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| 1 | Phytochrome Signaling in Green Arabidopsis Seedlings: Impact Assessment of a Mutually Negative phyB-PIF Feedback Loop显示文摘reversibly 红的(R)/far-red (FR )-light-responsive phytochrome (phy ) photosensory 系统在第一暴露之上在发芽黑暗的幼苗开始 deetiolation 进程到光,和阴影回避过程在充分,在到 vegetational 的暴露之上的 deetiolated 幼苗遮。到驾驶这些回答的 transcriptional 网络的从激活光的光敏电阻器 conformer (Pfr ) 的细胞内部的发信号小径与 bHLH 抄写因素的一个小亚科包含 Pfr 的直接、物理相互作用,称为的交往 Phy 因素(程序信息文件) ,它导致快速的程序信息文件解朊的降级。另外,有在光成年的幼苗的进一步的复杂性的证据, phyBPIF 相互作用由此相互地导致 phyB 降级,在里面一互相否定,反馈环配置。这里,在光成年的幼苗估计这些对抗活动的相对贡献到网 phenotypic 读出,我们检验了 light-shade-induced 的大小和 pentuple phyBpif1pif3pif4pif5 (phyBpifq ) 的 simulated-shade-induced 回答变异、各种各样的多重 pif 变异的联合。数据( 1 )重申 phyB 是占优势不独占,响应延长连续 R 照耀在 deetiolating 幼苗强加胚轴延伸的抑制的光敏电阻器并且( 2 )出现 PIF 四重唱( PIF1 , PIF3 , PIF4 ,并且 PIF5 )保留并且施加一个双能力在这些条件下面调制胚轴延伸由附随地通过内在的transcriptional规章的活动支持房间延伸,并且通过 feedb 减少phyB禁止的能力在暴露阴影的幼苗, immunoblot 分析证明在 Pfr 层次的强加阴影的减小在许多 PIF3 导致增加,并且变异的分析显示 PIF3 行动,到,与 PIF4 和 PIF5 一起支持胚轴延伸的已知的导致阴影的加速。相反地,尽管四倍的 pifq 异种显示清楚地减少了胚轴延伸与相比响应延长色泽野类型, immunoblot 分析不在变异的幼苗在 phyB 层次检测举起与相比在导致阴影的生长时期的多数期间野类型,并且 phyB 层次要用体力地没越过比较的pif变异的联合与生长显型被相关。这些结果建议 phyB 丰富的程序信息文件反馈调整不在在这些下面的支持程序信息文件的、阴影应答的显型的大小调节的 modulating 起一个主导的作用。在成长在下面的幼苗日报 lightdark 周期,在黑暗经期(End-of-Day-FR (EOD-FR ) 治疗) 的开始的 Pfr 的 FR-pulse-induced 移动相对没有 EOD-FR 治疗导致更长的胚轴并且这效果在 pif 变异的联合被稀释的数据表演测试了。这结果同样显示 PIF 四重唱成员能够内在地在光成年的植物支持胚轴房间延伸,独立于 photoactivated-phyB 丰富的程序信息文件反馈调整的效果。 | Pablo Leivar Elena Monte Megan M. Cohn Peter H. Quail | 2012 | Molecular Plant2012，5，3： | 20 |
| 2 | Combinatorial Complexity in a Transcriptionally Centered Signaling Hub in Arabidopsis显示文摘四 Phytochrome (phy ) 的一个亚科交往的 bHLH 抄写因素(程序信息文件) 一起在黑暗成年的幼苗支持 skotomorphogenic 开发。这项活动在暴露之上被颠倒到光,由导致程序信息文件的降级的用光使敏化的 phy 分子,从而触发驾驶转变到 photomorphogenesis 的 transcriptional 变化。程序信息文件冗余地并且部分工作在在这进程的 morphogenic 水平的差别。识别程序信息文件 transcriptional 规定的直接目标染色体宽,我们由 ChIP-seq 分析为所有四个程序信息文件分析了 DNA 有约束力的地点,并且定义每个程序信息文件 transcriptionally 调整的基因,用 pif 异种的 RNA-seq 分析。尽管有在在程序信息文件之间的 DNA-binding-motif 识别的可检测的差别的缺席,数据表演规章的模式的一个系列,从单个程序信息文件优势在所有四等于贡献。同样,倡导者体系结构的一个宽广数组被发现,从单个程序信息文件绑定地点,包含单个顺序主题,通过多重程序信息文件绑定地点,各包含至少一个主题,与一个优先地占据到多重程序信息文件的每个地点。每个程序信息文件导致的倡导者占有和表示水平的定量分析揭示了一个吸引人的模式。尽管越过目标基因人口广泛地没有柔韧的关联,是多重程序信息文件的分享的目标的单个基因的检查在关联显示出一个阶段从强烈积极通过 uncorrelated,到否定。这发现建议 transcriptional 规定的双分层的机制,两个都包括由每个程序信息文件和扮演每个程序信息文件上的差别的本地规定的附加的层的有约束力地点的占有的连续统,到在每个地点调制它的内在的 transcriptional 激活能力,在一个量的模式,那从基因在单个程序信息文件之间变化到基因。这些调查结果为探查有重叠直接目标的基因的抄写因素由集成的机制提供一个框架并且有选择地, transduce 发信号到他们的目标网络。 | Anne Pfeiffer | 2014 | Molecular Plant2014，7，11： | 8 |
| 3 | Phytochrome-regulated Gene Expression显示文摘涉及植物光敏色素(phy ) 的所有基因的鉴定到他们的轻环境的植物的 -mediatedresponses 是在提供调整光的生长和开发的全面理解的一个重要目标。这篇文章在识别了在黑暗成年的幼苗的第一暴露之上对红灯信号很快作出回应,并且测试了功能的关联到这些基因的一个起始的子集的正常 seedlingphotomorphogenesis 的调整 phy 的基因的 thegenome 宽的集合的 Arabidopsis 加亮并且集成二最近的全面研究的中央调查结果。数据:(a)通过不同phy家庭成员(到 phyE 的 phyA )在轻信号的 channeling 揭示可观的复杂性到应答的基因;(b)如果不主要,早作为主要识别多种 transcription-factor-encoding 基因, phy 发信号的目标,并且,因此,作为在thetranscriptional网络层次的潜在地重要的管理者;并且(c) 作为主导的类识别植物生长素相关的基因调整 amongrapidly 的、荷尔蒙相关的基因。然而,这些基因的一个选择子集的颠倒基因的功能的介绍表明仅仅有限部分为导致 optimalphy 的幼苗 deetiolation 是必要的。 | Peter H. Quail | 2007 | Journal of Integrative Plant Biology2007，49，1： | 7 |
| 4 | Pan bread and dry white Chinese noodle quality in Chinese winter wheats显示文摘 | Z.H. He J. Yang Y. Zhang K.J. Quail R.J. Pe?a | 2004 | Euphytica2004，，3： | 2 |
| 5 | Complete genomes of two clinical Staphylococcus aureus strains:evidence for the rapid evolution of virulence and drug resistance显示文摘 | Holden MT Feil EJ Lindsay JA Peacock SJ Day NP Enright MC Foster TJ Moore CE Hurst L Atkin R Barron A Bason N Bentley SD Chillingworth C Chillingworth T Churcher C Clark L Corton C Cronin A Doggett J Dowd L Feltwell T Hance Z Harris B Hauser H Holroyd S Jagels K James KD Lennard N Line A Mayes R Moule S Mungall K Ormond D Quail MA Rabbinowitsch E Rutherford K Sanders M Sharp S Simmonds M Stevens K Whitehead S Barrell BG Spratt BG Parkhill J | 2004 | Proc Natl Acad Sci USA2004，101，26： | 1 |
| 6 | Development of monoclonal antibodies specific for strawberry milo yellow edge potexvirus显示文摘 | Quail AM Martin RR Spiegel S | 1995 | Acta Horticulturae1995，385，： | 1 |
| 7 | Novel phytoehrome sequences in Arabidopsis thaliana : structure, evolution, and differential expression of a plant requlatory photoreceptor family 显示文摘 | Sharrock R A Quail P H | 1989 | Genes Develop1989，3，： | 1 |
| 8 | Deciphering the biology of My cobacterium tuberculosis from the complete genome sequence 显示文摘 | Cole S T Brosch R Parkhill J Gamier T Churcher C Harris D Gordon S V Eiglmeier K Gas S Barry C E Tekaia F Badcock K Basham D Brown D Chillingworth T Cormor R Davies R Devlin K FeltweU T Gentles S Hamlin N Holroyd S Hornsby T Jagels K Kroghs A McLean J Moule S Murphy L Oliver K Osborne J Quail M A Rafandream M A Rogers J Rutter S Seeger K Skelton J Squaraes R Squares S Sulston J E Taylo K Whitehead S Barrell B G | 1998 | Nature1998，393，： | 1 |
| 9 | Binding of phytochrome B to its nuclear signalling partner PIF3 is reversibly induced by light显示文摘 | Ni M Tepperman J M Quail P H | 1999 | Nature1999，400，： | 1 |
| 10 | Objective methods for the quality assessment of northern-style Chinese steamed bread 显示文摘 | Huang S Quail K Moss R | 1995 | Journal o f Cereal Science1995，21，： | 1 |
| 11 | Comparision of the behavior of soluble organic and inorganic nutrients in forest soils显示文摘 | Quails RG | 2000 | Forest Ecology and Management2000，138，： | 1 |
| 12 | Objective methods for the quality assessment of northern -style Chinese steamed bread显示文摘 | Huang S Quail K | 1995 | Journal of Cereal Science1995，21，： | 1 |
| 13 | A genome-wide, endsequenced 129Sv BAC library resource for targeting vector construetion显示文摘 | Adams D J Quail M A Cox T | 2005 | Genomies2005，86，6： | 1 |
| 14 | Physicochemical properties of Australia wheat flours for white salted noodles显示文摘 | Yun S H Quail K | 1996 | Journal of Cereal Science1996，23，： | 1 |
| 15 | A light-switchable gene promoter system显示文摘 | Shimizu-Sato S Huq E Tepperman J M Quail P H | 2002 | Nature biotechnology2002，20，10： | 1 |
| 16 | Embryonic morphogen nodal promotes breast cancer growth and progression 显示文摘 | Quail DF Zhang G Walsh LA | 2012 | PLoS One2012，7，48： | 1 |
| 17 | Objective methods for the quality assessment of northern-style Chinese steamed bread显示文摘 | Huang S Quail K | 1995 | Journal of Cereal Science1995，21，： | 1 |
| 18 | By8,a new class of arabidopsis long hypocotyl mutants deficient in functional phytochrome A显示文摘 | Porks B M Quail P H | 1993 | Plant cell1993，5，： | 1 |
| 19 | Instrumental assess- ments of Japanese white salted noodle quality显示文摘 | Yun S H Rema G Quail K | 1997 | J Sci Food Agric1997，74，： | 1 |
| 20 | Instrumental assessments ofJapanese white salted noodle quality 显示文摘 | Yun S H Rema G Quail K | 1997 | J Sci Food Agric1997，74，： | 1 |
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