Identification of Regulatory DNA Elements Using Genome-wide Mapping of DNase I Hypersensitive Sites during Tomato Fruit Development

查看全文 作　　者：Zhengkun [1,3]Qiu;Ren [1,3]Li;Shuaibin [1,3]Zhang;Ketao [1]Wang;Meng [1]Xu;Jiayang [2]Li;Yongchen [1]Du;Hong [2]YU;Xia [1]Cui

机构地区：[1]Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops of the Ministry of Agriculture, Sino-Dutch Joint Laboratory of Horticultural Genomics, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China;[2]State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research (Beijing), Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;[3]These authors contributed equally to this article.

出　　处：《Molecular Plant》索引2016年第9卷第8期,共15页

摘　　要：开发并且西红柿水果成熟被 transcriptional 规定精确控制,它取决于规章的蛋白质的安排可接近性到倡导者和另外的 cis 规章的 DNA 元素。基因表示上的这可接近性和它的效果在定义发展进程起一个主要作用。为了理解规章的机制和词法、解剖的功能的元素 modulating,在水果开发期间变化,我们产生了 DNase 的染色体宽的高分辨率的地图我从西红柿栽培变种 “Moneymaker” 的水果纸巾的过分敏感的地点(DHS )在 20 点,天张贴开花期以及裂缝舞台。由越过水果发展阶段探索 DHS 的变化,我们指出了与发展特定的基因有关的最可能的过分敏感的地点。由在维生素酸 biosynthetic 小径在这些发展特定的基因或基因的 DHS 上检测有约束力的主题,我们揭示了贡献协调植物成熟的基因抄写的普通规章的元素并且专业化新陈代谢的小径。我们的结果贡献一更好涉及西红柿水果开发的基因的规章的动力学理解并且成熟。 关键词：DNase 我过分敏感的地点 cis 规章的元素基因表示水果开发西红柿

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