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1甜杨抗冻转录因子ICE1基因的in silico克隆及其分析显示文摘ICE1基因编码类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达。本文采用电子克隆的方法,以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组序列拼接的结果,设计引物并通过RT-PCR从甜杨克隆了杨树的第一个ICE1基因。其cDNA长1706bp,含有完整的开放阅读框,可编码543个氨基酸的MYC类蛋白。编码蛋白序列含有bHLH区,核定位信号(NLS)区,富S区和转膜区各1个。Blast分析表明,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与拟南芥和芥菜的ICE1存在着较高的同源性,说明所获得的cDNA可能是甜杨ICE1基因(PsICE1,DQ481236)。通过网络服务器平台进行PsICE1的功能预测,结果显示PsICE1含有bHLH保守功能域,具有多个磷酸化位点和跨膜区域。另外,ICE1的电子表达谱分析结果发现,ICE1几乎可在植物中整株表达,在多种组织和不同发育过程均表达,这也在一定程度上说明了ICE1是组成型表达,以及ICE1可能在植物的生长发育中也起着重要作用。林元震 张志毅 刘纯鑫 郭海 朱保庆 陈晓阳 2007分子植物育种2007,5,3:38
2火炬松基因资源的育种值预测与选择显示文摘以引自美国的258个不同改良程度的火炬松家系作为试验材料,利用基于混合线性模型的BLUP方法对258个家系14年生树高和胸径的育种值进行预测。首先以不同的模型分别预测半同胞家系和全同胞家系的育种值,再通过构建亲缘关系矩阵预测所有个体的育种值,对各类群家系和个体育种值的差异进行分析。14年生时,在参试的各个类群中,入选率同为15%的情况下,各类群根据胸径育种值共选出优良家系39个;全同胞家系类群入选家系的胸径遗传增益最高,高于群体平均值1.40 cm,达8.56%。以配合选择方式选出优良单株77个,入选率为1%。入选的优良家系可从美国重复引种,为火炬松良种生产服务。根据火炬松核心-主群体育种系统的需要,入选的优良单株可用以充实第2代育种群体,其中10个进入核心育种群体,其余67个进入主群体。精确的BLUP预测值和基于个体育种值的选择将提高遗传改良进程中的选择效率和遗传增益,但在利用这些先进的统计分析方法提升林木良种选育效率的同时,必须对育种方案与试验设计进行改进完善。当参试家系数较多时,可采用平衡不完全区组设计,把所有参试家系统一在一个试验中,科学安排田间试验,以获得最大的成效。刘天颐 杨会肖 刘纯鑫 王金榜 黄少伟 2014林业科学2014,50,8:25
3杨树葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)基因启动子的克隆与分析显示文摘葡萄糖-6-磷酸脱氢酶是磷酸戊糖途径的关键性调控限速酶,其主要功能是为脂肪酸合成、氮还原和谷胱甘肽等生物分子合成提供还原力NADPH,也为核酸合成提供戊糖;此外,还参加非生物逆境胁迫应答反应。因此,G6PDH对植物的生长发育起着非常重要的作用。本文利用甜杨G6PDH基因和毛果杨基因组序列,通过PCR获得了甜杨G6PDH基因上游1400bp的序列。序列分析结果表明,该序列具有启动子的基本元件TATA-box、CAAT-box。此外,还包含多个胁迫诱导元件,如低温诱导元件LTR,盐诱导元件GT-1,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件MYB和MYC,以及光响应元件L-box、G-box、3AF-1、TC丰富区等。林元震 张志毅 郭海 刘纯鑫 陈晓阳 2009基因组学与应用生物学2009,28,3:15
4赤桉抗寒转录因子ICE1基因的分子克隆与表达分析显示文摘ICE1属于一种类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达。本文以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,搜索桉树基因组和EST数据库的同源序列并进行拼接、设计引物,通过RT-PCR从赤桉克隆了桉树的第一个ICE1基因。其cDNA长1792bp,含有完整的开放阅读框,可编码523个氨基酸。BLAST分析表明,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与拟南芥、芥菜、小麦和甜杨ICE1存在着较高的同源性,预示所获得的cDNA可能是赤桉ICE1基因(EcaICE1)。EcaICE1基因表达分析结果显示,EcaICE1在赤桉根、茎、叶中均表达,而且表达水平不受低温胁迫处理时间的影响,这表明EcaICE1是组成型表达。此外,EcaICE1的超表达可以提高转基因烟草的耐低温能力。上述结果为进一步研究EcaICE1在赤桉耐低温胁迫过程中基因表达的调控机制打下基础。林元震 郭海 刘纯鑫 陈晓阳 2011植物生理学报2011,47,5:14
5运用基因组和EST数据库进行电子克隆分离杨树功能基因的策略显示文摘杨树是重要的造林绿化树种,也是主要的工业用材树种,还是高大林木的模式树种。进行杨树功能基因的挖掘、克隆和功能的研究,是当前杨树基因组学的首要任务之一,不仅可为杨树品种改良和基因资源的有效利用奠定基础,而且对探讨林木的生理及遗传特性分子机制也具有重要的理论意义。电子克隆是近年来伴随着基因组计划和EST计划发展起来的基因克隆新方法,具有成本低、速度快、技术要求低和针对性强等优点。丰富的杨树EST数据和公布的杨树基因组序列框架图,使得利用电子克隆技术开展杨树功能基因的分离和鉴定已经成为可能。本文阐述了电子克隆分离杨树功能基因的基本方法、相关的生物信息资源,并讨论了电子克隆技术存在的问题和未来发展。林元震 张志毅 林善枝 张谦 刘纯鑫 郭海 2007分子植物育种2007,5,4:13
6火炬松核心育种群体子代生长变异与选择显示文摘广东省火炬松第1代核心育种群体68个全同胞组合的子代,组成了第2代核心群体的基本群体,在8,10,15年时分别对其树高、胸径和材积生长性状进行研究。结果表明:8,10,15年时,各生长性状在组合间都存在极显著差异。根据15年时各亲本子代的生长表现,选择8个优良母本和4个优良父本,可用于营建精选种子园或控制授粉种子园,生产遗传改良度高的种子。以15年全同胞家系平均材积作为选择指标,共选出10个组合,材积平均增益为18.94%,通过重复制种获得的种子可以用于营建插穗圃,通过扦插繁殖生产优良的全同胞家系苗木;采用配合选择共选出55个优良个体参与构建第2代育种群体,其中30个进入第2代核心群体,其余25个进入第2代主群体。刘天颐 刘纯鑫 黄少伟 钟伟华 陈炳铨 2013林业科学2013,49,2:10
7英德火炬松种子园子代在粤北的生长规律研究显示文摘Trials of 16-26 years old progenies from Yingde Loblolly Pine Seed Orchard were investigated by sample plot investigation.The trial fields were located at Yingde Loblolly Pine Seed Orchard,Yingde Forest Research Institute,Jiuqushui Forest Farm of Wengyuan County,Shaoguan Forest Farm and Renhua Forest Research Institute respectively.The growth process and performance level were studied by stem analysis based on average trees.Compared with that of local Masson pine(Pinus massoniana),the seedlots of loblolly pine(Pinus taeda) from Hubei and the seedlot of slash pine(P.elliottii) from Taishan Slash Pine Seed Orchard,the growth potential of progenies from Yingde Loblolly Pine Seed Orchard in North Guangdong was comprehensively evaluated.The results are as follows: The fast-growing period of height for the progenies from Yingde Loblolly Pine Seed Orchard began at the age of 3 and lasted for five to nine years.For diameter at breast-height(DBH) it began at the age of 5 and lasted for five to eight years.The fast-growing period for volume in Yingde Loblolly Pine Seed Orchard began at the age of 10 and lasted to 25 years old,while it began at the age of 10 both in Yingde Forest Research Institute and Jiuqushui Forest Farm,and at the age of 12 both in Shaoguan Forest Farm and Renhua Forest Research Institute.The progenies from Yingde Loblolly Pine Seed Orchard performed well generally in North Guangdong.Shaoguan and Renhua were suitable for the cultivation of large-dimension timber with the rotation longer than 25 years.In order to cultivate largedimension timber,suitable fertilizer shall be used when the DBH growth reaches the fast-growing period,and thinning operation shall be conducted when the mean annual increment for DBH reaches the maximum.刘纯鑫 刘天颐 黄少伟 罗锐 杨会肖 王爱平 2012林业科学研究2012,25,5:9
8EST-SSR标记在木本植物中的开发和应用显示文摘本文简述EST-SSR的开发策略,重点就其在木本植物遗传研究中的遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、比较作图以及种质资源鉴定的应用现状和存在问题作介绍,并对其应用前景作了展望。林元震 郭海 刘纯鑫 刘天颐 黄少伟 陈晓阳 2009植物生理学通讯2009,45,12:9
9桉树伞房属4个种在广东清新的早期生长表现显示文摘分析了引自澳大利亚东部的桉树伞房属4个种在广东省清新试验点5年生时的生长表现.方差分析表明,树种间、种源间、家系间在树高、胸径、材积生长量上均存在极显著的差异.表现最好的是大叶斑皮桉Corymbia henryi(S.T.Blake)K.D.Hill&L.A.S.Johnson,其次是斑皮柠檬桉C.variegata(F.Muell.)K.D.Hill&L.A.S.John-son、柠檬桉C.citriodora(Hook.)K.D.Hill&L.A.S.Johnson和斑皮桉C.maculata(Hook.)K.D.Hill&L.A.S.Johnson.4个树种的平均树高为8.04 m,平均胸径为7.28 cm,平均单株材积为0.021 9 m3.其中斑皮柠檬桉10248种源44号家系的生长量最大,其平均树高为10.35 m,平均胸径为9.70 cm,平均单株材积为0.040 00 m3.初步选出20个家系,占家系总数的21.98%.刘天颐 刘纯鑫 林元震 黄少伟 2009华南农业大学学报2009,30,4:8
10桉树伞房属4个种在广东乐昌的早期生长表现显示文摘采用随机完全区组设计、方差分析及Duncan’s检验等方法分析了引自澳大利亚的桉树伞房属4个种在广东省乐昌试验点3年生和5年生2个年度的生长表现,并根据5年生时的生长表现对种源和家系进行初步选择.2个试验组内不同年度间方差分析结果显示:各生长指标在试验组内树种间的表现并不统一,目前尚不能进行树种选择;试验组Ⅰ内2个年度方差分析结果显示除3年生时胸径的生长差异不显著外,其余指标在种源间都为显著差异,试验组Ⅱ内2个年度除5年生时平均单株材积为差异不显著外,其余指标在种源间均为显著差异;2个试验组内不同年度间各生长指标在家系间都为显著差异.这4个树种生长量最大的是大叶斑皮桉Corymbia henryi,其次是柠檬桉C.citriodora、斑皮柠檬桉C.variegata和斑皮桉C.maculata,平均单株材积分别为0.020 15、0.018 77、0.014 25和0.006 25 m3.初步选择出平均单株材积高于CK2的种源和家系,即柠檬桉111 90种源,斑皮柠檬桉的5 567、10 248、10 253种源及分别来自柠檬桉、斑皮柠檬桉和大叶斑皮桉的26个家系,占家系总数的30.59%.刘天颐 刘纯鑫 孔凡启 李庆芳 高永 周晓文 王爱平 黄少伟 2011华南农业大学学报2011,32,2:8
11火炬松DREB1基因的电子克隆与生物信息学分析显示文摘利用来自Forest TreeDB数据库中热胁迫cDNA文库ESTs聚类、拼接组装的Unigene以及基因GO注释,得到了假定的火炬松DREB1基因,全长1 293bp,具有完整的蛋白编码框的cDNA序列。采用DNAMAN软件分析碱基组成、限制酶切位点和重复序列等,结果发现,该序列与其他物种中克隆得到的DREB1具有较高的同源性,初步断定所电子克隆得到的cDNA序列为火炬松DREB1基因(PteaDREB1)。在此基础上,利用网上的公共数据库和相关软件(Antheprot等)对PteaDREB1编码的理化性质和一级结构进行分析,并模拟了其二级结构和三级结构。结果表明,该蛋白为疏水性非球形可溶蛋白,含有295个氨基酸,分子量为32.4kD,等电点为8.22;其二级结构以螺旋和卷曲为主,三级结构具有DREB蛋白家族中典型的结合DNA的AP2结构域。这进一步说明所克隆到的cDNA片断为火炬松DREB1基因。上述研究结果可为PteaDREB1基因下一步的分子克隆、功能鉴定和应用奠定基础,具有一定的现实意义和应用前景。林元震 郭海 黄少伟 刘纯鑫 刘天颐 陈晓阳 2010生物信息学2010,8,1:7
12《林木遗传育种学》实验教学改革初探显示文摘分析了《林木遗传育种学》传统实验教学中存在的问题和不足,就《林木遗传育种学》实验教学改革的必要性、实验教学改革、改革后的效果等方面进行探讨,认为开设综合性实验能充分调动学生的学习积极性、有效提高实习课程的教学质量,并有利于培养学生的综合分析能力、创新意识、团队精神。同时,提出从理论教学课程中分离出实验课,设置综合性实验,形成独立的实践课程,以及将综合性实验与'实习一体化'有机结合的建议。刘纯鑫 刘天颐 黄少伟 林元震 2010安徽农业科学2010,38,31:7
1321世纪我国林业综合型人才培养的探讨显示文摘21世纪是我国林业发展的重要历史时期,也是林业科技事业发展的重要战略机遇期。现代化建设与可持续发展的林业急需高素质的林业综合型专门人才。为此,该文从教育理念的更新、教学体系的改革、创业教育的实践等方面,对21世纪我国林业综合型人才的培养进行了探讨,并提出了相应的措施。该文指出,在新形势、新任务、新要求下,要更新教育理念,将传授知识与培育人才的理念有机结合,改变高校的封闭状态,实现教育资源的共享;要改革教学体系,及时引入、整合科研和教改的成果,选择立体化教材,强化实践教学,注重实验的设计性、综合性、应用性、开放性、创新性,加强实践教学平台的建设;要加强创业教育,不断提高学生的创业意识和能力。林元震 郭海 吴宝娜 刘纯鑫 2008中国林业教育2008,26,4:7
14火炬松热胁迫cDNA文库的EST-SSR预测显示文摘以火炬松热胁迫cDNA文库的EST序列为材料,对EST序列进行聚类、拼接等处理后,再进行EST-SSR标记的预测.结果表明:火炬松热胁迫cDNA文库4 283条EST序列经CAP3拼接后,获得2 062个UniGene,其中934个Contig,1 128个Singletons.对UniGene利用SSRIT在线软件分析得到110条EST-SSR.拼接后的UniGene含有SSR位点的频率为4.32%,SSR在火炬松EST上的分布密度为每14.6 kb出现1个SSR.这些EST重复基元中,二核苷酸重复和三核苷酸重复最多,分别占60.90%和36.36%;四、六核苷酸重复分别占0.91%、2.73%;没有五核苷酸的重复基序.所有的核苷酸重复基元中,二核苷酸AT所占比例最高,约占42.73%;三核苷酸重复中,比例最高的是AAG和AGG,均占7.33%.上述研究结果对于开发火炬松新分子标记与开展分子辅助育种的研究具有一定的指导意义.林元震 郭海 刘纯鑫 黄少伟 陈晓阳 2009华南农业大学学报2009,30,3:7
15澳大利亚湿加松F_2代在广东早期生长表现显示文摘对广东省西江林场、银盏林场、通门林场、浸潭大树墩和龙坪林场等利用澳大利亚昆士兰F2代种子营造的湿加松幼林的生长状况和立地条件进行调查,分析幼林树高、地径或胸径生长与立地条件的关系。结果表明:在高温多雨的广东地区,F2代湿加松具有广泛的适应性。3年生时的树高及胸径分别比同年龄的湿地松大20.26%和27.27%。坡位、坡向、表土层厚度等因素对湿加松幼林的生长起着重要的作用。广东省的地理环境和气候状况适宜湿加松的生长。澳大利亚引进的F2代湿加松在广东省种植后生长情况较好,有着良好的发展前景。刘天颐 薛晓峰 刘纯鑫 黄少伟 2008广东林业科技2008,24,1:6
16用SRAP标记构建松树良种指纹图谱方法的研究显示文摘利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对三种松树各16个样本进行检测,旨在构建三个树种的指纹图谱,为松树品种鉴定提供依据。采用5个引物组合对样本进行了SRAP扩增,在湿加松、火加松和马尾松上分别检测到46、53和44个多态性位点,平均每对引物多态性位点分别为9.2、10.6和8.6个。根据扩增产物的电泳条带进行赋值,把SRAP图谱转换为由1和0组成的数字指纹图谱,仅用2个或3个引物组合就可以把同一树种的不同单株完全鉴别出来,为松树优良品系的鉴定提供了一种可行的方法。杨会肖 刘天颐 罗锐 刘纯鑫 黄少伟 2012广东林业科技2012,28,5:5
17基于单片机的节能灯控制系统设计显示文摘本文主要分析了一种基于单片机的灯光智能控制系统的设计思路,以及相应的硬件组成。灯光智能控制能降低学校图书馆、教室以及一些公共场所的电能的浪费,具有重要的现实意义。黄超 蒲永红 刘纯鑫 李洪阳 2015产业与科技论坛2015,0,3:5
18“林木种苗学与育种学实习一体化”探索显示文摘该文对林学本科专业开设的'林木种苗学与育种学实习一体化'实习课程的实施效果进行了分析和评价,认为'实习一体化'能充分地调动学生学习的积极性、提高实习课程的教学质量,有利于培养学生综合分析问题和解决问题的能力、开拓和创新的意识、合作精神和集体主义精神,并促进学生对专业的了解;同时,能够提高教师分析和解决实际问题的能力。最后,该文针对'实习一体化'实施中存在的问题,提出以科研项目为龙头并将其制度化的措施。刘纯鑫 刘天颐 陈红跃 黄永芳 黄少伟 2007中国林业教育2007,25,5:5
19火炬松优良家系抽梢生长的调查研究显示文摘火炬松年抽梢1~7次,平均抽梢4次,以抽3~5次梢为主,占91.5%;家系间平均抽梢次数无显著差异.但家系×立地存在互作;抽梢次数与树高呈正相关,树高生长随抽梢次数增加而增加。逐步回归分析表明:当年抽高生长因子被选入所有不同抽梢次数的回归方程中,它是左右树高生长的重要因子;年内第3次抽梢长度也是影响树高生长的因子。它们能否充当早期预测指标,有待进一步研究。黄永权 钟伟华 廖文莉 刘纯鑫 黄章平 2006福建林业科技2006,33,4:4
20伞房属四个树种在广东的早期生长表现显示文摘文章分析了引自澳大利亚东部的伞房属4个树种在广东省的早期生长表现。3年生及5年生4个树种生长量的方差分析表明,不同地点、树种及地点与树种的交互作用在树高、胸径、材积生长上均表现出极显著的差异。3年生时,生长表现最好的是斑皮柠檬桉,平均单株材积0.007 191 m3;德庆试点的生长表现是4个试点中最好的,4个树种的平均单株材积为0.015 57 m3。5年生时,生长表现最好的是大叶斑皮桉,平均单株材积0.042 16 m3;德庆试点的生长表现是3个试点中最好的,4个树种的平均单株材积为0.068 89 m3。刘天颐 刘纯鑫 孔凡启 林元震 黄少伟 2009广东林业科技2009,25,1:4
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