枇杷WRKY转录因子鉴定与表达分析

查看全文 作　　者：[1]李晓颖;[1]徐红霞;[1]陈俊伟

机构地区：[1]浙江省农业科学院园艺研究所,杭州310021

出　　处：《园艺学报》索引2019年第46卷第5期,共16页

基　　金：国家青年科学基金项目(31601734);浙江省农业新品种选育重大科技专项果品新品种选育项目(2016C02052-3);浙江省农业科学院院地合作项目(CA20150009;TZ2018006);浙江省农业科学院科技成果示范推广项目(tg2018007);浙江省重点研发计划项目(2018C02011) 摘　　要：以枇杷(Eriobotrya japonica)转录组数据为材料,利用生物信息学手段对枇杷WRKY转录因子进行鉴定与特征分析。分离鉴定出33条具典型WRKY结构域的序列,CDS长度分布在492~2 040bp,命名为EjWRKY01~EjWRKY33。分组鉴定和进化树分析结果显示,枇杷WRKY转录因子可分为3大类,其中Ⅰ类数量为6个,Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22和5个,其中Ⅱ类又进一步分为a~e等5个亚类。WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结构。枇杷WRKY转录因子基因组DNA全长895~3 873 bp,编码的蛋白在163~679个氨基酸范围内,具有1~5个内含子。WRKY启动子顺式作用元件预测结果表明,大部分WRKY启动子序列具有典型的TATA和CAAT元件。将获得的所有WRKY基因与已报道的拟南芥WRKY进行进化比对分析发现,所有EjWRKY转录因子并没有位于独立的分支上,表明枇杷的基因序列虽与拟南芥物种有差别,但枇杷WRKY蛋白在调控植物生物和非生物逆境反应、信号传导、生长发育等方面的功能相似。此外,荧光定量PCR结果显示,大部分EjWRKY均在枇杷的根、茎、叶、花和果实中表达,但相对表达水平不同,说明WRKY家族基因在枇杷的生长发育中可能具有不同的功能。 关键词：枇杷 WRKY转录因子特征分析系统进化组织表达

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