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1大麦基因组GRAS基因家族的全基因组鉴定与表达分析显示文摘GRAS基因家族是一类仅存在于植物并广泛参与其生长发育调控的转录因子,根据其序列结构和系统发育树分化特征,GRAS转录因子包含PATI, DELLA, HAM, SCR, SHR等多个亚家族成员。本研究利用大麦最新的基因组数据库,采用生物信息学的方法筛选鉴定出41条GRAS基因序列,其中有34条序列具有完整的GRAS家族蛋白特有的GRAS结构域,可定位到大麦7条染色体上且呈不均匀分布。与拟南芥和水稻GRAS蛋白进行的系统发育分析,可将大麦GRAS家族蛋白进一步划分为10个亚家族。本研究对大麦GRAS基因的表达丰度分析,发现部分基因在发育阶段高表达,这可能暗示着这些基因在相应发育阶段起到重要作用。本研究结果可为后续挖掘和验证大麦GRAS基因提供参考。孔豆豆 毛成志 王蕾 王寒冬 张怀刚 徐金青 沈裕虎 2021分子植物育种2021,19,1:6
2与番茄斑萎病毒相关的番茄miRNAs的基本特征和功能分析显示文摘为了解与番茄斑萎病毒相关miRNAs的基本特征和功能,采用生物信息学的方法对与番茄斑萎病毒相关的miRNAs进行了研究。结果表明:与番茄斑萎病毒相关的番茄miRNAs一共有18个,分别分布在番茄10条染色体上;其上游启动子元件主要包括光响应元件、脱落酸响应元件和厌氧诱导元件等;其共靶向11个转录因子;在细胞组分功能上,靶基因的功能主要集中在细胞、细胞要素和细胞器上,分别达到56.2%、56.2%和50.0%;在分子功能上,靶基因的功能主要集中在催化活性和结合上,两者都达到了62.5%;在生物过程中,靶基因的功能主要集中在代谢过程和细胞过程中,分别达到68.8%和62.5%;在lncRNA-miRNA-mRNA互作网络中,共有14个miRNAs,18个mRNAs和40个lncRNAs。研究结果为番茄抗番茄斑萎病毒育种具有重要的指导意义。阮先乐 刘红占 2023分子植物育种2023,21,6:0
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