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| 1 | 中国水稻遗传学研究进展与分子设计育种显示文摘我国是一个农业大国,水稻是保障我国粮食安全和实现农业可持续发展的主粮作物.经过几十年的努力,我国科学家在水稻遗传学和功能基因组学领域取得了瞩目的成就,特别是在水稻复杂农艺性状基因解析方面取得了一系列重要的原创性研究成果,开创了以水稻为模式作物研究复杂性状基因调控网络的新领域.随着水稻功能基因组学的发展,我国科学家率先践行了分子设计育种理念,为培育高产、优质、抗逆、营养高效利用的'绿色超级稻'提供了有效的策略,对于确保我国粮食安全具有重要的意义. | 郭韬 余泓 邱杰 李家洋 韩斌 林鸿宣 | 2019 | 中国科学:生命科学2019，49，10： | 69 |
| 2 | 水稻育种行业创新进展显示文摘水稻是我国最重要的粮食作物,水稻等主要作物的持续稳定生产对保障我国粮食安全和农业可持续发展具有重大的现实和战略意义。近20年来,水稻分子生物学和分子设计育种方面均取得了一系列的重要研究进展,特别是重要功能基因的发现与利用,随着基因组学、计算生物学、系统生物学、合成生物学等新兴学科的发展,不仅为解析生物复杂性状的遗传调控网络带来了机遇,也为育种技术创新奠定了科学基础。本文简要综述与提高水稻产量有关的功能基因研究进展。 | 刘贵富 陈明江 李明 吕慧颖 葛毅强 魏珣 杨维才 | 2018 | 植物遗传资源学报2018，19，3： | 38 |
| 3 | 水稻粒形的遗传研究进展显示文摘粒形不仅是影响水稻产量的要素,还与稻米的外观品质密切相关,是决定稻米品质的重要因素。随着现代遗传学和基因组学相关理论和技术的发展,人们对粒形的遗传研究日趋深入,目前已有数十个控制水稻粒形的基因被克隆。本文概述了水稻粒形遗传研究主要进展,同时也指出了水稻粒形遗传研究中存在的主要问题,分析了粒形遗传研究的前景。 | 杨维丰 詹鹏麟 林少俊 苟亚军 张桂权 王少奎 | 2019 | 华南农业大学学报2019，40，5： | 18 |
| 4 | 水稻品质性状的遗传改良及其关键科学问题显示文摘改善稻米品质是水稻遗传改良及基础研究的重要目标。破解控制稻米重要品质性状形成的调控机制,对稻米品质改良和品种选育具有十分重要的意义。近十多年来,稻米品质功能基因组研究成果为其遗传改良提供了丰富的功能基因、有效的功能性分子标记及良好的改良策略。但是,稻米品质本身由多个性状构成,且各品质性状间、品质与产量性状间、品质与环境间均互相影响,极大地限制了稻米品质的遗传改良。因此,文中提出了未来水稻品质性状基础研究及遗传改良的六个关键科学问题。 | 李一博 赵雷 | 2016 | 生命科学2016，28，10： | 15 |
| 5 | 水稻粒型基因克隆研究进展及育种应用展望显示文摘水稻的育种目标包括高产和优质等。粒型是指籽粒的三维结构,是决定水稻产量的重要因素之一,也是影响稻米品质的重要性状。目前已经克隆了超过60个与水稻粒型相关的基因,但应用于育种的粒型基因尚无完整统计。本文综述了已克隆的水稻粒型基因特别是数量性状基因座的研究进展,归纳总结了可应用于水稻高产及优质分子育种的重要粒型基因的功能标记,介绍了粒型基因的育种应用现状,并对前景作了展望,以期为水稻育种家提供可直接利用的分子育种信息。 | 康艺维 陈玉宇 张迎信 | 2020 | 中国水稻科学2020，34，6： | 13 |
| 6 | 水稻资源芽期和苗期耐盐碱性综合评价及耐盐基因分析显示文摘培育耐盐碱水稻品种是应对全球人口日益增长的重要途径之一。文中以21份耐盐碱性不同的水稻品种(系)为材料,在芽期和苗期设置6个不同盐碱浓度处理,测定了发芽势、发芽率、芽长、根长、根数、芽鲜重和苗鲜总重等指标,以各指标盐害率的平均值作为耐盐碱性的综合评价标准。结果表明随着盐碱浓度的提升,对种子萌发和生长的抑制越明显。在1%NaCl加0.25%NaHCO_(3)溶液处理下,发芽率盐害率变异最大,为0%–89.80%。在所有浓度处理下,各性状指标的盐害率都具有相似的变化趋势。筛选到4份综合耐盐碱能力强(大酒谷、日本晴、魔王谷和02428)和7份弱的种质资源。比较了4份耐盐碱强和3份耐盐碱弱的资源耐盐基因序列:OsHAL3和OsRR22基因在7份材料中没有差异,SKC1和DST基因在耐盐碱强和耐盐碱弱的品种之间有明显的变异。研究结果为进一步挖掘水稻耐盐碱基因和培育耐盐碱水稻新品种提供了种质资源和理论基础。 | 孙平勇 张武汉 舒服 何强 张莉 阳祝红 彭志荣 谢芸 邓华凤 | 2022 | 生物工程学报2022，38，1： | 13 |
| 7 | 水稻品质的遗传与育种改良研究进展显示文摘随着人民生活水平的提高,在追求水稻高产的同时,优质已成为育种家的育种目标和消费者的关注重点。水稻品质包含碾磨品质、外观品质、蒸煮食味品质和营养品质四类指标,本文从水稻品质的遗传与改良两方面展开论述,回顾了水稻品质的遗传与育种改良研究进展,介绍了已克隆的稻米品质相关基因或QTL的功能及其在稻米品质改良中的应用。最后,在此基础上分析了现阶段水稻品质的遗传与改良存在的问题并对未来研究方向作了展望。 | 李然 钱前 高振宇 | 2022 | 生物技术通报2022，38，4： | 12 |
| 8 | 水稻粒形遗传调控研究进展显示文摘粒形影响水稻产量与品质,是受多基因控制的具有较高遗传率的重要农艺性状。目前,许多水稻粒形相关基因已被克隆并进行了功能解析,这些基因大多表现为一因多效,并与其他粒形相关基因共同协调表达,进而构成调控网络。对93个已克隆的水稻粒形相关基因进行了总结,并详细描述了主效粒形调控基因的克隆以及基因间的相互作用,揭示了水稻粒形调控网络,为水稻粒形基因间的互作分析、调控机制的解析以及作物优良育种奠定了重要的理论基础。 | 尉鑫 曾智锋 杨维丰 韩婧 柯善文 | 2019 | 安徽农业科学2019，47，5： | 9 |
| 9 | 辣椒属GRF基因家族全基因组鉴定和表达分析显示文摘生长调节因子(Growth-regulating factor,GRF)是一类植物特异的转录因子,其作用涉及植物的生长发育、胁迫和激素信号响应等各个方面。目前还没有关于辣椒GRF的相关报道。利用BLASTP和隐马科夫模型(HMM)在辣椒属(Capsicum)5个参考基因组数据库鉴定了52个GRF家族成员。通过分析发现辣椒GRF转录因子长度为200~745 aa,分子量23~81 kD,理论等电点5.9~9.5。保守结构域和基序分析发现,大多数辣椒GRFN端具有QLQ和WRC保守结构域,C端至少具有FFD、TQL和GGPL结构域之一;少数GRFN端仅具有WRC结构域,C端缺乏保守序列。系统进化分析发现,辣椒GRF转录因子分为5个群,位于同一群的GRF保守结构域位置、基序组成、基因结构相似,辣椒GRF与番茄GRF具有一一对应的进化关系。转录组数据分析表明,CaGRF8在辣椒果实发育早中期表达量高,CaGRF4在果实发育后期表达量较高;低温、干旱、盐和赤霉素处理后辣椒幼苗CaGRF表达量发生明显变化,CaGRF8受到赤霉素诱导表达量升高,而CaGRF4的表达被赤霉素抑制。 | 赵慧霞 李凤霞 郭瑞 陈禅友 | 2020 | 园艺学报2020，47，11： | 9 |
| 10 | 水稻株型功能基因及其在育种上的应用显示文摘株型是与水稻产量密切相关的重要农艺性状,开展水稻株型功能基因组研究具有重要的现实意义。随着水稻全基因组测序工作的完成,在水稻株型形成的分子机理研究方面取得了一系列重大研究进展。现简要回顾株型的研究历史,分别从株高、叶型、分蘖数目、分蘖角度和穗型方面简要概述在水稻株型形成的分子机理方面取得的研究成果,并简要介绍水稻株型功能基因在育种上的应用情况。 | 梁彦 王永红 | 2016 | 生命科学2016，28，10： | 9 |
| 11 | 水稻氮高效、耐冷基因OsGRF4功能标记的开发及其利用显示文摘通过分子标记辅助选择(molecular marker-assisted selection,MAS)培育氮高效水稻品种是减少氮肥使用量、发展绿色农业和可持续农业的一个重要途经。水稻OsGRF4基因编码生长调节因子蛋白,编码区第487和488碱基由TC变异为AA,导致丝氨酸突变为赖氨酸,使得水稻具有氮高效利用、高产和耐冷的特性。为了提高OsGRF4基因在育种中的选择效率,本研究根据功能SNP(single nucleotide polymorphism)位点设计和筛选出等位基因特异PCR(polymerase chain reaction)功能标记PF+DMR+PR和PF+XMR+PR。利用此功能标记对不同品种(品系)和川大粒/巨穗稻的F2群体进行基因型检测,结合测序分析验证,能准确快速鉴定OsGRF4的纯合显性、纯合隐性和杂合基因型,且具有操作简单、成本低的特点。本研究开发的功能标记为通过MAS方法利用OsGRF4基因培育氮高效、高产和耐冷水稻新品种提供了技术支撑。 | 孙平勇 张武汉 张莉 舒服 何强 彭志荣 邓华凤 | 2021 | 作物学报2021，47，4： | 8 |
| 12 | 水稻产量性状的功能基因及其应用显示文摘水稻产量是一个复杂的农艺性状,由单株有效穗数、每穗实粒数和粒重三要素决定。自参考基因组序列释放之后,水稻产量的遗传基础研究取得较大进展。产量相关基因图位克隆获得重大突破,一大批产量相关的主效QTL得到克隆,产量形成的分子机制正在逐步得到解析。同时,相关基因功能标记的创建大大提高了产量定向改良的效率。现综述水稻产量功能基因组研究进展。 | 黄勇 胡勇 傅向东 邢永忠 | 2016 | 生命科学2016，28，10： | 8 |
| 13 | Disruption of MIR396e and MIR396f improves rice yield under nitrogen-deficient conditions显示文摘The microRNA miR396 directly represses GROWTH-REGULATING FACTORs(OsGRFs)and has been implicated in regulating rice yield and in nitrogen assimilation.Overexpressing the miR396 targets OsGRF4 and OsGRF6 improves rice yield via increased grain size and panicle branching,respectively.Here,we used CRISPR/Cas9 to assess the function of miR396 genes in rice.Knockout of MIR396 ef(MIR396e and MIR396f),but not other isoforms,enhanced both grain size and panicle branching,resulting in increased grain yield.Importantly,under nitrogen-deficient conditions,mir396ef mutants showed an even higher relative increase in grain yield as well as elevated above-ground biomass.Furthermore,we identified OsGRF8 as a new target of miR396,in addition to the known targets OsGRF4 and OsGRF6.Disruption of the miR396-targeting site in OsGRF8 was sufficient to both enlarge grain size and elongate panicles.Our results suggest that rice-seed and panicle development are regulated by miR396ef-GRF4/6/8-GIF1/2/3 modules and that mi R396ef are promising targets of genome editing for breeding environmentally friendly rice varieties that require less nitrogen fertilization. | Jinshan Zhang Zhenyu Zhou Jinjuan Bai Xiaoping Tao Ling Wang Hui Zhang Jian-Kang Zhu | 2020 | National Science Review2020，7，1： | 7 |
| 14 | 农业发展对作物功能基因组研究需求显示文摘作物生命科学研究对我国农业的可持续发展提供了强大的科技支撑,功能基因组研究是作物生命科学研究的核心领域之一。现通过提出我国农业发展中面临的一些主要问题,基于作物功能基因组学特别是水稻功能基因组学的最新研究成果,分析农业发展对作物功能基因组研究的多种需求,包括种质资源创新、重大应用价值基因的克隆和功能解析、基因编辑技术和全基因组分子育种。为了进一步满足农业发展对基因组学研究的需求,我国需要推进功能基因组研究,促进作物育种行业的转型、发掘更多的优异种质资源、培育重大突破的新品种,提升我国种业创新能力,不断增强我国功能基因组学对农业生物技术的贡献力度。 | 胡杰 何予卿 | 2016 | 生命科学2016，28，10： | 6 |
| 15 | 杂交籼稻外观品质性状与食味品质性状典型相关分析显示文摘为了明确稻米外观品质与食味品质的关系,甄选合适的评价指标,为培育外观品质与食味品质综合优良的杂交籼稻品种提供理论参考,以8个不育系与25个恢复系配制的200个杂交籼稻组合为材料,采用简单相关和典型相关分析研究了稻米外观品质性状与食味品质性状的相关关系。结果表明,直链淀粉含量与粒宽、垩白度、垩白粒率呈显著正相关,与长宽比显著负相关;米饭食味综合评分与粒长、长宽比显著正相关,与粒宽显著负相关。典型相关分析得到相关系数达显著水平的两对典型相关变量,累计贡献值为91.329%。在第一对典型变线性组合构成中,U_(1)和V_(1)分别以长宽比、直链淀粉含量的权重较大;在第二对典型变线性组合构成中,U_(2)和V_(2)分别以粒长、食味综合评分的权重较大。 | 刘玮琦 肖丰 曾盖 肖应辉 罗丽华 | 2022 | 中国稻米2022，28，4： | 6 |
| 16 | 水稻主要粒型基因及其遗传调控的研究进展显示文摘水稻粒型是决定产量最重要的因素之一。籽粒大小主要是受遗传因子的严格调控。目前,已经克隆了多个控制水稻籽粒大小的(QTL),这些QTL可以作用在独立的遗传途径,与其他已鉴定的粒型基因一起主要参与蛋白酶体降解、激素和G蛋白介导的信号途径,调节细胞增殖和细胞伸长。本文综述了近年来克隆的主要控制水稻籽粒大小的QTL及其调控的分子机制,为理解粒型的分子遗传基础和水稻遗传改良提供理论依据。 | 涂坦 付洪 | 2016 | 山地农业生物学报2016，35，5： | 6 |
| 17 | 水稻粒型基因研究进展及应用显示文摘水稻(Oryza sativa L.)粒型包含粒长、粒宽和长宽比等一系列农艺性状,是影响水稻稻米品质和产量的重要因素之一。随着功能基因组学和分子标记技术的发展,越来越多的粒型基因逐渐被定位和克隆。本文主要总结了目前已经克隆的与水稻粒型有关的基因:粒长基因有GS3、GL7、GL3.3等;粒宽基因有GW2、GW5、GS5等;长宽比基因有GW7、TGW3、GS2等,各个基因之间的互作关系以及各个粒型基因在生产中的实际应用。同时,指出了水稻粒型基因在进行分子植物育种时出现的问题并针对相应的问题提出解决建议。 | 康雪蒙 马梦影 巩文靓 段海燕 | 2020 | 农学学报2020，10，12： | 5 |
| 18 | 二穗短柄草GRFs基因家族的鉴定及表达模式分析显示文摘GRFs基因家族在植物生长发育及逆境响应中起着重要的调控作用。为了探明二穗短柄草GRFs基因家族的基本特征及其进化关系,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对二穗短柄草GRFs基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明,二穗短柄草GRFs基因家族包括12个家族成员,蛋白质序列长度在238~577个氨基酸之间;序列比对发现二穗短柄草GRFs家族基因包括2个保守的QLQ和WRC结构域及广泛的保守基序;染色体定位发现,12个家族成员在二穗短柄草的5条染色体上呈不均匀分布,bd03号染色体分布最多;系统发育关系比较分析表明,这些GRFs基因家族成员存在4对直系同源基因。RT-qPCR分析表明,全部GRFs基因家族成员在二穗短柄草幼嫩组织中表达量较高,而在根系和衰老组织中表达量较低,外源激素特别是GA3诱导了二穗短柄草大部分GRFs基因家族成员的上调表达,表明GRFs基因家族广泛地参与了二穗短柄草分生组织功能和器官形成的生命进程。本研究结果为二穗短柄草GRFs家族蛋白功能的研究奠定了理论基础。 | 马超 宋鹏 尚申申 杨夏夏 杨金华 韩群威 李记民 冯雅岚 | 2020 | 核农学报2020，34，6： | 5 |
| 19 | 水稻重要农艺性状调控基因及其育种利用研究进展显示文摘水稻是我国三大主要粮食作物之一,也是保证我国口粮绝对安全的必保品种之一,具有极高的生产价值。随着分子标记、转基因等技术的快速发展,越来越多的科研工作者将研究方向聚焦到水稻高产、高抗、营养高效等优异农艺性状基因的克隆和功能鉴定上来,并在此基础上利用分子育种技术对目标性状进行定向改良,以获得综合性状优良的水稻品种。相对于传统杂交育种技术,分子育种技术在水稻中的应用可以打破物种间的生殖隔离,缩短育种时间,使水稻性状的改良更加精准、多样化。综述了水稻营养高效利用、激素、生物胁迫、非生物胁迫、产量与品质等调控基因的最新研究进展,并对未来水稻研究发展方向进行了展望,旨在为我国水稻研究提供有益参考。 | 张海淼 李洋 刘海峰 孔令广 丁新华 | 2020 | 生物技术通报2020，36，12： | 5 |
| 20 | 大粒型水稻材料粒型性状的QTL定位显示文摘研究大粒型水稻材料对粒型相关基因的挖掘具有重要作用,同时也能为水稻超高产育种提供优质的种质资源。本研究以大粒型水稻材料lg1与9311杂交衍生的F2遗传分离群体为对象,分别采用2014年、2015年的粒型数据和2年的联合粒型数据,对控制其粒长、粒宽及粒厚的QTL进行初步定位。结果表明,3种情况下共定位到22个相关QTL,其中5个粒长QTL、9个粒宽QTL、8个粒厚QTL,分布于第1、第2、第3、第4、第5、第8和第11号染色体上。3种情况下均检测到QTL的有3个,即粒长QTL q GL-2-1、粒宽QTL q GW-5-1和粒厚QTL q GT-5-1,3个QTL增效等位基因均来自于亲本lg1;此外,有7个QTL在2014年、2015年和2年的联合数据定位中均被检测到,12个QTL只在1年或2年的联合数据定位中被检测到。q GL-2-1、q GW-2-3和q GT-2-3处于同一标记区间RM5812-RM13174,推测可能受同一粒型基因控制,是新的粒型QTL位点。主效QTL q GL-1-2和q GW-11-1可能是新的控制粒型QTL位点,其余检测到的QTL所在的大部分标记区间已有粒型QTL被定位或克隆。本研究结果为大粒水稻lg1粒型基因的精细定位及克隆奠定了基础。 | 汪欲鹏 王根发 武志峰 王智权 石庆华 潘晓华 吴自明 | 2016 | 核农学报2016，30，12： | 4 |
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