我国HIV-1主要流行株外膜蛋白(env)基因V3~V4区变异及其与生物学特性的关系

查看全文 作　　者：[1]邢辉;[2]梁浩;[1]洪坤学;[1]魏民;[1]赵全壁;[1]冯毅;[1]陈建平;[1]全宇;[1]滕涛;[1]邵一鸣

机构地区：[1]中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,北京100050 索引

出　　处：《中华微生物学和免疫学杂志》索引2005年第25卷第3期,共5页

基　　金：国家杰出青年资金项目 ( 3992 5 0 30 ) ;国家'十五'科技攻关项目 ( 2 0 0 1BA70 5B0 2 ) 摘　　要：目的研究我国HIV 1主要流行毒株亚型的envV3~V4区变异与生物学特性的关系。方法应用nested PCR对 1 57份获自我国 1 2个省份的HIV 1毒株env区序列进行扩增 ,并使用ABI 377型测序仪测序 ,然后应用BLAST、GCG和MEGA等生物学软件或程序对env基因V3~V4区序列进行分析。结果 B′亚型毒株V3顶端四肽存在着 4种类型 :GPGR ( 54% )、GPGQ ( 2 8% )、GPGK( 1 6 % )和GPGA( 2 % ) ,B′/C重组毒株全部为GPGQ( 1 0 0 % ) ,CRF0 1 AE重组毒株呈现GPGQ( 95% )和GPGR( 5% )两种类型 ;B′/C和CRF0 1 AE重组毒株V3~V4区及其临近区域N 糖基化位点比B′亚型毒株N 糖基化位点保守。而B′亚型毒株V3环的净电荷分别显著高于B′/C和CRF0 1 AE毒株 (P <0 .0 1 ) ;根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况的结果显示 :B′亚型毒株有 9.2 6 %可能使用CCR5,7.4 1 %可能使用CXCR4 ,其余 83.33%不能对辅助受体的使用作出预测。所有B′/C重组毒株被预测可能使用CCR5。CRF0 1 AE重组毒株有 90 .4 8%被预测可能使用CCR5,没有被预测为使用CXCR4的序列 ,9.52 %不能作出预测。结论 B′亚型毒株大部分可能为NSI型 ,少部分可能为SI型 ,而B′/C和CRF0 1 AE重组毒株绝大部分为NSI型。我国主要流行株的V3~V4区尤其是V3环的氨基酸? 关键词：生物学特性流行株外膜蛋白基因 NESTED-PCR N-糖基化位点 HIV-1毒株亚型毒株 CXCR4 可能使用 CCR5 辅助受体氨基酸变异 ENU V3环流行毒株方法应用功能限制重组预测序列 GCG I型测序 NS

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