A pangenomic study of Bacillus thuringiensis

查看全文 作　　者：Yongjun [1,5]Fang;Zhaolong [2,3]Li;Jiucheng [2,3]Liu;Changlong [4]Shu;Xumin [2]Wang;Xiaowei [2,5]Zhang;Xiaoguang [2,5]Yu;Duojun [2,5]Zhao;Guiming [2,5]Liu;Songnian [2,5]Hu;Jie [4]Zhang;Ibrahim Al-[5]Mssallem;Jun [1,2,3,5]Yu

机构地区：[1]James D. Watson Institute of Genome Sciences, College of Life Science, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China;[2]CAS Key Laboratory of Genome Science and Information, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100029, China;[3]Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China;[4]State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China;[5]The Date Palm Genome Project (DPGP), King Abdulaziz City for Science and Technology (KACST), P.O. Box: 6086, Riyadh 11442, Kingdom of Saudi Arabia

出　　处：《Journal of Genetics and Genomics》索引2011年第38卷第12期,共10页

基　　金：supported by a grant from King Abdulaziz City for Science and Technology,Riyadh,Saudi Arabia(No. KACST 428-29);institutional grant from CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information,Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences;supported by the grants from the National Basic Research Program(973 Program)(No.2010CB126604);the Special Foundation Work Program(No.2009FY 120100);the Ministry of Science and Technology of the People's Republic of China and from the National Science Foundation of China(No. 31071163). 摘　　要：杆菌 thuringiensis (B。thuringiensis ) 是一个土壤住所克积极的细菌和它的编码 plasmid 的毒素(叫喊) 通常被用作杀虫剂的生物选择。在 pangenomic 研究,我们定序七 B。thuringiensis 在高范围并且基础质量的使用孤立下一代的定序站台。B。当一个新染色体被增加时, thuringiensis pangenome 被外推有 4196 核心基因和 558 唯一的基因的 asymptotic 价值。比作它一样的类的密切相关的种的 pangenomes, B。thuringiensis pangenome 显示出一个开的特征,类似于 B。仙影拳然而并非到 B。anthracis;后者有关上的 pangenome。我们也在七 B 之中发现了广泛的分叉。thuringiensis 染色体集会,它怀有宽大的重复和单个核苷酸多型性(SNP ) 。在 orthologous 基因之中的身份比 84.5% 大,为染色体变化的热点在 2.32.8 Mb 和 5.05.6 Mb 的 genomic 区域被发现。我们断定在所有差距被关上以前,从多重种类的高范围的顺序集会为 pangenomic 研究是很有用的。 关键词：苏云金芽孢杆菌单核苷酸多态性革兰氏阳性菌蜡状芽孢杆菌核心基因基因组生物农药 SNPS

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