PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究

查看全文 作　　者：[1]赵兴青 [1]杨柳燕索引[1]陈灿索引[1]肖琳 [1]蒋丽娟 [1]马喆 [1]朱昊巍 [1]于振洋 [1]尹大强

机构地区：[1]污染控制与资源化研究国家重点实验室南京大学环境学院,南京210093

出　　处：《生态学报》索引2006年第26卷第11期,共7页

基　　金：国家'973'资助项目(2002CB412307);国家重大水环境专项资助项目(2002AA601011);国家自然科学基金资助项目(40371102)~~ 摘　　要：采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp,为16S rDNA V3~V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群,且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大,细菌群落结构具有较高的相似性,而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异,且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外,还分布约5个相同的细菌种群,可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序,结果显示其优势菌群具有不同的序列组成,其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99%,2个序列的同源性为96%和93%,其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。 关键词：沉积物微生物多样性变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16S RDNA 序列测定

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