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RNA-seq analysis of prostate cancer in the Chinese population identifies recurrent gene fusions, cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant alternative splicings

查看全文 作　　者：Shancheng [1]Ren;Zhiyu [2]Peng;Jian-Hua [3]Mao;Yongwei [4]Yu;Changjun [5]Yin;Xin [6]Gao;Zilian [1]Cui;Jibin [2]Zhang;Kang [2]Yi;Weidong [1]Xu;Chao [2]Chen;Fubo [1]Wang;Xinwu [2]Guo;Ji [1]Lu;Jun [2]Yang;Min [1]Wei;Zhijian [2]Tian;Yinghui [3]Guan;Liang [1]Tang;Chuanliang [1]Xu;Linhui [1]Wang;Xu [1]Gao;Wei [2]Tian;Jian [2]Wang;Huanming [2]Yang;Jun [2]Wang;Yinghao [1]Sun 高影响力作者 机构地区：[1]Department of Urology, Shanghai Changhai Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China;[2]Beijing Ge- nomics Institute at Shenzhen, Shenzhen, Guangdong 518083, China;[3]Life Sciences Division, Lawrence Berkeley National Labora- tory, One Cyclotron Road, Berkeley, CA 94720, USA;[4]Department of Pathology, Shanghai Changhai Hospital, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China;[5]Department of Urology, Jiangsu Provincial People's Hospital, Nanjing Medical University, Nanjing, Jiangsu 210029, China;[6]Department of Urology, the Third Affiliated Hospital of Sun Yat Sen University, Guangzhou, Guangdong 510630, China高影响力机构 出　　处：《Cell Research》索引2012年第22卷第5期,共16页高影响力期刊 摘　　要：在有前列腺癌症的不同赛跑的病人之中有显著不同;然而,位于这差别下面的机制仍然保持不清楚。这里,我们在场 transcriptome 的一处全面风景用 RNA-seq,越过关于基因熔化的前列腺癌症 transcriptomes 的揭示巨大的差异,长 noncoding RNA (长 ncRNA ) ,其他的拼接和体的变化从中国人口 14 主要前列腺癌症和他们的配对的正常对应物介绍。14 个肿瘤(21.4%) 中的三个在中国病人怀有 TMPRSS2 尔格熔化,和这熔化的低流行进一步在一个另外的肿瘤集合(10/54=18.5%) 被证实。尤其是,二新奇基因熔化, CTAGE5-KHDRBS3 (20/54=37%) 和 USP9Y-TTTY15 (19/54=35.2%) ,在我们的耐心的队经常发生了。介绍的进一步系统的 transcriptional 识别了是在肿瘤表示的差别的众多的长 ncRNAs。在长 ncRNA 和基因的表示之间的关联的分析建议长 ncRNAs 可以在 transcriptional 规定以外有功能。这研究在中国人口产出新卓见进前列腺癌症的致病。 关 键 词：非编码RNA 前列腺癌 中国人群 融合基因 剪接 异常 癌症 基因融合
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参考文献(70)

引证文献(72)

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