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| 1 | ISSR分子标记技术在植物种质资源研究中的应用显示文摘ISSR是在SSR基础上发展起来的一种分子标记技术,兼具SSR、RAPD、RFLP、AFLP等分子标记的优点。本文综述了ISSR分子标记技术在种质资源鉴定和指纹图谱构建、遗传多样性和亲缘关系、基因定位和分子标记辅助选择等方面的研究进展。 | 朱岩芳 祝水金 李永平 马文广 郑昀晔 胡晋 | 2010 | 种子2010,29,2: | 95 |
| 2 | 采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性显示文摘用随机扩增多态DNA (RAPD)和inter_简单重复序列 (ISSR)标记对分别来自中国海南和云南 2 0个居群的疣粒野生稻 (Oryzagranulata (NeesetArn .exWatt.) )混合样品 ,以及海南 (M5 )和云南 (M2 7) 2个居群各 2 0个植株的遗传多样性进行了检测。在混合取样的居群中 ,2 0个RAPD引物和 12个ISSR引物分别扩增出 2 0 9和 12 2条带 ,多态条带比率 (PPB)分别为 6 4.11%和 72 .95 %。对于分单株取样的居群 ,在M5中 ,两种标记分别扩增出 146和 95条带 ,PPB值分别为 2 1.48%和 34 .78%。在居群M2 7中 ,则分别扩增出 15 1(PPB =17.2 2 % )和 94(PPB =19.15 % )条带。结果表明 ,中国的疣粒野生稻在物种水平的遗传多样性较低 ,其遗传变异主要存在于海南和云南两地之间 ,而在居群内的遗传多样性水平很低。基于Jaccard遗传相似性系数的UPGMA聚类和基于多态条带表型的主成分分析 (PCA)都将中国的疣粒野生稻分为来自海南和云南两类 ,两地间该物种的平均遗传相似性分别为 0 .5 96(RAPD)和 0 .5 11(ISSR) ,其间产生了相当程度的遗传分化。对比RAPD和ISSR在PCR反应中的稳定性和检测变异的能力表明 ,对于实验条件的稳定性而言ISSR优于RAPD ,且总的来说ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异。Mantel检测表明 ,在物种水平 。 | 钱韦 葛颂 洪德元 | 2000 | Acta Botanica Sinica2000,42,7: | 280 |
| 3 | 简单重复序列区间(ISSR)引物反应条件优化与筛选显示文摘以豆科沙冬青(Ammopiptanthusmongolicus)的基因组DNA制备ISSR-PCR模板。通过对聚合酶链式反应(PCR)体系中模板DNA浓度、Mg2+浓度、dNTP的用量、Taq酶的含量以及退火温度梯度进行试验,探讨筛选出清晰、多态性高、可重复性好的ISSR引物的PCR反应条件。用100个ISSR引物进行了PCR扩增,筛选出效果较好的15个引物,得到121个位点,其中43个多态位点,多态位点比例为36%。 | 余艳 陈海山 葛学军 | 2003 | 热带亚热带植物学报2003,11,1: | 152 |
| 4 | 孑遗植物银杏群体遗传多样性的ISSR分析显示文摘采用ISSR分子标记技术 ,对江苏泰兴、美国纽约的栽培银杏 (Ginkgobiloba)群体和中国 3个可能为野生的银杏自然群体 (浙江西天目山、贵州务川、湖北大洪山区 )的遗传多样性水平和群体遗传结构进行了研究。用 13个引物对 5个群体共 66个样品进行扩增 ,共得到 88个清晰的扩增位点 ,其中多态性位点 62个 ,多态位点百分率 (PPB)为 70 .45 %。POPGENE分析结果表明 :与其他裸子植物相比 ,银杏具有丰富的遗传变异 (He=0 .2 40 8;Ho=0 .3 5 99)。贵州务川群体的遗传多样性水平最高 (PPB =5 6.82 % ,He=0 .2 0 89,Ho=0 .3 0 87) ,江苏泰兴栽培群体(PPB =3 4.0 9% ,He=0 .12 69,Ho=0 .185 8)和美国纽约的栽培群体 (PPB =2 3 .86% ,He=0 .0 884,Ho=0 .13 12 )的遗传多样性水平较低。Nei’s遗传多样性分析和AMOVA分析表明 ,3个可能的自然群体间出现了一定程度的遗传分化(Gst=0 .1476,Фst=14.2 6% )。群体间一定程度的遗传分化可能是人为选择压力和基因流障碍引起的。根据Nei’s遗传距离矩阵分别构建了群体间和个体间的遗传关系树状图。由UPGMA聚类分析可知 ,贵州务川群体与浙江西天目山群体优先聚类 ;美国纽约群体与湖北大洪山群体具有较近的亲缘关系 ,它们可能为同一野生群体的后裔。通过对银杏群体遗传结构的分析? | 葛永奇 邱英雄 丁炳扬 傅承新 | 2003 | 生物多样性2003,11,4: | 129 |
| 5 | ISSR及其在果树上的应用显示文摘ISSR是一种基于微卫星序列发展起来的新的分子标记,具有简便、稳定、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传,大部分ISSR标记为显性标记。综合有关文献就ISSR的原理、操作及其在果树种质鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系分析和遗传图谱构建等方面的应用和进展进行简要的阐述。 | 张青林 罗正荣 | 2004 | 果树学报2004,21,1: | 108 |
| 6 | 正交设计优化不结球白菜ISSR反应体系研究显示文摘利用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物、甘油4种因素3个水平,对不结球白菜ISSR反应体系进行优化,确立了适合不结球白菜的ISSR反应体系:在20μL反应体系中,含1×PCRbuffer,1.5mmol·L-1MgCl2,200μmol·L-1dNTP,0.5μmol·L-1引物,1%甘油,30ng模板DNA,1UTaqDNA聚合酶.通过梯度PCR测验,确定了适宜的退火温度. | 王彦华 侯喜林 徐明宇 | 2004 | 西北植物学报2004,24,5: | 113 |
| 7 | 利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱显示文摘在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱。筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱。结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2~3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析。 | 魏臻武 | 2004 | 草业学报2004,13,3: | 97 |
| 8 | 利用RAPD和ISSR分子标记分析地黄种质遗传多样性显示文摘用RAPD与ISSR技术对地黄的 8个品种和 2个脱毒品系进行了种质遗传多样性分析。分别从 80条RAPD引物和 4 4条ISSR引物中筛选出适合地黄种质分析的 17条RAPD引物和 10条ISSR引物用于RAPD和ISSR分析。 17条RAPD引物共扩增出 177条带 ,多态性位点数为 10 9;多态性位点比率为 6 1 5 8% ;平均多样性指数 (I)为0 3135 ;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 36 4 1;10条ISSR引物共扩增出 110条带 .多态性位点数为 79;多态性位点比率为 71 5 8% ;平均多样性指数 (I)为 0 35 77;每个位点的有效等位基因数 (Ne)是 1 4 0 37。基于扩增条带数据库建立了各自的Jaccard遗传相关系数矩阵 ,构建了相似的分子树状图 ,将 10个供试材料分为 2类 :一类群含组培 85 5、大田 85 5、组培 930 2、大田 930 2、金状元和金白 6个材料 ;另一类群含北京 1号、大红袍、地黄 910 4和野生地黄 4个材料。两种分子标记的分析结果呈极显著正相关 (r=0 6 4 9)。结果表明 ,RAPD与ISSR标记适合于地黄种质遗传多样性分析 。 | 周延清 景建洲 李振勇 张宝华 贾敬芬 | 2004 | 遗传2004,26,6: | 71 |
| 9 | 披碱草属12个物种遗传多样性的ISSR和SSR比较分析显示文摘为了比较ISSR和SSR标记在披碱草属(ElymusL.)植物研究中的可应用性,用33个ISSR引物和137对小麦SSR引物对该属12个物种进行了分析。筛选出18个ISSR引物和14对小麦SSR引物可用于遗传多样性分析。12个物种的PCR分析表明,18个ISSR引物和14对SSR引物的多态性位点百分率分别为84%和91%,均表现出较高多态性,基于两种标记的种间聚类状况与物种的倍性水平和形态学相似程度存在较高一致性。在12个种间,ISSR的标记指数MI值(10.2)为SSR(4.3)的2.4倍,表明ISSR具有更大的标记效率;但在亲缘关系较近的肥披碱草、圆柱披碱草、麦宾草和披碱草等4个种间,SSR具有更大的标记效率。Mantel检测显示,在12个种间两种标记的遗传相似性显著相关(r=0.856,t=6.446),但在4个近亲缘关系种间相关不显著(r=0.679,t=1.595)。两种标记的标记效率和相关性在不同亲缘关系水平上的改变,说明不同的标记具有不同的多态性检测范围。 | 李永祥 李斯深 李立会 杨欣明 李秀全 | 2005 | 中国农业科学2005,38,8: | 73 |
| 10 | 部分烟草种质遗传多样性与亲缘关系的ISSR标记分析显示文摘本文应用ISSR标记,对烟草属(Nicotiana)4个种30份材料的遗传多样性进行了分析。从70个ISSR引物中共筛选出16个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对30个样品DNA共扩增出309条谱带,平均每个引物扩增出19.31条带,多态性条带比率(PPB)达93.20%。种间遗传相似系数在0.26-0.96之间,表现出丰富的遗传多态性。系统聚类结果显示,N.glutinosa和N.suaveolens、N.gossei 3个野生种间存在较大的遗传差异,遗传相似系数在0.29.0.52之间;27份栽培品种种内遗传相似性相对较高,在0.54-0.96之间,显示出栽培种内的遗传基础相对比较狭窄,但其中白肋2l、台烟7号与其他供试材料有较大的遗传差异。ISSR聚类分析表明,当11取值为D=0.475时,可将3个野生种与27份烟草栽培品种明显区分开,反映出种间的遗传差异;当k取值为D=0.776时,可将30份材料分为2个大类、3个小类和6个独立的个类,较好地揭示了烟草属种间或栽培种品种类型间的遗传多样性与亲缘关系,可为烟草遗传育种和遗传连锁图谱构建的杂交亲本选择提供科学依据。本研究还表明,ISSR标记比RAPD标记具有更高的稳定性,在植物遗传多样性的分子标记或克隆研究中,可优先使用ISSR标记。 | 祁建民 王涛 陈顺辉 周东新 方平平 陶爱芬 梁景霞 吴为人 | 2006 | 作物学报2006,32,3: | 66 |
| 11 | 我国茶树无性系品种遗传多样性和亲缘关系的ISSR分析显示文摘利用ISSR分子标记分析了我国36个主要茶树无性系品种的遗传多样性和亲缘关系。结果表明20个ISSR引物在供试品种中共扩增出368条谱带,其中多态性条带占总条带的99.7%,引物的多态性信息指数(PIC)平均达0.90。供试品种的基因多样性(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.23和0.38。茶区内茶树品种的遗传多样性低于总体水平,江南和华南茶区主栽无性系品种的多样性高于西南茶区。AMOVA分析表明区域因素引起的变异(占5.6%)远小于品种因素(占94.4%)。供试品种间的相似系数介于0.58~0.84,平均为0.69,显示出我国茶树主栽品种的遗传基础已相对比较狭窄。ISSR聚类分析表明,中国台湾品种金萱与大陆品种的遗传距离较远,形成单独的个类。35个大陆品种聚成一个大类群,其中除宜红早形成独立的个类外,其他品种又聚为3个亚类群。亲缘关系树状图在分子水平上显示了我国主要茶树无性系品种间的亲缘关系,为今后茶树育种亲本的选配提供了理论依据。 | 姚明哲 陈亮 王新超 赵丽萍 杨亚军 | 2007 | 作物学报2007,33,4: | 71 |
| 12 | 烟草种质资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR聚类分析显示文摘【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条(占95.2%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS在0.28~0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62~0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28~0.58之间,平均为0.42,种间遗传差异较大;(3)对91份普通烟草栽培品种的分子系统聚类分析表明:地理来源相同的部分品种有相对聚合现象或少部分国内外品种和类型出现交叉聚类,与其亲缘关系较近有关;个别品种自行一类,与其特异的遗传基础差异较大有关。【结论】ISSR是一种较有效、稳定和可靠的分子标记,本研究可为烟草育种的亲本利用及开展烟草遗传连锁图的构建和核心种质指纹图谱的绘制提供重要的科学依据。 | 梁景霞 祁建民 方平平 王涛 陈顺辉 周东新 陶爱芬 梁康迳 吴为人 | 2008 | 中国农业科学2008,41,1: | 62 |
| 13 | ISSR分子标记及其在植物研究中的应用显示文摘ISSR(inter simple sequence repeat)分子标记是一种以微卫星序列为引物,进行多位点PCR扩增的技术。ISSR技术简易、快捷,同时兼备AFLP(扩增酶切片段多态性)、SSR(简单序列重复)和RAPD(DNA随机扩增多态性)等分子标记方法的优点。引物设计无需预知基因组序列,只要是目标区域的长度在可扩增范围内,就能扩增出微卫星重复序列间的DNA片段。ISSR标记以其高多态性,已被广泛应用于种质收集、品种鉴定、遗传多样性、系统进化关系、遗传作图、基因定位、标记辅助选择、预测基因组SSR基序的丰度以及SSR引物开发等研究。本文对ISSR技术及其在植物研究中的应用进行全面的概述。 | 赵谦 杜虹 庄东红 | 2007 | 分子植物育种2007,5,F11: | 62 |
| 14 | SSR和ISSR分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用显示文摘SSR(SimpleSequenceRepeat)和ISSR (Inter-SimpleSequenceRepeat)技术是在PCR基础上发展起来的两种DNA多态性检测技术 ,已开始应用于基因组研究的各个领域。概述了SSR、ISSR反应的原理、特点 ,总结了其在植物亲缘关系和遗传多态性研究、DNA指纹库的建立、遗传图谱的构建和基因定位及分子标记辅助育种等方面的应用 ,并肯定了SSR。 | 张立荣 徐大庆 刘大群 | 2002 | 河北农业大学学报2002,25,1: | 71 |
| 15 | 苹果品种ISSR指纹图谱构建显示文摘以富士、长富2、长富6、红星、新世纪、美国8号及凉香等7个品种为试材,进行了ISSR(inter-simplesequencerepeats)分析,构建了这几个苹果品种的ISSR指纹图谱。发现引物IS061可将富士、长富2与长富6三个品种一一区分开;而IS026则能将富士、红星、新世纪及美国8号4个品种相互区别开。初步证明利用ISSR标记技术能很好地将不同苹果品种鉴别出来。 | 宣继萍 章镇 房经贵 高志红 车胜利 | 2002 | 果树学报2002,19,6: | 76 |
| 16 | 李种质资源ISSR反应体系的建立显示文摘以5′-(AC)_9 A-3′为引物对牛心李(Prunus salicina cv.Niuxinli)ISSR(inter-simple sequence repeats)反应体系的优化研究表明,25μL ISSR反应体系中,Taq酶、Mg^(2+)、引物、模板DNA和dNTPs5种主要成分的最适浓度分别是:0.3U、1.5mmol/L、0.2μmol/L、20ng和0.16mmol/L。利用该优化体系,以5′-(AC)_9 T-3′为引物,构建了中国李18个品种的ISSR指纹图谱,该引物可将这些品种完全区别开来;以5′-(AC)_9 C-3′为引物,构建了李属6类种质资源的ISSR指纹图谱,该引物区分率为100%。 | 乔玉山 章镇 房经贵 沈志军 赵密珍 | 2003 | 果树学报2003,20,4: | 67 |
| 17 | ISSR-PCR技术在桂花品种分类研究中的应用显示文摘利用ISSR-PCR方法对桂花的19个品种进行了基因组多态性分析,从74个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA条带79条,占总扩增片段的87.8%,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。根据ISSR扩增结果,应用RAPDistance软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。聚类分析的结果把供试桂花的19个品种分为8个大类,并对4个品种群的遗传关系和种下分类系统进行了探讨。 | 邱英雄 胡绍庆 陈跃磊 陈晓 吴光洪 | 2004 | 园艺学报2004,31,4: | 51 |
| 18 | 利用ISSR DNA标记鉴定主要银杏栽培品种显示文摘Ginkgo biloba is one of most famous officinal plant in China. In the past, many varieties were selected and planted, but there is not still identification system for these varieties. This paper studied DNA fingerprints of the main G. biloba varieties cultivated all over the country using ISSR DNA marker. The results indicated ISSR marker was effective highly for identifying 13 varieties. Only using primer ISSR46 and ISSR44, 13 varieties were able to be identified based on 11 polymorphic loci (ISSR46-550,ISSR46-670,ISSR46-740,ISSR46-1000,ISSR46-1159,ISSR46-1359,ISSR46-1600,ISSR44-520,ISSR44-580,ISSR44-660,ISSR44-1750). In addition, we found ISSR marker was stable and repeatable highly compared with RAPD marker. | 沈永宝 施季森 赵洪亮 | 2005 | 林业科学2005,41,1: | 55 |
| 19 | ISSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用显示文摘简单重复序列间扩增(ISSR)技术以其丰富的多态性、共显性遗传、重复性好、操作简单、引物设计简单、实验成本低等优点正广泛用于植物遗传育种的研究中,文章简要介绍了ISSR标记技术的原理、特点、操作要点及在植物遗传图谱构建、基因标记、遗传多样性、种质资源鉴定及植物分类进化研究中的应用。 | 肖海峻 孟利前 李玉冰 | 2006 | 内蒙古农业科技2006,34,4: | 51 |
| 20 | SSR和ISSR标记技术应用进展显示文摘介绍了SSR和ISSR标记的原理和特点,综述了这两种技术在种质遗传多样性、基因定位及分子标记辅助育种、遗传图构建及种子纯度和真伪鉴定等研究中的应用进展,并提出了在烟草遗传育种中应用的建议。 | 蒋彩虹 王元英 孙玉合 | 2007 | 中国烟草科学2007,28,2: | 57 |