DNA barcoding of the main cultivated yams and selected wild species in the genus Dioscorea

查看全文 作　　者：Gezahegn [1,2]Girma;Charles [2]Spillane;Melaku [1]Gedil

机构地区：[1]International Institute of Tropical Agriculture (IITA), Ibadan, PMB 5320, Nigeria;[2]Genetics and Biotechnology Lab, Plant and AgriBiosciences Research Centre (PABC), School of Natural Sciences, National University of irelandGalway, University Road, Galway, Ireland

出　　处：《Journal of Systematics and Evolution》索引2016年第54卷第3期,共10页

摘　　要：基于词法特点区分薯蓣属植物种类极其困难、不可靠,提出对 breeders 和 genebank 管理者的挑战。分子的试金的开发能基于 DNA barcoding 便于重要 Dioscorea 种类的快速、精确的鉴定。为 Dioscorea 种类鉴定, rbcL 和 matK loci 开发一个 DNA barcoding 系统(在一致并且在联合) ,叶绿体染色体的非编码的 intergenic 分隔符 trnH-psbA,并且原子它的区域为开发候选人 DNA barcodes 用标准被调查。所有 DNA barcoding 序列被估计便于 PCR 扩大,顺序质量和种类差别对待的力量。在调查的标记之中, matK 地点以种类鉴定(63.2%) 表现了很好,除了检测有 0.0196 的吝啬的分叉(SD=0.0209 ) 的高种间的变化。二个编码区域(rbcL + matK ) 的联合决心是最佳(76.2%) DNA barcoding 途径能从 21 种类被定义为 16。当 rbcL 展出了好 PCR 扩大效率和顺序质量时,它的种类差别对待的力量与 47.6% 鉴定是相对差的。同样, trnH-psbA 区域有弱辨别效率仅仅 36.8% 。当更柔韧的 DNA barcoding 系统的开发是进行中的挑战时,我们的结果显示 rbcL + matK 联合能为 Dioscorea 种类鉴定作为多地点 DNA barcode 区域被利用。 关键词：条形码系统 DNA 薯蓣属野生物种山药 RBCL基因分子检测技术 PCR扩增

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