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| 1 | 土壤细菌类克隆群落及其结构的生态学特征显示文摘以 1 6S r DNA分析方法为基础 ,获得来自不同土壤环境的细菌克隆群落 ( Cloning community) ,并分析了这些土壤细菌群落结构特征。在不同土壤环境中 ,细菌种类非常丰富 ,但其多样性将受到植被、土壤水分或土壤层次等因子的影响。表层土壤环境中细菌种类最丰富 ,多样性最高 ,且基因型中无明显的优势类群。不同土壤环境间细菌群落的相似性较低 ,表明群落结构以及空间隔离的复杂性。 | 夏北成 Zhou J Tiedje J M | 2001 | 生态学报2001，21，4： | 38 |
| 2 | Antibiotic Resistance Genes in the Human-Impacted Environment:A One Health Perspective显示文摘Antibiotic resistance and its environmental component are gaining more attention as part of combating the growing healthcare crisis. The One Health framework, promulgated by many global health agencies, recognizes that antimicrobial resistance is a truly inter-domain problem in which human health, animal agriculture, and the environment are the core and interrelated components.This prospectus presents the status and issues relevant to the environmental component of antibiotic resistance, namely, the needs for advancing surveillance methodology: the environmental reservoirs and sources of resistance, namely, urban wastewater treatment plants, aquaculture production systems, soil receiving manure and biosolid, and the atmosphere which includes longer range dispersal.Recently, much work has been done describing antibiotic resistance genes in various environments;now quantitative, mechanistic,and hypothesis-driven studies are needed to identify practices that reduce real risks and maintain the effectiveness of our current antibiotics as long as possible. Advanced deployable detection methods for antibiotic resistance in diverse environmental samples are needed in order to provide the surveillance information to identify risks and define barriers that can reduce risks. Also needed are practices that reduce antibiotic use and thereby reduce selection for resistance, as well as practices that limit the dispersal of or destroy antibiotic-resistant bacteria or their resistance genes that are feasible for these varied environmental domains. | James M. TIEDJE WANG Fang Celia M. MANAIA Marko VIRTA SHENG Hongjie MA Liping ZHANG Tong Edward TOPP | 2019 | Pedosphere2019，29，3： | 11 |
| 3 | Soil Organic Carbon in a Changing World显示文摘Soil contains more than three times as much carbon (C) as either the atmosphere or terrestrial vegetation.Soil organic C (SOC) is essentially derived from inputs of plant and animal residues,which are processed by the microbiota (bacteria,archaea,protists,fungi and viruses) that dominates SOC transformation and turnover in complex terrestrial environments.A | JIA Zhongjun Yakov KUZYAKOV David MYROLD James TIEDJE | 2017 | Pedosphere2017，27，5： | 7 |
| 4 | 不同土地利用方式下典型黑土区土壤微生物群落演替规律显示文摘利用先进的分子生态学技术,针对中国科学院海伦农业生态试验站长期定位实验,研究了典型黑土区经过长期(32年)裸地、农田和草地三种土地利用后,土壤微生物区系的演替规律及其环境驱动机制。结果表明:与裸地相比,32年玉米-大豆-小麦轮作种植或自然草地恢复后,土壤有机质含量从52.07 g·kg^(–1)显著增加至54.83 g·kg^(–1)和61.54 g·kg^(–1),增幅分别为8.0%和27.5%,土壤氮磷钾养分有效性也显著增加。同时,每克干燥土壤中微生物丰度从2.25×10^(7)拷贝数增加至8.08×10^(7)拷贝数和1.69×10^(8)拷贝数,分别增加了2.58倍和6.51倍。裸地、农田和草地土壤的优势微生物菌门均为变形菌、酸杆菌和放线菌,其相对丰度均高于19%,且三者无显著差异(P>0.05)。然而,所有检测到的228个微生物属中,高达54个微生物属有显著差异(P<0.05),但绝大多数为相对丰度较低的微生物。分析表明土壤养分含量是微生物群落分异的主要环境驱动力,Granulicella微生物属可作为指示类群评估黑土环境的变化。上述研究结果表明,植被覆盖是土壤微生物群落演替的重要影响因素,未来应深入研究原位条件下黑土微生物的功能及其农业环境意义,为维系土壤养分元素循环和发展可持续农业生态管理模式提供理论参考。 | 胡芳 王芳 韩晓增 许敏 付玉豪 严君 贾仲君 Tiedje James M. 蒋新 | 2022 | 土壤学报2022，59，5： | 7 |
| 5 | Microbial communities biostimulated by ethanol during uranium (VI) bioremediation in contaminated sediment as shown by stable isotope probing显示文摘(啜) 稳定的同位素探查被用来识别乙醇增加在包含在 US 能源部橡树理兹地点从 bioremediation 测试地区收集的二沉积的缩影刺激的微生物, TN,美国。一件样品是高度有乙醇的 bioreduced 当另外一个少些被减少时。有各自的沉积的缩影与标记乙醇并且为啜为 7 孵化了天的 13C 被修改。乙醇很快在伴有硝酸盐和硫酸盐的减小的 24 h 以内被变换成醋酸盐。醋酸盐的累积在远处坚持了 7 d 时期。水的 U 没由于 U 的解吸附作用与减少的沉积在缩影衰退,但是连续地在少些减少的样品衰退。微生物引起的生长和伴随物 < 啜 class= “ a-plus-plus ” > 13 C-DNA 生产被检测乙醇是否是精疲力尽的,丰富的醋酸盐在两个缩影积累了。这在少些减少的样品与 U (VI ) 减小与一致。< 啜 class= “ a-plus-plus ” > 13 从乙醇发源的 C 最终为生长被利用,直接或间接地,由在 7 天孵化以内的主导的微生物引起的社区成员。微生物引起的社区由包括 Desulfovibrio, Sphingomonas, Ferribacterium, Rhodanobacter, Geothrix, Thiobacillus 和其它减少细菌的已知的 denitrifiers,减少硫酸盐的细菌和铁(III ) 主要组成,包括减少细菌 Acidovorax, Anaeromyxobacter, Desulfovibrio, Geobacter 和 Desulfosporosinus 的已知的 U (VI ) 。调查结果建议那乙醇 biostimulates 由首先为硝酸盐,硫酸盐,铁( III )和 U ( VI )用作一个电子施主减少微生物引起的社区的 U ( VI )减小,并且然后为微生物引起的生长为 U ( VI )减小和碳来源作为电子施主工作的醋酸盐。 | Mary Beth LEIGH Wei-Min WU Erick CARDENAS Ondrej UHLIK Sue CARROLL Terry GENTRY Terence L. MARSH Jizhong ZHOU Philip JARDINE Craig S. CRIDDLE James M. TIEDJE | 2015 | Frontiers of Environmental Science & Engineering2015，9，3： | 5 |
| 6 | 土壤中有机肥源抗生素抗性基因环境归趋与风险管理研究进展显示文摘抗生素抗性基因——一类新型污染物,已对人类健康和环境安全构成威胁,如何有效应对日益严峻的耐药性危机已成为一项全球性挑战。有机肥源抗生素抗性基因是土壤抗生素抗性基因的主要来源,而土壤参与并主导不同环境单元中抗生素抗性基因演化的多元交互作用,因此,有必要厘清有机肥源抗生素抗性基因在土壤和其他环境介质中的命运、归趋与风险。本文综述了近年来有机肥源抗生素抗性基因在土壤中的分布特征、环境归趋、人体暴露风险以及风险管理方面的研究进展,并提出建议与展望,以期为有效减轻抗生素抗性基因在环境中的危害,遏制抗生素抗性基因的增殖与传播提供理论依据与决策参考。 | 王芳 豆庆圆 付玉豪 梅芝 相雷雷 刘雨 蒋新 SCHAEFFER Andreas 朱永官 TIEDJE James M | 2022 | 农业环境科学学报2022，41，12： | 4 |
| 7 | 采用流线型浇注系统减少能源消耗显示文摘本项工作的主要目的是利用流线型浇注系统的原理减小浇注系统的质量,提高出品率,从而减少对铁液的需求量,降低熔炼能量消耗。实际铸造生产线上的试验证明,应用流线型浇注系统能减少浇注系统的质量。把垂直分型,每箱3个阀体铸件的浇注系统由传统布置改为流线型布置,浇注系统的质量减少了1.1 kg,即减少了20%。在本项试验中,浇注系统由传统的转变为流线型后同时消除了铸件对热处理的需求,这在铸造车间是巨大的能量节约。此外,流线型浇注系统的球铁阀体铸件浇注试验证明,浇注温度从1 400℃降低到1 300℃,铸件未出现冷隔的危险。这可能是因为流线型浇注系统充型速度快以及扇形内浇道有减速作用。本项目还通过玻璃板前铸型试验对上述问题进行了研究。 | Soren Skov-Hansen Niels Skat Tiedje 申泽骥(翻译) | 2009 | 铸造2009，58，7： | 2 |
| 8 | DNA recovery from soils of diverse composition 显示文摘 | Zhou J Bruns M A Tiedje J M | 1996 | Appl Environ Micro biol1996，62，： | 1 |
| 9 | Denitrification in a tallgrass prairie landscape显示文摘 | Gtoffman P M Rice C W Tiedje J M | 1993 | Ecology1993，74，： | 1 |
| 10 | DNA recovery from soils of diverse composition 显示文摘 | ZHOU J Z BRUNS M A TIEDJE J M | 1996 | Appl Environ Microbiol1996，62，2： | 1 |
| 11 | High levels of endemicity of 3-chlorobenzoate-degrating soil bacteria显示文摘 | FULTHORPE R R RHODES A N TIEDJE J M | 1998 | Applied and Environmental Microbiology1998，64，5： | 1 |
| 12 | DNA recovery from soils of diverse composition显示文摘 | Zhou JZ Bruns MA Tiedje JM | | 0，，2： | 1 |
| 13 | Naive Bayesian classifier for rapid assignment of rRNA sequences into the new bacterial tax- onomy显示文摘 | Wang Q Garrity G M Tiedje J M | 2007 | Appl Environ Mierobiol2007，73，16： | 1 |
| 14 | DNA recovery from soils of diverse composition 显示文摘 | ZHOU J BRUNS M A TIEDJE J M | 1996 | Appl Environ Microbiol1996，62，： | 1 |
| 15 | DNA recovery from soils of diverse composition 显示文摘 | Zhou J Z Bruns M A Tiedje J M | 1996 | Applied and Environmental Microbiology1996，2，2： | 1 |
| 16 | DNA recovery from soils of diverse composition显示文摘 | Zhou J Z Bruns M A Tiedje A M | 1996 | Applied and Environmental Microbiology1996，62，： | 1 |
| 17 | Biogeography and degree of endemicity of fluorescent Pseudomonas strains in soil 显示文摘 | CHO J C TIEDJE J M | 2000 | Applied and Environ-mental Microbiology2000，66，12： | 1 |
| 18 | Microbial reductive dechlorination 显示文摘 | Mohn W M Tiedje J M | 1992 | Microbiol Review1992，56，： | 1 |
| 19 | DNA recovery from soils of diverse composition 显示文摘 | Zhou J Bruns M A Tiedje J M | 1996 | Applied and Environmental Microbi- ology1996，62，2： | 1 |
| 20 | DNA Recovery from soils of di- verse composition 显示文摘 | Zhou JZ Bruns MA Tiedje JM | 1996 | Applied and Environmental Microbiology1996，62，2： | 1 |
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