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| 1 | 基于ATD-GC-MS技术的不同品种白牡丹茶香气成分分析显示文摘采用自动热脱附-气相色谱-质谱联用仪(automatic thermal desorption-gas chromatography-mass spectrometry,ATD-GC-MS)对不同品种牡丹制成的白牡丹茶进行香气检测分析,探究其香气成分特征。结果显示,5个白牡丹品种茶中共鉴定出50种香气成分,正己醛、壬醛、癸醛、苯甲醇、芳樟醇、1-戊醇和β-紫罗兰酮是主要香气成分,奠定了白茶的香气基础。有44种组分的香气成分含量,经单因素分析达到显著差异水平(P<0.05),且香气活性值(odor activity value, OAV)在不同品种白牡丹茶间也存在差异,其中,政和大白茶含有较高的醛类和醇类化合物,福鼎大毫茶含有较为丰富的醇类化合物,福云6号含有较高的醛类和碳氢化合物,九龙大白茶和福云595含有较高的醇类和碳氢化合物。本研究可为进一步探究白茶品种香型特征划分提供参考依据。 | 邵淑贤 王淑燕 王丽 赵峰 陈潇敏 吴秀秀 叶乃兴 | 2022 | 食品工业科技2022,43,1: | 23 |
| 2 | 基于UPLC-QTOF-MS结合非靶向代谢组学鉴别3种江西名茶显示文摘利用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱仪建立一种狗牯脑、庐山云雾茶和婺源绿茶品质鉴别的非靶向代谢组学分析方法。利用MassHunter Mass Profile对原始数据进行逐步筛选,最终确定220个特征差异化合物,并对其进行主成分分析和聚类分析,结果表明3种茶叶具有较大差异。构建偏最小二乘判别分析预测模型,该模型能够对狗牯脑、庐山云雾茶和婺源绿茶品质进行鉴别,准确度达100%。通过一级母离子和二级碎片离子对220种特征差异物进行鉴定,最终鉴定出22种,主要成分为黄酮类、糖苷衍生物和有机酸类等,结合热图分析发现其在3种江西名茶中的含量具有明显差异。本研究对茶叶品质鉴别具有一定指导意义,该方法可广泛用于食品的分析和表征。 | 徐春晖 王远兴 | 2022 | 食品科学2022,43,2: | 14 |
| 3 | 小贯小绿叶蝉取食诱导抗、感茶树品种挥发物的释放显示文摘为研究不同抗性水平茶树应对小贯小绿叶蝉取食诱导的挥发物释放及相关代谢机制,以抗虫茶树品种举岩(JY)和感虫茶树品种恩标(EB)为试验材料,利用动态顶空收集法结合GC-MS技术检测茶树在小贯小绿叶蝉取食不同时间(6、12、24、36、48、72 h)释放的主要挥发物组分,并结合转录组数据分析主要挥发物合成途径上的相关基因的表达水平及其调控趋势。结果表明,在健康状态下,茶树释放的挥发性物质较少;在虫害后不同时间段的茶样中检测到顺-β-罗勒烯(β-Ocimene)、(E)-4,8-二甲基-1,3,7-壬三烯[(E)-4,8-dimethyl-1,3,7-nonatriene,DMNT]、芳樟醇(Linalool)、法尼烯(Farnesene)等10种主要挥发物。其中,单萜类物质在虫害诱导的感虫品种茶树上含量高,倍半萜类物质在虫害诱导的抗虫品种茶树中含量高。转录组数据显示,小贯小绿叶蝉取食诱导抗、感茶树品种中调控萜类合成的关键基因均被明显激活。调控单萜类物质合成的相关基因在感虫茶树品种中的表达量相对较高,而调控倍半萜类物质合成的相关基因在抗虫品种中的表达量与感虫品种差异不显著。本研究结果为茶树抗虫机制和小贯小绿叶蝉绿色防控提供一定的理论依据。 | 任倩倩 庄明珠 蔡晓明 边磊 罗宗秀 李兆群 尤民生 陈宗懋 金珊 | 2020 | 茶叶科学2020,40,6: | 12 |
| 4 | 3个甜玉米品种在不同储藏条件下可溶性固形物含量及挥发性风味成分变化显示文摘【目的】阐明甜玉米Zea mays L. saccharata Sturt.采后在不同贮藏温度、贮藏时间下可溶性固形物含量和挥发性风味物质的变化规律,为甜玉米采后品质性状研究奠定基础。【方法】以‘奥弗兰’、‘王朝’、‘广良甜27’3个甜玉米品种为材料,利用手持数显糖度计测定可溶性固形物含量;同时采用顶空固相萃取法,通过色谱-质谱联用仪测定3个品种在常温(室温)和4℃低温储存条件下挥发性风味成分,结合多元统计分析对不同品种的挥发性风味成分进行分析。【结果】与常温储藏相比,甜玉米在低温储藏时可溶性固形物含量下降缓慢。在常温和低温储存条件下分别检测到58和59种挥发性物质,主要为烷烃类和酯类物质。不同品种在不同储藏条件下挥发性风味物质种类存在一定差异,共有的挥发性风味物质有8种,分别为3,8-二甲基癸烷、3-甲基十一烷、正十二烷、十四烷、3-甲基十五烷、十六酸乙酯、正十九烷和正十六烷。偏最小二乘判别分析(Partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)表明,常温和低温储藏时分别鉴定到9和10种变量重要性投影(Variable importance projection,VIP)>1的关键挥发性物质,常温和低温储藏时‘奥弗兰’共有的关键挥发性物质为(+)-环苜蓿烯,‘王朝’为正十二烷。【结论】储藏温度和时间均会影响甜玉米可溶性固形物含量及挥发性物质的种类和含量。 | 李云峰 范競升 陈冰琳 王思鸿 刘宇 王欣 刘晓敏 王青峰 李小琴 黄君 | 2021 | 华南农业大学学报2021,42,3: | 10 |
| 5 | 香蕉NHX基因家族的鉴定及表达分析显示文摘NHX是Na+(K+)/H+的逆向转运蛋白,具有Na+/H+exchange (PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种生物中,主要参与植物响应盐胁迫过程中离子平衡的重建。本研究从香蕉(Musa spp.)基因组数据库中鉴定了NHX基因家族,并进行生物信息学分析及盐胁迫下香蕉NHX基因的表达分析。结果表明,鉴定到香蕉11个NHX家族基因,分别分布在7条染色体上;大部分MaNHXs基因外显子(14~22)为14个, MaNHX6含有22个外显子;理化性质分析发现大部分MaNHXs蛋白等电点大于8,蛋白质分子质量为57~62 kDa;亚细胞定位预测表明MaNHXs均定位在液泡;与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统发育树分为2个聚类组。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明, MaNHX5蛋白定位于液泡膜。qRT-PCR结果表明香蕉幼苗在200 mmol·L^(-1) NaCl胁迫下, MaNHXs在根、假茎和叶片中均有表达且在不同时间表达差异显著。 | 徐亚 滕梦鑫 何岳东 乔飞 李新国 | 2021 | 植物生理学报2021,57,3: | 9 |
| 6 | 木薯C2H2型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析显示文摘锌指蛋白转录因子(zinc-finger protein transcription factor, ZFP)是一种具有特定结构的蛋白,是真核生物重要转录因子之一,其通过与核内其他因子相互作用,调控各种生理反应,参与植物的生长发育和生物与非生物胁迫。目前对木薯锌指蛋白家族的研究依然较少。本研究利用木薯基因组数据库筛选鉴定了85个木薯C2H2型锌指蛋白转录因子家族成员,利用生物信息学手段分析该家族基因的结构特征和理化性质,结果表明同一C2H2型锌指蛋白家族的基因结构及氨基酸序列长度存在显著差异,大致可分为6个亚家族,各成员具有特征性的锌指结构域,但数量上存在差异;染色体定位显示该家族成员并非定位于木薯所有的18条染色体,在13号和16号染色体上没有C2H2型锌指蛋白家族成员定位。结合已有的转录组数据分析其在不同组织及非生物胁迫下的表达模式,发现各成员在不同组织中的表达模式不同,各组织均有高表达的基因,部分成员无组织表达差异,部分家族成员响应非生物胁迫。因此,木薯C2H2型锌指蛋白转录因子在植物生长发育和响应非生物胁迫功能方面具有重要的作用。 | 井建玲 张鹏 王振宇 马秋香 | 2020 | 植物生理学报2020,56,12: | 9 |
| 7 | 辣椒属GRF基因家族全基因组鉴定和表达分析显示文摘生长调节因子(Growth-regulating factor,GRF)是一类植物特异的转录因子,其作用涉及植物的生长发育、胁迫和激素信号响应等各个方面。目前还没有关于辣椒GRF的相关报道。利用BLASTP和隐马科夫模型(HMM)在辣椒属(Capsicum)5个参考基因组数据库鉴定了52个GRF家族成员。通过分析发现辣椒GRF转录因子长度为200~745 aa,分子量23~81 kD,理论等电点5.9~9.5。保守结构域和基序分析发现,大多数辣椒GRFN端具有QLQ和WRC保守结构域,C端至少具有FFD、TQL和GGPL结构域之一;少数GRFN端仅具有WRC结构域,C端缺乏保守序列。系统进化分析发现,辣椒GRF转录因子分为5个群,位于同一群的GRF保守结构域位置、基序组成、基因结构相似,辣椒GRF与番茄GRF具有一一对应的进化关系。转录组数据分析表明,CaGRF8在辣椒果实发育早中期表达量高,CaGRF4在果实发育后期表达量较高;低温、干旱、盐和赤霉素处理后辣椒幼苗CaGRF表达量发生明显变化,CaGRF8受到赤霉素诱导表达量升高,而CaGRF4的表达被赤霉素抑制。 | 赵慧霞 李凤霞 郭瑞 陈禅友 | 2020 | 园艺学报2020,47,11: | 9 |
| 8 | 基于转录组分析不同强度红光对茶树苯丙烷类代谢的影响显示文摘为探究不同强度红光对茶树苯丙烷类代谢的影响,通过高通量测序技术对不同强度红光处理的福建水仙茶树新梢进行转录组测序,其中以白色LED灯(100μmol;m;s;)为基础光照,补充3个不同强度红光即120、240、480μmol^(-2)m^(-2)s^(-1).结果显示:补充3个不同强度红光与对照相比,分别检测到1 693个(上调408和下调1 285)、879个(上调135和下调744)和6个(上调3和下调3)差异表达基因.利用GO和KEGG数据库,对差异基因进行代谢通路富集分析,发现补充120和240μmol^(-2)m^(-2)s^(-1)红光茶树的差异基因显著富集在苯丙烷类生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢等代谢通路中.利用实时荧光定量PCR验证了随机挑选的9个差异基因(其中4-香豆酸辅酶A连接酶(TEA034012)、乙醛脱氢酶(TEA033457)、肉桂醇脱氢酶(TEA025404)和咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(TEA030958)是苯丙烷类代谢途径的基因)在不同强度红光处理的相对表达量,结果与转录组测序结果的变化趋势一致.本研究表明4CL、CAD和COMT可能是红光调控下苯丙烷类生物合成代谢途径中的关键基因,该结果可为茶树次生代谢机制的调控研究提供借鉴. | 谷梦雅 王鹏杰 金珊 陈思肜 郑知临 赵峰 叶乃兴 | 2021 | 应用与环境生物学报2021,27,6: | 9 |
| 9 | 非数字原生企业数字化转型实践与认识——以中海石油智能油田建设示范项目为例显示文摘在工业4.0背景下,企业数字化转型已成为必然。对比数字原生企业,非数字原生(传统)企业实施数字化转型具有数据基础薄弱、技术路线适应性差、保障能力不足的特点。在阐述企业数字化转型基本认识基础上,从基层实践认识出发,系统地论述非数字原生企业数字化转型难点、数据管理、技术路线、组织保障,总结了'3专+3A'数据治理方法,明确以'云化+平台化+云边协同+敏捷开发与交付'的技术路线,引入V&V'第三只眼'做质控保障,并建议组建专职队伍,以协助公司决策层推动、质控、巩固、优化数字化转型成果。应用实践表明,研究成果可为同类型企业的数字化转型工作提供参考。 | 林杨 | 2021 | 石油钻采工艺2021,43,4: | 8 |
| 10 | 烟草非特异性脂质转移蛋白基因家族的鉴定与分析显示文摘植物非特异性脂质转移蛋白(non-specific lipid transfer proteins, nsLTPs)可以在体外转移脂质,调节植物的生长发育以及对环境非生物和生物胁迫作出反应等。本研究从烟草栽培品种K326 (Nicotiana tabacum L.)基因组中鉴定出74个nsLTPs基因,对其系统发育关系、基因结构、保守基序、染色体定位、基因重复、启动子顺式作用元件、3D结构和激素与非生物胁迫处理下的表达模式进行了分析。结果表明,根据8个半胱氨酸之间的间隔和序列相似性将其分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ、Ⅷ和ⅩⅢ八种类型,相同类型的NtLTPs具有相似的内含子-外显子基因结构和保守基序模式, motif 2和motif 3是NtLTPs基因家族的特征基序。在进化过程中,片段重复是NtLTPs基因家族扩展的主要原因,干旱处理后的RNA-seq分析发现,在进化过程中,不同基因重复事件发生后功能分化模式存在差异。启动子分析表明,它们含有多种光反应、激素和非生物胁迫响应顺式作用元件。进一步采用qRT-PCR分析发现, NtLTPs家族基因在烟草植株的不同组织和器官中具有不同的表达模式,可以响应干旱、盐等非生物胁迫以及IAA、GA、SA等激素处理。研究结果为深入分析NtLTPs家族基因的功能提供了理论参考,并为进一步的分子育种提供了理论基础。 | 李鹏 刘彻 宋皓 姚盼盼 苏沛霖 魏跃伟 杨永霞 李青常 | 2021 | 作物学报2021,47,11: | 8 |
| 11 | 香蕉GLP基因家族全基因组鉴定及表达分析显示文摘为揭示香蕉类萌发素蛋白(GLP)功能,对香蕉GLP基因家族(MaGLP)进行了全基因组鉴定,分析了基因结构、染色体分布和启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)分布情况以及编码蛋白的理化性质、保守基序、进化关系,同时基于转录组的结果研究它们在4℃和45℃处理的叶片、枯萎病菌FocTR4处理的根系以及自然成熟和乙烯催熟的不同成熟阶段的果实中的表达情况。结果显示:MaGLP家族共有44个成员,编码区CDS序列长度为567~2103 bp,分布于除10号染色体外的所有染色体上。大部分GLP基因包含1~2个外显子,多数GLP具有信号肽且主要定位在胞外。进化树分析发现,MaGLP可分为8个亚家族,其中亚家族M为香蕉特有。顺式作用元件和TFBS预测结果显示,MaGLP启动子区存在多种植物激素和逆境胁迫相关响应元件以及7种TFBS。MaGLP成员在香蕉不同组织部位中的表达水平差异较大且受多种胁迫调控。其中MaGLP5-1和MaGLP9-8对各种处理均有响应,MaGLP1-2和MaGLP9-4受高温、低温胁迫抑制,而Ma GLP9-6受高温、低温胁迫诱导,MaGLP5-4受高温和FocTR4调控,Ma GLP4-4仅响应高温胁迫。研究结果表明Ma GLP在香蕉抵御逆境过程中发挥重要作用。 | 刘范 田娜 孙雪丽 刘嘉鹏 伍俊为 黄玉吉 程春振 | 2020 | 园艺学报2020,47,10: | 8 |
| 12 | 菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析显示文摘【目的】筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考。【方法】以‘台农16号’菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRTPCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况。【结果】共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族。菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5~AcTCP9均含有乙烯响应元件。表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍。【结论】鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关。 | 阮城城 胡福初 罗志文 王祥和 郭利军 李玉静 范鸿雁 韩冰 陈哲 张治礼 | 2020 | 果树学报2020,37,11: | 8 |
| 13 | 红仁核桃自然杂交后代不同表型叶片差异表达CHS基因的鉴定及生物信息学分析显示文摘【目的】查尔酮合成酶(CHS)是植物黄酮类化合物合成途径中的第一个关键酶,探究关键CHS基因在红仁核桃花青苷生物合成过程中的功能,为探明红仁核桃花青苷合成的分子机制提供理论基础。【方法】以红仁核桃自然杂交后代不同表型(红叶和绿叶)株系3个发育时期的叶片为试材,观察颜色表型变化并测定其花青素含量,进一步通过转录组测序结果构建核桃CHSs基因表达图谱,筛选获得4个显著差异表达的JrCHS基因JrCHS1~JrCHS4,并利用生物信息学方法对相关序列、理化性质及结构功能进行预测分析。【结果】两种叶片在不同发育时期的颜色表型及花青素含量均存在显著差异;4个JrCHS基因在不同表型叶片的各发育时期均有表达,且均在时期1红叶中的表达量显著高于绿叶,与颜色表型变化及花青素含量呈正相关。生物信息分析表明,4个JrCHS基因分别位于不同染色体上,均只含有1个内含子结构,分布差异较小;各基因编码蛋白主要分布于细胞质中,蛋白保守结构域数量及位置、CHS功能结构域数量均相同,属于亲水酸性蛋白质,不存在跨膜结构;二级、三级结构预测显示该蛋白以α螺旋为主;通过与其他物种花青苷合成相关CHS蛋白进化分析发现,JrCHS1和JrCHS2与金花茶CnCHS、杜鹃花RsCHS及蓝莓VaCHS亲缘关系较近,JrCHS3与毛果杨PtCHS、荔枝LcCHS以及龙眼DlCHS亲缘关系较近,JrCHS4与木薯MeCHS及石榴PgCHS1、PgCHS2亲缘关系较近,表明其功能也较为相似;分析启动子顺式作用元件发现,4个JrCHS基因启动子序列中均包含多个MYB、MYC转录因子结合位点。【结论】4个JrCHS基因及其编码蛋白的结构与功能等较为相似,可能为红仁核桃自然杂交后代不同表型叶片花青苷代谢相关差异表达基因。 | 赵伟 李琳 刘永辉 章露露 杨莹 孟海军 王磊 吴国良 | 2021 | 果树学报2021,38,2: | 8 |
| 14 | 白菜PRX基因家族的鉴定与生物信息学分析显示文摘为深入研究白菜(Brassica rapa)第Ⅲ类过氧化物酶(classⅢperoxidases,PRX)家族基因(BrPRX)的相关功能,通过全基因组分析技术鉴定其家族成员,并对其进行生物信息学分析。结果表明:白菜基因组共有121个PRX基因,含有0~9个数量不等的内含子,在染色体上呈不均等分布,并有多对基因串联重复;系统进化树分析将白菜与拟南芥PRX家族基因分成5个簇;共线性与Ka/Ks分析表明,白菜和拟南芥之间有较高的同源性,且大部分BrPRX家族基因在进化中受到纯化选择;顺式作用调控元件分析发现,8个BrPRX基因与激素响应调节、光响应和抗逆等相关;此外,转录组数据表明,BrPRX基因具有组织表达特异性,且部分BrPRX基因在雄性不育材料中下调表达。上述研究结果为进一步研究白菜PRX基因功能奠定了基础。 | 陈国户 王浩 李广 唐小燕 汪承刚 张磊 侯金锋 袁凌云 | 2020 | 浙江大学学报(农业与生命科学版)2020,46,6: | 7 |
| 15 | 油茶NAC基因鉴定及对干旱胁迫响应分析显示文摘【目的】NAC是参与调控植物逆境胁迫反应的一类特异转录因子,在植物应对干旱胁迫中具有重要的调控作用。油茶是南方丘陵山地重要的经济树种,主产区夏季干旱严重影响了油茶生产。研究油茶应对干旱胁迫的响应机制具有重要意义。【方法】为明确油茶NAC基因家族成员并探究其对干旱胁迫响应的表达特征,本研究以油茶全长转录组为参考,通过蛋白序列比对和保守功能域,鉴定了67个CoNAC基因家族成员,进一步明确了各基因的结构、理化性质、系统进化关系、亚细胞定位。基于油茶干旱转录组数据,明确各CoNAC在油茶不同干旱程度和复水下的表达水平,并采用qPCR对CoNAC在不同油茶品种和不同干旱胁迫程度下的表达特征进行验证。【结果】根据系统发育关系,67个CoNAC可分为17个亚类,其中ANAC2亚类最多,有13个成员。亚细胞定位预测表明,大部分CoNAC蛋白都定位在细胞核,少数定位在细胞质、线粒体、叶绿体或细胞外。基于不同干旱程度和复水的转录组高通量测序数据,研究发现CoNAC基因表达模式存在一定差异。其中,在中度和重度干旱胁迫期,CoNAC28、51、52、56、60和61等基因的表达量随着干旱胁迫程度加强而持续增加。复水后,CoNAC28、51、52、56、60和61等基因均无表达或表达呈明显下降趋势。qPCR验证结果显示,在干旱胁迫和复水后,4个候选的CoNAC基因均表现出较为相似的表达趋势,即在干旱处理时表达量均呈显著上调,复水后下调,这与转录组表达谱结果基本相同。而候选CoNAC51和CoNAC52基因的表达趋势在干旱和复水后存在在品种间差异。在耐旱性较弱的长林18中,CoNAC52在干旱胁迫和复水后表现为先下调后上调,而CoNAC51基因表达量呈上升趋势。在相对较耐旱长林53中,2个基因的表达模式均呈现随着干旱胁迫上调,复水后下调。由此说明它们的表达调控在不同油茶品种中对水分的敏感程度不同,不同油茶品种对干旱胁迫的响应机制存在差异。【结论】CoNAC基因表达与油茶抗旱性有关,且CoNAC51和CoNAC52在不同油茶品种的表达模式差异能在一定程度上帮助解析油茶的耐旱机制。本研究为油茶NAC转录因子进一步功能分析奠定了理论基础,为油茶耐旱性的遗传改良提供参考依据。 | 曹瑞兰 李知青 欧阳雯婷 胡冬南 周增亮 苏文娟 陈霞 刘娟 | 2021 | 江西农业大学学报2021,43,6: | 7 |
| 16 | 辣椒PEBP基因家族的全基因组鉴定、比较进化与组织表达分析显示文摘植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(Phosphatidyl ethanolamine-binding protein,PEBP)分为MFT、FT和TFL1共3个亚家族,其中FT和TFL1亚家族蛋白构成了植物的成花激素—抗成花激素系统,调控开花时间和株形结构。基于辣椒(Capsicum annuum)全基因组数据,对辣椒PEBP基因家族进行鉴定,并对基因和蛋白结构、比较进化、共线性和组织表达特征等进行了分析。结果表明,辣椒基因组包含9个PEBP成员,并且9个基因均含有4个外显子和3个内含子,定位在6条染色体上,其编码蛋白质定位在细胞质和细胞核中。与番茄PEBP同源基因的比较进化分析表明,辣椒的PEBP基因受纯化选择,其中CaFT2和CaFT4在进化中较稳定,辣椒和番茄之间存在8对共线性基因。qRT-PCR分析表明CaPEBP基因在所检测的组织中明显差异表达,如CaMFT/CaTFL1-1在果实中高表达,CaFT1在叶片中相对表达量最高,Ca FT3在顶端分生组织和花中表达量最高,CaTFL1-4在根中特异表达。 | 牛西强 罗潇云 康凯程 黄先忠 胡能兵 隋益虎 艾昊 | 2021 | 园艺学报2021,48,5: | 7 |
| 17 | 不同来源山楂叶化学成分比较分析显示文摘利用UHPLC-Q-TOF/MS;结合UNIFI数据分析平台和多元统计方法对山楂(来自野生)和山里红(来自栽培)两个来源山楂叶的化学成分及差异性成分进行分析与鉴定。从山楂叶中共分析鉴定化学成分58个,包括有机酸、黄酮、三萜酸、单萜及倍半萜类成分,其中萜类成分最为丰富。同时利用主成分分析(PCA)及正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)对2个来源山楂叶的差异性成分进行分析,发现24个差异成分主要为黄酮和萜类成分(包括单萜、倍半萜和三萜酸),且野生的山楂叶中黄酮(如芦丁、牡荆素-2’’-O-鼠李糖苷、异牡荆素-2’’-O-鼠李糖苷、金丝桃苷、槲皮素-3-O-β-D-吡喃葡萄糖苷)和萜类(如山楂酸、科罗索酸和熊果酸)比栽培的山里红丰富,其含量也相对较高。该研究全面反映了《中国药典》中2个法定来源山楂叶化学成分的差异,为山楂叶药材基原的选择以及合理开发利用提供了依据。 | 郑伟 周茗 王双艳 李齐 张洁 赵晔 郑晓晖 郭宝林 马百平 | 2021 | 药学学报2021,56,12: | 7 |
| 18 | 小桐子半胱氨酸蛋白酶家族和相应miRNAs的鉴定及其对低温锻炼的响应显示文摘小桐子(Jatropha curcas)是一种极具潜力的能源植物及冷敏植物, 12°C低温锻炼可显著提高其耐冷性。在全基因组水平上对小桐子半胱氨酸蛋白酶家族及靶向其基因的miRNAs进行鉴定、生物信息学分析和表达特性分析,并对该基因家族成员与miRNAs互作参与调控小桐子对低温锻炼的响应进行解析。结果表明,在小桐子基因组中共鉴定到39个半胱氨酸蛋白酶基因,定位于11条染色体上,可分为6个亚家族(C1A、C2、C12、C13、C14和C15),编码181–2 158个氨基酸残基的多肽,均具有Cys和His活性位点。基于miRNA组和降解组测序结果,发现有283个miRNAs靶向调控小桐子半胱氨酸蛋白酶基因家族的14个成员。对靶向JcDEK1、JcRD21B和JcXBCP3L的miRNAs在12°C低温锻炼过程中的共表达分析表明,这些miRNAs参与半胱氨酸蛋白酶基因表达的调控,且这种调控可能与低温锻炼诱导的小桐子耐冷性增强有关。研究结果有助于深入理解小桐子半胱氨酸蛋白酶基因家族功能及其与相应miRNAs的互作,以及通过互作调控小桐子对低温的响应。 | 吴丹丹 陈永坤 杨宇 孔春艳 龚明 | 2021 | 植物学报2021,56,5: | 6 |
| 19 | 杧果RAV基因家族全基因组鉴定及表达分析显示文摘RAV蛋白是一类植物特有的转录因子,在植物生长发育和抗逆过程中发挥重要作用,目前在杧果(Mangifera indica)中尚未报道。本研究对杧果MiRAV进行了全基因组鉴定,并利用已公布的转录组数据和实时荧光定量PCR(qPCR)实验分析了它们在不同组织(包括成熟叶片、成熟树皮、种子、根、花、果肉和果皮)、不同发育阶段果肉和果皮中,以及采后低温和热水处理下的表达情况。结果表明,杧果中共有6个RAV基因家族成员。基因组定位发现MiRAV分布于5条不同的染色体。联合拟南芥(Arabidopsis thaliana)、番茄(Solanum lycopersicum)、辣椒(Capsicum annuum)、酸橙(Citrus×aurantium)的RAV蛋白进行系统发育分析,发现共可分为5个亚组。MiRAV蛋白分布在第II和IV亚组,同一亚组间有相似的保守基序和保守结构域分布。共线性分析发现,MiRAV存在6对片段重复基因,推测MiRAV家族的扩张可能与片段复制事件有关。选择压分析发现,共线性基因对非同义替换/同义替换(K_(a)/K_(s))值远小于1,说明MiRAV在进化过程中可能主要受到纯化选择作用。顺式作用元件分析显示,MiRAV含有光响应元件数量最多,其次是激素响应元件,以及部分生物与非生物胁迫和生长发育相关元件。表达分析发现,MiRAV在‘Alphonso’杧果不同组织中的表达具有偏好性,MiRAV2和MiRAV3主要在果皮中发挥作用,MiRAV4主要果肉中发挥作用。MiRAV2、MiRAV3和MiRAV4与杧果果实发育和成熟以及应答逆境胁迫有关,MiRAV3还与‘肯特杧’应对低温造成的损伤应激和热水处理后‘Ataulfo’杧果果实软化有关。本研究较为全面地对MiRAV家族进行了鉴定和分析,为进一步探究RAV基因在杧果果实发育过程中的调控机制提供参考。 | 杨成坤 彭文丽 岳晓琦 廖海枝 张月 马武强 | 2021 | 植物生理学报2021,57,4: | 6 |
| 20 | 不同顶空进样技术结合多同位素内标法对香气物质定量分析的选择性差异显示文摘采用顶空固相微萃取(solid phase microextraction,SPME)、微阱捕集(in-tube extraction,ITEX)、吹扫捕集(purge trapping,P&T)、静态顶空4种不同顶空进样方式结合气相色谱-质谱联用技术对含有57种挥发性化合物的溶液进行定量分析。结果表明,使用SPME可检出45种化合物(PDMS/DVB萃取头),ITEX可检出41种化合物,静态顶空可检出31种化合物,P&T可检出20种化合物。总体而言,ITEX更易检出醛类、烃类化合物(醛类定量限为20 ng/mL,烃类定量限为10 ng/mL),SPME对于醇类、酯类化合物更敏感(定量限均为20 ng/mL),P&T和静态顶空更适合于低沸点化合物的定量。食品基质对SPME和ITEX的影响较小,SPME与ITEX结合能够有效提高获得的食品香气指纹信息的完整性与准确性。本研究结果通过对比不同顶空进样技术的定量能力,并分析多种进样方式结合实现香气信息完整识别的可行性,为食品香气分析提供理论依据。 | 马丽鑫 郑旭 黄旭辉 孙浩媛 徐献兵 董秀萍 秦磊 | 2021 | 食品科学2021,42,24: | 6 |