | 中华实验和临床病毒学杂志2019，33，3： | 1 |
| 2 | 深圳市HIV-1主要流行株外膜蛋白V3环氨基酸变异分析显示文摘目的了解深圳市HIV-1主要流行株膜蛋白V3环氨基酸变异情况。方法收集深圳市1996—2010年HIV确认阳性样本389份,应用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)技术,对样本膜蛋白(Env)基因V3-V4区进行扩增,并对核苷酸序列进行测定,判定亚型结果。对获得的CRF01_AE、CRF_BC、B’和B重组株/亚型的核酸序列进行比对和翻译,分析其V3环氨基酸变异情况。结果 227例CRF01_AE重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(184/227,81.1%),199例(87.7%)可预测使用CCR5辅助受体,12例(5.3%)使用CXCR4辅助受体;55例CRF_BC重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(54/55,98.2%),50例(90.9%)可预测使用CCR5辅助受体,5例(9.1%)不能预测;49例B’亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(39/49,79.6%),25例(51.0%)可预测使用CCR5辅助受体,3例(6.1%)使用CXCR4辅助受体,21例(42.9%)不能预测;10例B亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(5/10,50.0%),8例(80.0%)可预测使用CCR5辅助受体,2例(20.0%)使用CXCR4辅助受体。CRF01_AE、CRF_BC、B’和B亚型毒株V3环净电荷数分别为3.29±0.97(n=227)、3.11±0.42(n=55)、3.73±0.93(n=49)和3.50±0.97(n=10)。结论深圳市HIV-1 V3 环顶端四肽主要为GPGQ和GPGR,病毒辅助受体使用以及表型预测结果表明深圳市HIV-1的流行仍以复制速度较慢的非合胞体诱导型病毒为主。 | 张燕 赵广录 石向东 廖清华 赵锦 杨峥嵘 何晓茜 陈琳 | 2019 | 中国热带医学2019，19，7： | 1 |
| 3 | 阜新市HIV-1 env基因C2-V4区序列特征分析显示文摘目的分析阜新市艾滋病病毒1型(HIV-1) env基因C2-V4区序列及代表性广谱单克隆中和抗体的表位变异,为HIV-1变异趋势研究及阐明V3环与病毒生物学特征提供依据。方法采集2018—2019年在阜新市卫生健康服务中心确证阳性的112例HIV-1感染者全血标本,采用巢式PCR扩增env基因C2-V4区核苷酸序列并测序,采用MEGA软件鉴定分型,采用HIV Database等软件分析V3环顶端四肽、辅助受体、净电荷和特征性氨基酸。结果获得101条有效基因序列,发现5种V3环顶端四肽类型,其中GPGQ 77条,占76.24%,存在于CRF01_AE、CRF07_BC、CRF65_cpx和G亚型;GPGR 19条,占18.81%,存在于CRF01_AE、CRF07_BC和B亚型;GPGH 3条,GPGK和GPGA各1条,均只存在于CRF01_AE亚型。辅助受体主要使用CCR5,84条占83.17%。CRF01_AE、CRF07_BC、B、CRF65_cpx和G亚型V3环净电荷数分别为3.28±1.17、3.22±0.92、4.25±0.83、2.50±0.50和3。结合b12和VRC01中和抗体表位氨基酸位点突变率为0-9.90%;295位和332位氨基酸N-糖基化位点缺失率分别为18.81%和14.85%,未发现两者同时缺失的情况。结论 2018—2019年阜新市HIV-1毒株主要是以CCR5为辅助受体的巨噬细胞嗜性非合胞体诱导型病毒,V3环顶端四肽以GPGQ为主,复制速度较慢,逃逸中和抗体能力较低。 | 李贺 杜波 田晓东 刘文新 姚文清 | 2020 | 预防医学2020，32，10： | 0 |
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