Intermolecular recognition revealed by the complex structure of human CLOCK-BMAL1 basic helix-loop-helix domains with E-box DNA

查看全文 作　　者：Zixi [1]Wang;Yaling [2]Wu;Lanfen [1]Li;Xiao-Dong [1]Su

机构地区：[1]State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, and Biodynamic Optical Imaging Center (BIOPIC), Peking University,Beijing 100871, China;[2]National Institute of Biological Sciences, Beo'ing 102206, China

出　　处：《Cell Research》索引2013年第23卷第2期,共12页

摘　　要：钟(生理节奏的运动输出周期不行了) 并且 BMAL1 (大脑和肌肉象 ARNT 一样 1 ) 两个都是在哺乳动物的生理节奏的核心循环的抄写因素。最近出版的老鼠 CLOCK-BMAL1 bHLH (基本 helix-loop-helix ) 舞步(period-ARNT-single-minded ) 建筑群结构为 heterodimer 形成,而是机制仍然是的 protein-DNA 识别的结构的细节使机制清楚些逃犯。这里,我们阐明了人的 CLOCK-BMAL1 bHLH 领域的水晶结构跳了到正规电子盒子 DNA。我们证明钟和 BMAL1 bHLH 领域能互相被选择,并且结合氢的网络调停他们的电子盒子识别。我们识别了在 BMAL1 Ile80 和 flanking 胸腺嘧啶核苷酸之间的恐水病的接触,建议 CLOCK-BMAL1 实际上读 7-bp DNA 并且不以前相信的 6-bp DNA。为了发现潜在的不在经典中的电子盒子那,能被 CLOCK-BMAL1 认出,我们在电子盒子上构造了系统的单个核苷酸的变化并且测量了他们的相关亲密关系。我们与高亲密关系, AACGTGA 和 CATGTGA 定义二个不在经典中的电子盒子模式,在里面它 flanking A7-T7′基础对为识别是不可缺少的。这些结果将帮助我们在 vivo 识别功能的 CLOCK-BMAL1-binding 地点并且寻找控制钟的基因。而且,我们在 bHLH 区域估计了潜在的 phosphorylation 地点的禁止的角色。我们发现 BMAL1 Ser78 上的 phospho-mimicking 变化能高效地堵住有约束力的 DNA 以及在房间废除正常生理节奏的摆动。我们建议 BMAL1 Ser78 应该是调停的关键残余输入调整信号的 transcriptional 抑制让外部暗示乘火车由 kinase 的生理节奏的钟串联。 关键词：DNA结合结构细节分子识别螺旋人类磷酸化位点基因突变昼夜节律

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